AAV-Brain病毒变体
通过AI筛选后的AAV9病毒变体PM167、PM170在C57BL/6J小鼠模型中以较低剂量进行尾静脉注射，数据显示其对各神经相关组织的感染能力强，能高效转导中枢神经系统，同时负靶向肝脏，适用于各类神经疾病的基础和应用研究。
| 组别 | 病毒名称 | 大脑各区域表达能力 | 订购 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 海马 | 皮层 | 胼胝体 | 中脑 | 脊髓 | 肝脏 | |||
| 野生型对照 | AAV9 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |
| 阳性对照 | AAV9.phpeB | 13.2 | 17.3 | 12.8 | 20.2 | 18.7 | 0.16 | |
| 创新型AAV9病毒变体1 | PM167 | 18.5 | 19.2 | 16.4 | 23.2 | 24.4 | 0.25 | |
| 创新型AAV9病毒变体2 | PM170 | 8.6 | 13.2 | 5.9 | 25.3 | 19.7 | 0.14 | |
AAV9病毒变体验证数据
1. 高靶向中枢神经系统
赛业生物搭建的AI平台通过整合大数据、云计算、机器学习等多个技术优化AAV9衣壳蛋白，得到大量的候选变体，结果显示预测的中枢神经系统靶向性数据（图1）可信度高，PearsonR高达0.843。
图1. 中枢神经系统感染效率预测
从AI预测的序列中挑选Top序列进行单个验证，在小鼠体内尾静脉注射（5E11vg/只）后21天检测。活体成像结果显示（图2）Top序列在脑内高度富集，其中PM167脑内表达的Luc信号强度约为PHP.eB的2倍，PM170脑内表达的Luc信号强度约为PHP.eB的1.5倍。
图2. 体内验证大脑感染效率（活体成像, Luc）
为了进一步探究Top序列在中枢神经系统不同区域的分布情况，又在小鼠体内尾静脉注射（5E11vg/只）后21天检测。冰冻切片结果显示（图3）PM167在各个脑区（皮层、胼胝体、海马、中脑）以及脊髓的绿色荧光蛋白信号均显著高于PHP.eB，PM170在胼胝体以外的各个脑区以及脊髓的绿色荧光蛋白信号也均高于PHP.eB。
图3. 体内验证大脑和脊髓感染效率（冰冻切片EGFP）
2. 负靶向肝脏
赛业生物搭建的AI平台通过整合大数据、云计算、机器学习等多个技术优化AAV9衣壳蛋白，得到大量的候选变体，结果显示预测的肝脏靶向性数据（图4）可信度高，PearsonR高达0.884。
图4. 肝脏感染效率预测
从AI预测的序列中挑选Top序列进行单个验证，在小鼠体内尾静脉注射（5E11vg/只）后21天检测。活体成像结果显示（图5）PM167肝脏负靶向性显著优于PHP.eB，PM170肝脏负靶向性显著优于AAV9野生型（WT），略高于PHP.eB。
图5. 体内验证肝脏感染效率（活体成像-Luc）
在小鼠体内尾静脉注射（5E11vg/只）后21天检测，冰冻切片结果显示（图6）PM167在肝脏的绿色荧光蛋白信号显著低于PHP.eB，PM170在肝脏的绿色荧光蛋白信号略高于PHP.eB，但仍显著低于AAV9野生型（WT）。
图6. 体内验证肝脏感染效率（冰冻切片EGFP）
