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Neuro-Oncology
多区域采样揭示胶质母细胞瘤内空间异质性与药物敏感性图谱

2026-09-29
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Neuro-Oncology | 多区域采样揭示胶质母细胞瘤内空间异质性与药物敏感性图谱

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本研究为 胶质母细胞瘤 的精准治疗提供了关键依据,提示在 药物筛选 与 临床前模型 构建中需充分考虑肿瘤核心与浸润边缘的生物学差异。

 

文献概述

本文《Multi-sampling allows intra-tumoral heterogeneity querying and vulnerability profiling in glioblastoma》,发表于《Neuro-Oncology》杂志,系统探讨了胶质母细胞瘤(GBM)在磁共振成像(MRI)定义的增强核心与非增强边缘之间的分子与功能异质性。研究通过多区域采样结合全外显子测序、转录组分析及患者来源的 3D 模型药物测试,首次揭示了不同空间区域的药物敏感性差异,并指出转录组状态比基因组改变更能反映 MRI 增强特征。

背景知识

胶质母细胞瘤(GBM)是成人最致命的脑肿瘤,其治疗失败的主要原因在于极高的 肿瘤异质性。目前临床手术主要切除 MRI 增强的肿瘤核心(cET),而浸润性的非增强边缘(nET)往往被遗留,导致复发。然而,关于 nET 区域的分子特征及其对 靶向药物 的反应知之甚少。现有的 药物研发 策略常基于单一肿瘤样本,忽略了空间异质性带来的治疗盲区。此外,虽然 EGFR、PTEN 等 靶点 在 GBM 中频繁突变,但针对这些靶点的单药治疗在临床中效果不佳。本研究切入点在于利用超最大切除手术获取的多区域样本,结合 BTIC(脑肿瘤起始细胞)和 µCancer(微癌症)模型,解析 cET 与 nET 在基因组、转录组及药物反应上的真实差异,旨在为 个性化医疗 和 临床试验 设计提供新框架。

 

神经疾病模型构建:提供超2000例现货及定制的神经退行性疾病、脑肿瘤基因编辑小鼠模型,涵盖基因敲除、条件性敲除及人源化模型,支持从机制研究到药效评价的全流程服务。

 

研究方法与核心实验

研究团队纳入了 6 名新诊断的 IDH 野生型 GBM 患者,在术中通过 MRI 引导采集了 2 个增强核心(cET)和 2 个非增强边缘(nET)样本。团队利用 全外显子测序(WES)和 RNA-seq 分析了基因突变、拷贝数变异及转录组特征。为了验证功能差异,研究者建立了两种患者来源的 3D 模型:富含干细胞的 BTIC 模型和保留肿瘤生态的 µCancer 模型,并进行了包含 15 种药物的靶向治疗筛选。

关键证据显示,基因组层面(如 EGFR 扩增、PTEN 缺失)在空间上呈现高度异质性,且与 MRI 增强状态无直接关联;相反,转录组层面(如间质型 MES、原神经型 PN)与 MRI 增强状态高度相关。cET 富集细胞外基质重塑和免疫激活程序,而 nET 则富集神经信号和形态发生程序。药物测试结果表明,ERK 抑制剂(ulixertinib)对 cET 更有效,而 PI3K 通路抑制剂(paxalisib)对 nET 更有效。

关键结论与观点

  • cET 核心富集间质型(MES)转录亚型及细胞外基质重塑程序,而 nET 边缘富集原神经型(PN)及神经相关程序,表明转录状态是 MRI 增强特征的生物学基础。
  • 基因组改变(如 EGFR 扩增、CDKN2A 缺失)在空间上呈现高度异质性,且独立于 MRI 增强状态,提示单一活检可能遗漏关键驱动突变。
  • ERK 抑制剂(ulixertinib)在 cET 中显示 preferential 疗效,而 PI3K 通路抑制剂(paxalisib, CC-115)在 nET 中更有效,揭示了空间特异性的 药物敏感性。
  • 泛 Bcl-2 抑制剂(navitoclax)和 BET 抑制剂(trotabresib)在肿瘤全域均表现出强效,且 药物联合 治疗(如 navitoclax + vorinostat)的疗效显著优于单药,能克服空间异质性带来的耐药问题。
  • PDGFRA、KIT 等拷贝数增益可作为 ripretinib 敏感性的生物标志物,为 患者分层 提供了分子依据。

研究意义与展望

该发现对 药物开发 具有重要指导意义,提示未来的 临床试验 设计应纳入多区域采样策略,避免仅基于核心样本筛选药物。对于 临床监测,MRI 增强状态可作为预测转录组亚型和潜在 药物反应 的非侵入性指标。在 疾病建模 方面,研究强调了构建包含肿瘤核心与边缘的复合模型(如 µCancer)的重要性,以更真实地模拟 GBM 的生态微环境,从而提高临床前预测的准确性。

 

肿瘤药效评价服务:提供原位成瘤模型构建、体内药效评估及生物分析,涵盖肿瘤细胞增殖、凋亡、迁移等检测,助力抗肿瘤新药(如靶向药、免疫疗法)的临床前开发与IND申报。

 

结语

本研究通过多尺度、空间整合的分析策略,深刻揭示了 胶质母细胞瘤 内部复杂的异质性图谱。研究证实,cET 与 nET 在转录组程序和药物敏感性上存在显著差异,而基因组改变则更为随机。这一发现打破了传统单一活检的局限性,强调了空间维度在 肿瘤生物学 研究中的核心地位。从实验室到临床转化,该研究为 个性化治疗 提供了坚实的理论基础:即利用 MRI 引导的多区域采样,结合患者来源模型进行药物筛选,特别是采用 药物联合 策略,有望克服 GBM 的耐药性难题。这不仅为 神经肿瘤 领域的 新药研发 指明了方向,也为改善 GBM 患者的预后和生存质量提供了新的希望,是构建精准 疾病照护体系 的重要基石。

 

文献来源:
Diogo Moniz Garcia, Wan-Hsin Lin, Daniel P Wickland, Panos Z Anastasiadis, and Alfredo Quiñones-Hinojosa. Multi-sampling allows intra-tumoral heterogeneity querying and vulnerability profiling in glioblastoma. Neuro-Oncology.