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从 PD-L1 到 STING:KO 细胞模型如何拆解肿瘤免疫逃逸?|赛业生物

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导语:肿瘤免疫研究为什么越来越离不开 KO 细胞模型

肿瘤并不是单纯的“细胞增殖失控”。在肿瘤发生发展过程中,肿瘤细胞会持续与免疫细胞、基质细胞、细胞因子网络以及代谢环境相互作用,逐渐形成有利于自身生存和扩散的肿瘤微环境。

近年来,PD-1/PD-L1 抗体、CTLA-4 抗体等免疫检查点抑制剂推动了肿瘤治疗方式的改变,也让肿瘤免疫成为基础研究、转化医学和药物开发中的核心方向。与此同时,一个现实问题也越来越突出:并不是所有患者都对免疫治疗有响应,部分患者即使初始有效,也可能在治疗过程中出现耐药。

这些差异背后,往往涉及抗原呈递、干扰素信号、免疫检查点表达、先天免疫激活、细胞死亡方式、代谢重编程等多层机制。对于科研人员来说,真正需要回答的问题不是“某个基因是否有变化”,而是“这个基因是否真的决定了免疫逃逸、免疫杀伤或药物响应”。这正是 KO 细胞模型 的应用价值。

KO模型助力肿瘤免疫研究主题封面图
图1 KO 模型助力肿瘤免疫研究主题封面图

更直接的因果验证

从基因层面去除目标变量,帮助判断某个分子是否是免疫逃逸、药物响应或耐药表型的必要因素。

更清晰的实验闭环

可与蛋白检测、共培养杀伤、细胞因子分析和药物处理实验联动,支撑机制研究与项目转化。

一、肿瘤细胞如何“躲过”免疫系统

在正常情况下,免疫系统能够通过抗原呈递和免疫监视机制识别异常细胞。但肿瘤细胞可以通过多种策略降低免疫识别、削弱免疫杀伤,最终获得生存优势。

1. 上调免疫检查点分子,抑制 T 细胞杀伤

PD-L1(CD274)是肿瘤免疫研究中最经典的免疫检查点分子之一。肿瘤细胞上调 PD-L1 后,可与 T 细胞表面的 PD-1 结合,抑制 T 细胞活化和杀伤功能,从而帮助肿瘤细胞逃避免疫攻击。

因此,在 A549、HCT116、MC38、CT26、B16-F10、MDA-MB-231 等肿瘤细胞中构建 CD274/PD-L1 KO 模型,可用于验证 PD-L1 对 T 细胞或 NK 细胞杀伤敏感性的影响,也可用于评估免疫治疗相关机制。若项目希望更快启动前期筛选,也可结合 基因敲除细胞库 先寻找合适的研究起点。

2. 破坏抗原呈递,让免疫系统“看不见”肿瘤

T 细胞识别肿瘤细胞,离不开抗原呈递过程。B2M、HLA-I 等分子异常,会导致肿瘤抗原无法有效呈递,使肿瘤细胞从免疫监视中“隐身”。在免疫治疗耐药研究中,B2M 突变或 HLA-I 表达缺失是非常重要的机制方向。

B2M KO、HLA-A/B/C KO 等模型常用于研究抗原呈递缺陷、T 细胞识别下降以及免疫治疗耐药机制。

3. 调控先天免疫信号,影响干扰素反应

cGAS-STING 通路可以识别胞质 DNA 并诱导 I 型干扰素反应,是连接 DNA 损伤、病毒样免疫反应和抗肿瘤免疫的重要通路。肿瘤细胞中 cGAS、STING 或下游信号节点发生异常,可能影响免疫细胞浸润、细胞因子释放和免疫治疗响应。

CGAS(MB21D1)KO、STING(TMEM173)KO 模型可用于研究 DNA 损伤、放疗、化疗或 STING 激动剂诱导的免疫反应是否依赖该通路。

4. 通过 PVR/TIGIT 等轴增强免疫抑制

除 PD-1/PD-L1 外,PVR(CD155)-TIGIT 轴也是近年来肿瘤免疫研究中的热点。PVR 可与 TIGIT 结合,抑制 T 细胞和 NK 细胞功能。构建 PVR KO 肿瘤细胞模型,有助于评估该通路在免疫抑制、免疫细胞杀伤和联合治疗策略中的作用。

二、为什么需要 KO 细胞模型

在肿瘤免疫研究中,qPCR、WB、流式检测可以告诉我们某个基因或蛋白是否发生变化,药物抑制剂可以帮助观察通路被抑制后的表型。但这些方法往往仍停留在“相关性”层面。

KO 细胞模型的核心优势,是直接从基因层面去除目标变量,从而判断该基因是否是某一免疫表型的必要因素。对于需要同步推进构建、筛选和验证的课题,也可以从 细胞模型定制服务体外检测服务 两个入口协同推进。

研究问题 普通表达/抑制剂实验 KO 模型能回答的问题
PD-L1 是否影响免疫杀伤? 观察 PD-L1 表达变化或抗体阻断结果 敲除 CD274 后,T/NK 细胞杀伤是否增强?
STING 是否介导干扰素反应? 检测 IFN-β、ISG 表达变化 敲除 TMEM173 后,DNA 损伤或 STING 激动剂诱导反应是否消失?
B2M 是否导致免疫逃逸? 检测 HLA-I 表达下降 敲除 B2M 后,抗原呈递和 T 细胞识别是否受影响?
JAK/STAT 是否参与免疫治疗耐药? 检测 IFN-γ 下游信号变化 敲除 JAK1/JAK2 后,PD-L1 诱导和药物响应是否改变?

因此,KO 模型不仅是一个“敲掉基因”的工具,更是帮助研究人员建立因果链条的实验体系。对于机制研究、药物靶点验证、免疫治疗耐药解析以及联合用药策略开发,KO 细胞模型都具有很强的应用价值。

三、肿瘤免疫 KO 模型常见应用场景

  1. 免疫检查点机制研究:构建 CD274/PD-L1 KO、PVR KO 等模型,评估肿瘤细胞对 T 细胞或 NK 细胞杀伤的敏感性变化。
  2. 抗原呈递与免疫逃逸研究:构建 B2M KO、HLA-I KO 模型,研究肿瘤细胞抗原呈递缺陷及 T 细胞识别障碍。
  3. cGAS-STING 先天免疫通路研究:构建 CGAS KO、STING KO、TBK1 KO、IRF3 KO 模型,验证胞质 DNA、放疗或 STING 激动剂诱导的免疫反应机制。
  4. IFN-γ/JAK/STAT 信号与耐药机制研究:构建 JAK1 KO、JAK2 KO、STAT1 KO、IFNGR1 KO 模型,研究 IFN-γ 信号失活、PD-L1 诱导缺陷及免疫治疗耐药。
  5. 免疫细胞共培养实验:将 KO 肿瘤细胞与 T 细胞、NK 细胞或巨噬细胞共培养,检测细胞杀伤、细胞因子释放和免疫抑制表型。
  6. 药物敏感性与联合治疗研究:比较 WT 与 KO 细胞对免疫治疗、靶向药、化疗、STING 激动剂或铁死亡诱导剂的响应差异。

四、哪些基因适合做肿瘤免疫 KO

从研究热点和实验应用角度看,以下几类基因是肿瘤免疫 KO 模型中较常见、也较容易形成实验闭环的方向。若您希望先了解更广范围的现成资源,也可先查看 全基因组敲除细胞库 相关入口。

方向 推荐基因 典型研究用途
免疫检查点 CD274/PD-L1、PVR、LGALS9 免疫抑制配体、T/NK 细胞杀伤、联合免疫治疗
抗原呈递 B2M、HLA-A、HLA-B、HLA-C、TAP1 抗原呈递缺陷、T 细胞识别、免疫逃逸
cGAS-STING CGAS/MB21D1、TMEM173/STING、TBK1、IRF3 胞质 DNA 识别、I 型干扰素、STING 激动剂响应
IFN/JAK/STAT IFNGR1、JAK1、JAK2、STAT1、IRF1 IFN-γ 信号、PD-L1 诱导、免疫治疗耐药
炎症/细胞死亡 NLRP3、GSDMD、CASP1、RIPK3、MLKL 炎症小体、焦亡、坏死性凋亡、免疫原性细胞死亡
铁死亡/氧化应激 GPX4、SLC7A11、ACSL4、FSP1/AIFM2 铁死亡敏感性、药物联用、肿瘤免疫微环境

如果您已有目标基因,但不确定适合哪种细胞背景、是否适合单克隆 KO、需要哪些验证方式,可进一步评估建模路径与实验方案。

五、肿瘤免疫 KO 模型,细胞株怎么选

不同细胞株的物种来源、肿瘤类型、免疫相关背景和实验适配性不同,选择模型时不能只看“能不能敲”,还要看是否能支撑后续功能实验。

细胞株 模型特点 推荐研究方向
A549 人源肺癌细胞,应用广泛,适合机制和药敏实验 PD-L1、STING、JAK/STAT、药物敏感性
HCT116 人源结直肠癌细胞,编辑效率和克隆筛选相对友好 免疫逃逸、DNA 损伤、STING、药敏机制
MC38 小鼠结直肠癌模型,常用于免疫完整小鼠体系 肿瘤免疫、T 细胞杀伤、体内免疫治疗评价
CT26 小鼠结直肠癌模型,适合免疫微环境研究 PD-L1、免疫逃逸、药物联用
B16-F10 小鼠黑色素瘤模型,常用于肿瘤免疫和转移研究 免疫治疗耐药、抗原呈递、T/NK 杀伤
MDA-MB-231 人源三阴性乳腺癌细胞,侵袭性强 免疫逃逸、铁死亡、药物敏感性
Hep-G2 / Huh-7 人源肝癌相关模型,适合肝癌机制研究 PD-L1、STING、炎症与代谢相关通路
LLC / Hepa1-6 小鼠来源肿瘤细胞,适合小鼠免疫体系研究 体内成瘤、免疫微环境、联合治疗

如果研究重点是人源肿瘤细胞本身的通路机制,可优先考虑 A549、HCT116、MDA-MB-231、Hep-G2、Huh-7 等模型;如果后续需要结合免疫完整小鼠开展体内实验,则 MC38、CT26、B16-F10、LLC、Hepa1-6 等小鼠来源肿瘤细胞更具有实验连续性。围绕这些方向,既可以基于现有 基因敲除细胞库 做前期筛选,也可以按项目需求规划定制化 基因敲除细胞系

六、一个完整的 KO 肿瘤免疫实验思路

以 PD-L1/CD274 KO 肿瘤细胞模型为例,一个较完整的实验闭环通常包括:

  • 目标确认:明确研究问题,例如 CD274 是否影响 T/NK 细胞杀伤敏感性。
  • 模型选择:根据肿瘤类型和后续实验选择 A549、HCT116、MC38、CT26、B16-F10 等细胞。
  • KO 构建:设计方案时优先选择功能关键外显子,进行基因编辑。
  • 单克隆筛选:通过测序确认 indel 类型,筛选双等位基因失活克隆。
  • 蛋白验证:通过 WB 或流式检测 PD-L1 蛋白缺失。
  • 功能验证:与 T 细胞或 NK 细胞共培养,检测杀伤比例、细胞因子释放和免疫相关表型。
  • 机制拓展:结合 IFN-γ 刺激、药物处理或 rescue 实验,进一步验证通路关系。

实验设计提醒

肿瘤免疫 KO 模型不建议只停留在“测序阳性”。更理想的交付和使用方式,应同时覆盖基因型、蛋白表达和功能表型。

优先关注基因

PD-L1、PVR、B2M、STING、JAK1/2 等与免疫表型直接相关的基因,更适合纳入完整功能验证闭环。

七、KO 模型构建中的关键技术要点

  • 敲除方案设计要精准:尽量选择功能关键外显子,并综合考虑编辑效率和潜在脱靶风险。
  • 验证不能只看单一层面:建议结合基因测序、mRNA/蛋白检测和功能实验,尤其是免疫相关表型。
  • 单克隆筛选要关注细胞适应性:部分基因敲除后可能影响细胞增殖、存活或克隆形成,需要提前评估筛选难度。
  • 注意通路补偿和细胞背景差异:同一基因在不同肿瘤细胞中的表型可能不同,必要时可结合多细胞株验证。
  • 功能实验要与研究问题匹配:例如 PD-L1/PVR 更适合共培养杀伤实验,STING 更适合干扰素和 ISG 检测,B2M/HLA 更适合抗原呈递相关验证。

八、KO 模型让肿瘤免疫研究从“相关”走向“因果”

肿瘤免疫研究的核心,是解析肿瘤细胞与免疫系统之间的动态博弈。免疫逃逸、治疗耐药、免疫细胞杀伤和药物响应,背后都可能由特定基因或信号通路驱动。

KO 细胞模型通过去除关键基因,为研究人员提供了更直接的因果验证工具。无论是 PD-L1/PVR 介导的免疫抑制,B2M/HLA 相关的抗原呈递缺陷,还是 cGAS-STING、JAK/STAT、铁死亡相关通路,KO 模型都能帮助科研人员更清晰地拆解机制、验证靶点并推进后续药物评价。

肿瘤类型/应用方向 推荐细胞株
肺癌模型 A549、LLC
结直肠癌模型 HCT116、MC38、CT26
黑色素瘤模型 B16-F10
乳腺癌模型 MDA-MB-231
肝癌模型 Hep-G2、Huh-7、Hepa1-6
免疫相关共培养/体内验证 MC38、CT26、B16-F10、LLC

如果您正在开展 PD-L1/CD274、PVR、B2M、STING、JAK/STAT、NLRP3、铁死亡或药物敏感性相关研究,欢迎进一步沟通目标基因和细胞株信息,以便更高效地规划 KO 方案、验证策略和后续功能实验设计。对于需要同步推进构建、筛选和功能验证的项目,也可直接结合 细胞模型定制服务体外检测服务 与相关内容资源一起评估整体路径。

九、咨询与延伸阅读

如果您希望围绕肿瘤免疫 KO 细胞模型、功能验证方案或后续体外检测设计继续推进项目,可优先从以下入口开始。

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延伸阅读:

十、常见问题

1. 肿瘤免疫研究中,哪些基因最适合优先做 KO?

通常可优先从与功能表型直接相关的通路切入,例如 CD274/PD-L1、B2M、TMEM173/STING、JAK1/JAK2、PVR 等。这类基因更容易与免疫杀伤、抗原呈递、干扰素响应或耐药机制形成清晰对应关系。

2. 做 KO 模型时,为什么不能只看测序结果?

对于肿瘤免疫课题,基因型确认只是第一步。更完整的验证通常还需要结合蛋白缺失检测、共培养杀伤实验、细胞因子释放或通路激活读数,才能真正判断目标基因与免疫表型之间的因果关系。

3. 人源细胞和小鼠细胞应该怎么选?

如果重点是解析人源肿瘤细胞本身的机制,常优先考虑 A549、HCT116、MDA-MB-231、Hep-G2、Huh-7 等;如果后续需要衔接免疫完整小鼠体内实验,则 MC38、CT26、B16-F10、LLC、Hepa1-6 等小鼠来源细胞通常更具连续性。

4. KO 细胞模型是否适合做联合用药研究?

适合。KO 模型可以帮助比较 WT 与敲除细胞在免疫治疗、靶向药、化疗、STING 激动剂或铁死亡诱导剂处理下的响应差异,从而更清晰地识别关键通路在联合治疗中的作用。

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