打破抗体人源化评估盲区！赛业生物发布IgScope多分辨率人源性评分AI模型

治疗性抗体的免疫原性风险是药物开发中不可忽视的关卡。传统抗体人源性评分仅输出整条序列的单一分数，高度依赖框架区（FR）信息，容易忽略CDR区潜在的非人源风险。赛业生物在bioRxiv预印本平台上，发表的题为Multi-resolution humanness scoring of antibodies via a region-isolated language model的文章，研究中全新发布IgScope——区域隔离抗体语言模型，实现链-区域-氨基酸残基三级分辨率的人源性评估，解决传统评分只见整体、不见局部的短板，为AI生成抗体、抗体人源化、全人源小鼠平台质控提供全新计算工具。

https://doi.org/10.64898/2026.10.23.761395

抗体药物开发过程中，人源性评分是早期筛选的关键质控步骤，用于评估抗体序列与天然人源抗体的相似度，预判抗药抗体（ADA）产生风险，降低临床免疫原性隐患。目前主流工具如OASis、T20、AbNatiV、HumAb、AntiBERTy等，均输出整条抗体链的单一分数。抗体可变域中框架区FR占比约3/4，序列保守性高。而决定抗原结合的互补决定区CDR是人源化嫁接、AI生成设计的核心区域。传统模型极易出现捷径学习，依靠保守框架区就给出很高的人源性得分，却无法识别CDR环内部隐藏的非人源序列片段。

关键风险点：T细胞识别免疫原性表位识别的是局部短肽，而非整条抗体序列。即便整条链得分优秀，局部CDR存在非人源片段，依然有诱发ADA的风险。AI生成抗体领域该问题尤为突出：很多生成抗体整体人源性分数达标，但CDR环序列严重偏离天然人源库，传统工具无法识别该缺陷。

IgScope是2300万参数从头训练的抗体Transformer编码器，训练数据集包含1.19亿条人、小鼠、骆驼科重链、轻链、VHH纳米抗体序列，创新性引入区域隔离注意力模块，搭配30%比例的嵌合序列增强训练，从模型架构上杜绝拿框架区信息推断CDR人源性的捷径学习问题。

模型一次前向推理即可输出三层结果：

IgScope模型整体架构

将全部框架区token做mask屏蔽，IgScope的CDR识别精度几乎无下降（如图2a, 图3c）。与之对比，主流抗体大模型AntiBERTy屏蔽框架后物种判别AUC-ROC暴跌至0.672（如图3c），证明其判断主要依赖框架区信号。在人源框架上回引入鼠源残基的回复突变测试中，IgScope残基识别准确率达到93.4%，可以精准定位混在人源骨架里的单个非人源氨基酸位点（如图2b）。

图2 多分辨率诊断实验

在完全独立的VDJServer外部测试集上，IgScope物种区分AUC-ROC达0.9997，显著优于Humatch、AntiBERTy、OASis、T20等主流工具（如图3b）。针对69899条合成嵌合嫁接抗体，IgScope的嫁接检测ROC-AUC达到0.9938，可精准识别FR与CDR来源物种不一致的嫁接分子（如图3d,e,f）。

图3 与主流人源性评分工具对比

对217条有临床ADA真实数据的治疗抗体数据集，IgScope链水平得分与临床ADA发生率Pearson相关系数r=-0.567，达到业界最优模型同一梯队水平（如4b）。以ADA>10% 作为二分类阈值，ROC-AUC=0.807，性能优于4种基于HLA-II表位的免疫原性预测工具（如图4e）。同时残基层面指标（最长非人源片段、非人源残基占比）同样与ADA高度相关，佐证局部非人片段是免疫原性重要诱因，不只是整条链相似度（如表格Extended Data Table 2所示）。

图4 IgScope得分与临床ADA相关性

表格 Extended Table 2 IgScope得分与临床ADA相关性

研究团队测评BoltzGen、IgGM、ODesign、RFantibody四种主流抗体生成模型产出的3359条抗体序列。发现AI生成抗体整条链人源性得分高达0.966-0.988（如图5d所示），和天然人源抗体几乎无法区分，但全部模型输出CDR区域得分显著低于天然人源CDR（P<1e-30）（如图5a， b，c所示）。也就是说，如果仅使用传统链水平打分，会放行大量CDR存在非人源隐患的AI设计抗体，而IgScope区域级打分可以精准揪出该缺陷，给AI抗体设计增加一道关键审计关卡。

图5 从头设计抗体在区域层面的人源度特征

赛业生物自研HUGO-Ab系列全人源抗体小鼠（包括HUGO-Mab全人单克隆抗体小鼠、HUGO-Light全人共轻链抗体小鼠和HUGO-Nano chVHH驼化人源纳米抗体小鼠）作为重要的抗体发现工具，设计上可变域整体为人源，但为保障VHH纳米抗体稳定性，FR2区域会特意保留4个骆驼特征氨基酸（FERF四联体，如图6e所示）。

这证明IgScope可以用于人源化小鼠产出序列的精细质控，区分真正人源缺陷和工程设计故意保留的非人源位点，避免误判，为HUGO-Ab系列全人源抗体小鼠产出抗体序列提供计算质控标尺。

图6 人源化小鼠平台可获得人源化可变结构域

论文同时客观阐述模型边界：

未来，IgScope将接入赛业AbSeek^®智能抗体计算平台，一方面用于人源化改造优化、AI生成抗体的风险审计，另一方面结合HUGO-Ab全人源抗体小鼠真实测序数据，打通AI计算预测+动物体内产出的闭环，赋能治疗性抗体早期可开发性筛选，降低后期临床免疫原性失败风险。如果您有IgScope抗体多分辨率人源性打分相关分析需求，欢迎扫码联系我们，我们可以为您提供技术支持与咨询服务。