Allergy
Omics in NSAID-Exacerbated Respiratory Disease: 从转录组到代谢组的全面分析
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本文系统回顾了NSAID-Exacerbated Respiratory Disease（N-ERD）的多组学研究，揭示了上呼吸道和下呼吸道中的分子特征，包括转录组、蛋白质组、代谢组和表观遗传组的改变。研究强调了整合多组学数据的必要性，以推动疾病标志物和治疗靶点的发现。
文献概述
本文《Omics in NSAID-Exacerbated Respiratory Disease: Current Evidence From the Upper and Lower Airways》，发表于《Allergy》杂志，回顾并总结了N-ERD患者上呼吸道和下呼吸道的组学研究，包括转录组、蛋白质组、代谢组和表观遗传组的最新进展。文章进一步探讨了现有研究的局限性，并提出未来整合多组学分析的必要性，以更全面地解析N-ERD的分子机制。
背景知识
N-ERD（NSAID-Exacerbated Respiratory Disease）是一种以哮喘、鼻息肉和非甾体抗炎药（如阿司匹林）敏感为特征的慢性炎症性疾病。其病理机制涉及2型炎症以及花生四烯酸代谢通路的失调。由于鼻息肉和肺组织在疾病中的作用不同，研究需要同时涵盖上下呼吸道以获得全面的分子图谱。然而，目前大多数研究仍单独分析单一区域，且研究设计、对照选择和方法学的异质性限制了跨研究的比较。此外，药物治疗（如糖皮质激素）可能影响组学结果，因此需谨慎控制实验条件。本文强调了标准化框架和多组学整合的必要性，以提高N-ERD研究的可重复性和转化潜力。
研究方法与实验
本文系统回顾了N-ERD相关组学研究，涵盖转录组、蛋白质组、代谢组和表观遗传组。转录组研究主要利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）分析鼻息肉和支气管刷取样本。蛋白质组研究则主要采用质谱技术分析鼻灌洗液和鼻息肉组织。代谢组分析通过质谱和代谢组技术评估鼻液和痰液中的代谢物变化。表观遗传研究则聚焦于DNA甲基化分析，以揭示N-ERD相关基因的调控机制。
关键结论与观点
研究意义与展望
本文强调了整合上下呼吸道多组学数据的重要性，以识别N-ERD特异性的生物标志物和治疗靶点。未来研究应采用标准化实验设计，同时考虑治疗因素的影响，并探索系统性组学（如血液）与局部组学的关联。此外，多组学整合可揭示新的分子机制，推动精准医学在N-ERD中的应用。
结语
本文综述了N-ERD在上呼吸道和下呼吸道的组学研究，强调了转录组、蛋白质组、代谢组和表观遗传组在疾病机制中的潜在作用。尽管已有研究揭示了2型炎症、花生四烯酸代谢和miRNA调控的特征，但研究间异质性、小样本量以及治疗干扰等因素限制了数据的可比性。未来需要统一的多组学框架，整合上下呼吸道数据，并结合系统性组学，以推动N-ERD的分子机制解析和治疗策略开发。此外，数据共享和标准化分析流程将有助于提高研究的稳健性和转化价值。
