Journal of Hematology & Oncology
基于ctDNA甲基化标志物的HCC早期检测新方法

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本文通过多中心研究系统比较了循环肿瘤DNA（ctDNA）突变与甲基化在肝细胞癌（HCC）检测中的表现，发现甲基化模型显著优于突变模型，开发的HCCtect检测方法具有高灵敏度和特异性，适用于高危人群筛查及早期诊断。

 

文献概述

本文《Circulating tumor DNA methylation markers outperform mutation markers for early detection of hepatocellular carcinoma: a multicenter cohort study》，发表于Journal of Hematology & Oncology杂志，回顾并总结了循环肿瘤DNA在肝细胞癌早期检测中的应用。研究系统比较了突变与甲基化标志物在HCC检测中的表现，并进一步开发了一种基于定量甲基化特异性PCR的检测模型，HCCtect，具有良好的临床应用潜力。

背景知识

肝细胞癌（HCC）是全球第三大癌症致死病因，早期诊断困难，缺乏有效筛查手段。目前，甲胎蛋白（AFP）作为传统血清标志物，其灵敏度有限，亟需新型液体活检方法。循环肿瘤DNA（ctDNA）作为cfDNA的一部分，可通过突变或甲基化异常用于癌症检测。已有研究表明突变和甲基化改变均具有诊断潜力，但尚未明确哪种方法更优。此外，下一代测序（NGS）虽灵敏，但成本高、流程复杂，限制其临床应用。因此，开发一种快速、低成本、高灵敏度的检测方法具有重要意义。

 

HCC研究可使用基因敲除小鼠模型，用于探索基因功能及肿瘤发生机制。适用于基础生物学研究、疾病模型构建及药物研发。

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研究方法与实验

本研究采用多阶段策略，在五个医学中心共纳入1965名受试者（629例HCC患者和1336例对照）。研究者对血浆cfDNA进行了平行超深度靶向测序和靶向亚硫酸氢盐测序，比较突变和甲基化模型的诊断性能。随后通过递归特征消除方法筛选25个甲基化标志物，开发MBA-seq（多重PCR亚硫酸氢盐测序）检测流程。进一步筛选出两个基因（OTX1和HIST1H3G）构建HCCtect检测模型，采用qMSP方法进行验证。

关键结论与观点

• 甲基化模型在检测HCC中显著优于突变模型（AUC 0.972 vs 0.820，P < 0.001）
• 甲基化模型在早期HCC中的灵敏度为90.0%，特异性为92.5%，显著优于AFP（P < 0.001）
• MBA-seq在独立测试集中达到86.7%的灵敏度和93.3%的特异性，AUC为0.958
• HCCtect（基于OTX1和HIST1H3G的qMSP检测）在测试集中AUC为0.925，灵敏度78.4%，特异性93.0%
• HCCtect在AFP阴性HCC患者中仍保持较高灵敏度（74.8%），在AFP阴性早期HCC中为80.9%
• 该模型在区分HCC与慢性乙肝或肝硬化患者中表现优异，特异性达93.0%
• 整合AFP并未进一步提升HCCtect的诊断准确性

研究意义与展望

本研究首次系统比较了突变与甲基化标志物在HCC检测中的表现，确立了甲基化标志物的优越性。HCCtect提供了一种低成本、快速、高灵敏度的ctDNA检测方法，适用于高危人群筛查。未来研究应进一步验证该模型在更大规模前瞻性队列中的表现，并评估其在肝移植监测或术后复发检测中的应用潜力。

 

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结语

本研究通过大规模多中心队列分析，系统比较了ctDNA突变与甲基化标志物在HCC早期检测中的性能，结果表明甲基化标志物在灵敏度和特异性方面均显著优于突变检测。HCCtect作为一种新型qMSP检测方法，具备临床可行性，尤其适用于AFP阴性及早期HCC患者。该方法简化了检测流程，降低了成本，具有良好的筛查应用前景，为HCC高危人群的液体活检提供新的临床工具。

 

Dezhen Guo, Ao Huang, Jianlong Sun, Xinrong Yang, and Jian Zhou. The genomic and epigenomic abnormalities of plasma cfDNA as liquid biopsy biomarkers to detect hepatocellular carcinoma: a multicenter cohort study. Journal of Hematology & Oncology.