Immunity
T细胞在血液和扁桃体中的克隆与表型分布

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该研究通过对570万个人类T细胞的单细胞测序，揭示了血液和扁桃体中T细胞克隆分布和表型的显著差异，强调了组织特异性在T细胞免疫研究中的重要性。

 

文献概述
本文《Deep profiling of human T cells defines compartmentalized clones and phenotypic trajectories across blood and tonsils》，发表于Immunity杂志，回顾并总结了血液和扁桃体T细胞的克隆扩展、表型轨迹及组织特异性特征，为疫苗和免疫疗法研究提供了新的视角。

背景知识
T细胞是适应性免疫系统的核心，其T细胞受体（TCR）可识别多种抗原。然而，传统研究多依赖血液样本，仅涵盖人体2%的T细胞，其余98%分布在淋巴组织及非淋巴器官中，如扁桃体、肠道、皮肤等。组织驻留记忆T细胞（TRM）和滤泡辅助T细胞（Tfh）等特殊亚群在血液中极少被检测到，因此，仅依赖血液分析可能遗漏关键免疫信息。此外，慢性病毒感染如EBV和CMV已被证实影响TCR库多样性，而不同组织中这些影响可能因细胞类型和微环境而异。本研究通过配对血液和扁桃体样本，结合单细胞测序技术，深入分析了T细胞在不同组织中的克onal、表型和功能特征。

 

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研究方法与实验
研究团队从10名健康供体中获取血液和扁桃体样本，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和TCR测序，构建了一个包含570万T细胞的多组学图谱（TABLO）。此外，研究还利用免疫类器官模型评估抗原暴露对T细胞克隆动态的影响，并结合抗原特异性分析（如流感、EBV、CMV）探索T细胞在不同组织中的分布和功能差异。

关键结论与观点

• 血液和扁桃体T细胞的克隆共享比例远低于先前估计，仅0.8%-7%。成人中该比例随年龄增长而上升，但总体仍较低。
• 相同TCR克隆在血液和扁桃体中可能呈现不同表型，表明T细胞命运受组织微环境影响。
• 扁桃体中Tfh和CD8 TRM细胞几乎完全局限于组织，而血液中TEM细胞更为常见，显示组织特异性分化特征。
• 抗原特异性T细胞（如流感、EBV）在血液和扁桃体中的分布、表型和克隆性不同，显示组织微环境对免疫优势和克隆扩增的调控。
• 年龄和慢性病毒感染（如EBV、CMV）显著影响血液和扁桃体中T细胞受体库的多样性，尤其在记忆亚群中更为明显。

研究意义与展望
本研究提供了迄今为止最大规模的T细胞多组学图谱（TABLO），为组织特异性免疫研究提供资源。未来研究可进一步探索其他组织（如肺、肠道）中的T细胞特征，同时结合动态免疫应答（如疫苗接种）以揭示T细胞迁移和功能转换机制。此外，临床研究应重视组织来源的免疫信息，以提高疫苗和免疫治疗的评估准确性。

 

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结语
本研究通过深度单细胞测序，揭示了血液与扁桃体T细胞在克隆、表型和功能上的显著差异。这些发现强调了组织特异性分析在评估免疫应答中的必要性，并为疫苗和免疫治疗研究提供了关键参考。仅依赖血液样本可能遗漏组织驻留T细胞的复杂性，影响对真实免疫状态的理解。未来，深入研究其他组织中的T细胞动态及抗原特异性反应将有助于更全面地解析人体免疫生物学。

 

Suhas Sureshchandra, James Henderson, Elizabeth Levendosky, Naresha Saligrama, and Lisa E Wagar. Deep profiling of human T cells defines compartmentalized clones and phenotypic trajectories across blood and tonsils. Immunity.