一般包括以下三种情况：

• 拖尾（弥散）：泳道出现弥散状抹带
• 核酸挂孔：胶孔大量发光，DNA无法跑出胶孔
• 电泳条带弯曲/不规则、歪斜

示例1：拖尾（弥散）

示例2：核酸挂孔示例

示例3：电泳条带弯曲/变形、电泳不在一条直线、marker歪斜

原因1-DNA模板杂质较多、污染；DNA降解

解决措施：更换提取方式重新提取DNA，纯化或稀释DNA模板，降低杂质比例；

原因2-引物设计不佳，有多处结合；序列复杂

解决措施：重设引物；根据序列复杂情况更换合适的酶。

原因3-产物浓度过高，产物未及时电泳

解决措施：稀释PCR产物后再上样或减少上样量；及时电泳，避免扩增产物长时间存放室温或4℃冰箱。

原因4-电泳问题

凝胶质量差、浓度过高/低、不均匀；凝胶加样孔变形、含气泡杂质等；缓冲液陈旧；电泳时间过长；电压过高

解决措施：

• 凝胶浓度：扩增片段长度小于1kb时，选择琼脂糖凝胶浓度为2.5 %的TBE胶；扩增片段大于或等于1 kb时，选择琼脂糖凝胶浓度为1.2 %的TAE胶。
• 凝胶配制：凝胶槽水平摆放；倒胶时沿制胶盘一侧缓慢倒入，避免产生气泡，若已有气泡，可用枪头轻轻赶至边缘，待胶完全冷却再拔梳子；及时清洗制胶器材。
• 电泳缓冲液：电泳之前需要先更换电泳缓冲液，TAE胶使用1×TAE缓冲液，TBE胶使用0.5×TBE缓冲液。
• 缩短电泳时间：一般电泳时间为15 min至40 min，需要根据条带特点进行调整。
• 电泳电压：为200~320 V，根据电泳槽大小进行调整。