示例：污染条带，阴性对照、空白对照出现不符合预期的条带，通常会弱于阳性条带

污染是 PCR 中非常常见的问题，DNA气溶胶会污染试剂、耗材和 DNA样本，污染物也可能来自之前的扩增反应，打开离心管盖时产生气溶胶，造成手套、移液器、实验桌面、门把手、冰箱以及试剂的污染。

产物越小，污染的可能性越高，常发生于<1000bp短片段反应中，典型表现包括：纯合子鉴定为杂合子，野生型鉴定为突变型，没配过Cre的后代鉴定出Cre阳性，所有本应基因型分离的后代都显示为同一基因型。

原因1-体系配制污染

此时阴性对照，空白对照通常均出现污染条带。

解决措施：

• 重复实验排除单次操作因素；
• 酶、水、引物等分装使用，定期更换新试剂；
• 重新合成引物、重设引物、使用特异引物；Cre工具鼠等鉴定尽量避免使用通用引物。

原因2-样品污染

包括剪取样本时清洁不当，DNA提取操作时污染，以及模板使用过程中交叉污染。

解决措施：

• 重新剪取组织样本，每剪完一个样本，剪刀正反面都使用酒精消毒，重新提取DNA样本。

原因3-气溶胶污染

污染频率增高，更换试剂、重提样本无法解决。

解决措施：

• 实验环境的频繁清洁与通风；每次实验前对实验桌面、移液器（过滤枪头）等接触面用酒精、去核酸喷雾进行消毒清洁。

原因4-电泳污染

解决措施：

• 及时更换电泳缓冲液，点样时更换枪头。