iPSC建库需验证细胞的多能性、遗传稳定性、无菌安全性、分化潜能这几类。

1. 多能性相关指标：常见免疫荧光检测OCT4、NANOG，流式检测SSEA4、TRA-1-81；都需要高表达或高阳性率。

2. 遗传稳定性相关指标：

1）STR 鉴定：对起始体细胞和重编程后的 iPSC 分别做 STR 分型，验证 iPSC 的细胞来源一致性。

2）核型分析：检测染色体数目和结构是否正常，避免重编程和培养过程中出现的染色体畸变；

3）基因突变检测：全外显子测序（可选），排除重编程、传代过程中出现的随机突变，尤其适用于临床级 iPSC 建库。

3. 无菌安全性相关指标：无细菌、真菌、支原体污染。

4. 分化潜能相关指标：分别诱导iPSC往内、中、外三胚层分化，通过免疫荧光验证各胚层特异性标志物表达；畸胎瘤形成实验（可选），体内成瘤实验验证 iPSC 能形成包含三胚层组织的畸胎瘤。