按报告基因的分子类型与检测原理分类：

1、荧光蛋白类

特点： 无需底物，直接激发荧光，适合活细胞实时成像。常见类型：GFP（绿色荧光蛋白） 及其衍生变体（eGFP, mWasabi）。RFP（红色荧光蛋白） 如mCherry, tdTomato, DsRed。

2、酶类发光/显色报告基因

萤火虫荧光素酶（Firefly Luciferase, FLuc）；

海肾荧光素酶（Renilla Luciferase, RLuc）；

β-半乳糖苷酶（LacZ）；

分泌型碱性磷酸酶（SEAP）；

氯霉素乙酰转移酶（CAT）。

根据报告基因如何响应生物学信号进行划分：

(1)NF-κB（响应元件：κB site）

(2)Wnt/β-catenin（响应元件：TCF/LEF）

(3)STAT（干扰素激活序列GAS）

(4)Hedgehog（Gli结合位点）

(5)NFAT（NFAT响应元件）