干扰载体可应用于广谱型敲低和特异性敲低，前者的shRNA常用的pol III型启动子有U6和H1，该shRNA的表达效率高，预计效果好，但无组织特异性。如果想实现特定组织中的基因沉默，少不了组织特异性启动子的助力。基于miRNA骨架的shRNA干扰载体，采用了pol II型启动子(多种组织特异性启动子均属于pol II型启动子)驱动，从而实现特定组织中的基因沉默。目前用于干扰作用的miRNA骨架(如miR30、miR155、miR17-92等)中，最常用的就是miR30结构。