目前，市面上出售的重组AAV病毒的载体骨架都是来源于AAV2型，俗称基因型，AAV血清型则是指包裹AAV基因组的蛋白质外壳，也就是病毒衣壳蛋白，由Cap基因编码的VP1、VP2和VP3蛋白组装而成，这也是病毒识别和结合细胞表面受体的关键。因此，不同血清型之间的区别就在于衣壳蛋白的氨基酸序列和空间结构的差异，进而使得不同血清型对特定组织或细胞具有不同的嗜性。