转基因小鼠名字的基因符号一般由以下六个部分组成:
1. 品系背景:由实验鼠的品系全名加上实验室代码表示。
2. 转基因技术:Tg表示转基因(transgene)。
3. DNA的插入方式:H代表同源重组;R代表经逆转录病毒载体感染的插入;N代表非同源插入。
4. 被修饰的基因符号:转入的基因放在圆括号中,不用斜体,因为它们是外来DNA材料的随机插入,并且不是天然基因组的一部分。
5. 实验室指定编号:实验室对已成功的转基因品系给予的特定编号。
6. 实验室注册代码:标识生产或维持特定动物品系的研究所、实验室或研究者。
基因定点修饰小鼠的命
完整的基因定点修饰小鼠的名字格式:
基因定点修饰小鼠名字的基因符号一般由以下几个部分组成:
1. 品系背景:如果是在单一的小鼠背景上完成的基因修饰,并且在繁育过程中未引入其他品系,由实验鼠的品系全名加上实验室代码表示。
2. 被定点修饰的基因(斜体):用基因符号表示,需要斜体。
3. 基因修饰技术(斜体,上标):利用ES打靶技术构建的小鼠,用tm(targeted mutation)表示;核酸内切酶系统(CRISPR/Cas或TALEN)介导的基因修饰,用em(endonuclease-mediated mutation)表示。
4. 编号(斜体,上标):原创实验室序列号,位于修饰技术后。
例如:Trp53tm1/Cya表示在Cya实验室对Trp53基因进行的第一次突变。tm1.1或em1.1是指条件性基因敲除(CKO)小鼠在与重组酶工具鼠交配后获得的子代小鼠品系,亲本与基因敲除小鼠命名一样,条件性基因敲除小鼠(flox小鼠)与Cre工具鼠交配产生的后代在亲本名字的序列号后加一个小数点和数字。
5. 修饰方式(斜体,上标):d代表deletion,in代表insert,d或in后面的数字代表敲除或者敲入片段的大小。注:用“flox”表示条件性敲除。
6. 插入基因(斜体,上标):基因敲入小鼠需要标出转入基因,放圆括号中,基因敲除小鼠则没有这个部分。
基因敲入需要在括号内写出插入的外源基因。例如:CD19tm1(cre)/Cya表示Cya实验室敲入了带有CD19启动子的Cre基因。如果敲入的是RNAi,那么把RNAi针对的靶点写进括号中。例如:Genetm#(RNAi:Il23a)/Cya。
7. 实验室注册代码:标识生产或维持特定动物品系的研究所、实验室或研究者。