根据PCR条带大小来确定，一般1kb以内用2.0~2.5%的TBE胶（ 0.5×TBE 缓冲液来配置）；1kb以上用1.0~1.2%的TAE胶（ 1×TAE 缓冲液来配置）。

• 5×TBE缓冲液母液的配制

1. 分别用电子天平称取下列物品放入烧杯中。

2. 加800 mL ddH₂O使试剂溶解，倒入2L瓶中，定容至2 L。

3. 使用时稀释十倍成0.5×TBE。

• 50×TAE缓冲液母液的配制

1. 称量Tris 484 g，Na₂EDTA·2H₂O 74.4 g于2 L烧杯中。

2. 向烧杯中加入ddH₂O约1500 mL，充分搅拌溶解。

3. 加入114.2 mL的冰乙酸，充分搅拌。

4. 用ddH₂O定容至2L后，室温保存，待用。

5. 使用时稀释50倍，即1×TAE。