基因编辑细胞株是研究感染性疾病机制的核心工具，可用于阐明病原体入侵、宿主免疫应答及耐药性产生等过程。通过敲除（KO）、敲入（KI）或引入点突变（PM）等技术对关键基因进行定向改造，能够构建高度可控且可重复的研究模型，从而揭示这些机制间的因果关系。

其应用流程与策略主要包含以下四点：

（1）靶点选择与引导分子设计：首先明确需编辑的宿主基因（如免疫调控基因、病原体受体基因）或病原体序列（如病毒复制必需基因），通过专业生物信息学工具（如CRISPOR、CHOPCHOP等）设计并筛选具有高特异性、高编辑效率且脱靶风险低的引导分子。

（2）细胞选择与递送策略：

基础机制研究：可选择易于转染、编辑效率高的细胞系，如HEK293或HeLa细胞。为提升实验的生理相关性，建议采用更接近病原体天然感染场所的细胞系，例如A549（人肺上皮细胞，适用于呼吸道病毒研究）或Huh-7（人肝癌细胞，适用于肝炎病毒研究）。

疗法开发研究：若旨在开发细胞疗法或功能性治愈策略，应优先选用患者自体细胞，如造血干细胞（HSCs，适用于造血系统感染或免疫重建）或T细胞（如CD4⁺ T细胞用于HIV治疗）。这类细胞回输后可在体内长期存活并发挥功能，且免疫排斥风险较低。

（3）基因编辑：利用RNP法（核糖核蛋白复合物）进行递送，以实现基因敲除、点突变或精准插入，减少脱靶风险和细胞毒性。

（4）编辑细胞的筛选与扩增：通过分子检测（如PCR、测序）验证编辑效率及脱靶效应，并筛选出基因型与表型均符合预期的单克隆细胞株进行后续扩增和使用。