在目前已建立的IBD小鼠模型中，CD4⁺CD45RB^high T细胞移植至Rag⁻^/⁻小鼠模型和IL-10基因敲除小鼠模型，因其能够模拟慢性病程、T细胞介导的免疫反应、以及与微生物互作相关的免疫失调，在机制上更接近临床Crohn病（CD）的发病过程。因此，从免疫病理学的相似性和机制研究的角度看，这两类模型的临床相关性高于TNBS和DSS等化学诱导模型。

然而，在实际的临床前药物筛选和评价中，DSS和TNBS诱导的IBD模型仍然使用最为广泛，这是由于它们具有建模周期短、操作简便、重复性强、成本低等优势，特别适用于初筛阶段对候选药物治疗效果进行快速评估。DSS模型更常用于模拟溃疡性结肠炎（UC）的急性上皮屏障破坏过程，而TNBS模型则在一定程度上反映了CD中Th1/Th17驱动的免疫炎症反应。