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KO细胞的策略有哪些?我们的优势是什么?

一、KO细胞的策略
基因敲除(KO)细胞的构建主要有两种策略:移码敲除和片段敲除(含单个外显子敲除)。以下是这两种策略的具体介绍:


移码敲除:选择一条引导分子在编码基因的外显子上切割产生DSB(双链断裂),通过NHEJ非同源性末端修复导形成非3倍数的插入或者缺失,则会造成蛋白翻译时的读码框移码(Framshift),不再产生完整的蛋白。


片段敲除:选择一对引导分子同时作用造成两个DSB时,NHEJ修复不仅可造成染色体DNA片段缺失,同时也可能造成缺失后的蛋白读码框移码。小片段敲除除了要考虑敲除的片段区域之外,也要考虑敲除的区域能否引起移码突变。

 


二、我们的优势
在评估两种策略均能取得不错KO效果的情况下,我们会优先选择移码敲除的方式,因为相比片段敲除,移码敲除具有更高的效率,可以让客户更快地拿到KO细胞。当然,如果客户坚持使用片段敲除,我们也可以满足需求。

 

对于移码敲除策略,我们的具体操作流程和优势如下:

• 多条引导分子设计:我们会设计3条引导分子分别转染细胞,以确保有足够的选择余地。

• 切割效率检测:在细胞池(cell pool)阶段,通过测序检测每条引导分子的切割效率,选择效率最高的一条引导分子进行后续实验。

• 确保敲除效果:通过优化引导分子设计和实验流程,确保基因敲除的效果和细胞株的稳定性。

 

此外,我们还提供以下增值服务:

• Western Blot验证:通过Western Blot检测目标蛋白的表达水平,确保基因敲除效果。

• 功能实验:设计并执行功能实验,如细胞增殖、迁移、侵袭等实验,验证基因敲除对细胞功能的影响。

• 个性化服务:根据客户的具体需求,提供定制化的基因编辑方案和技术支持。

 

通过以上策略和优势,我们能够为客户提供高效、可靠的基因敲除细胞株构建服务,满足不同研究和应用需求。

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