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Nature Immunology
皮肤组织中人源调节性T细胞的DNA低甲基化特征及其循环血液对应细胞的鉴定

2025-08-03

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该研究揭示了人源皮肤调节性T细胞(Treg)的DNA低甲基化特征,并发现血液中CCR8+ Treg细胞是皮肤Treg细胞的循环对应群体,为Treg细胞在组织适应中的功能研究和靶向免疫治疗提供了重要参考。

 

文献概述
本文《DNA hypomethylation traits define human regulatory T cells in cutaneous tissue and identify their blood recirculating counterparts》,发表于Nature Immunology杂志,回顾并总结了人源调节性T细胞在皮肤组织中的表观遗传特征及其与血液中CCR8+ Treg细胞的关系,研究通过整合DNA甲基化、染色质可及性和基因表达数据,揭示了皮肤Treg细胞的多组学适应程序,并验证了血液中CCR8+ Treg细胞作为其循环群体的身份。文章还发现皮肤Treg细胞与脂肪Treg细胞具有高度相似的表观特征,提示可能存在保守的组织适应机制。

背景知识
调节性T细胞(Treg)在维持免疫稳态、防止过度免疫反应中起核心作用。在非淋巴组织如皮肤、肠道、肺中,Treg细胞表现出组织特异性表型,参与局部免疫调节及组织修复。传统上,Treg细胞的研究多集中在血液或淋巴组织中,而其在组织中的表观遗传特征及适应机制尚不清晰。近年来,CCR8被识别为Treg细胞在多种非肿瘤组织中的主要标志物,同时也是肿瘤免疫治疗的靶点之一。尽管已有多个临床试验靶向CCR8+ Treg细胞以增强抗肿瘤免疫,但这一策略可能同时影响健康组织中的Treg细胞,进而引发副作用。因此,研究皮肤及循环Treg细胞的表观特征,不仅有助于理解其功能可塑性,也为免疫治疗提供更精确的靶向依据。

 

提供多种代谢相关疾病的小鼠模型,包括基因敲除、基因敲入和饮食诱导型模型,适用于肥胖、糖尿病、非酒精性脂肪肝等研究。

 

研究方法与实验
本研究通过全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)分析皮肤与血液来源的Treg及Tconv细胞的DNA甲基化状态,并整合单细胞ATAC测序与RNA测序数据,构建多组学框架。通过比较不同细胞类型的甲基化差异区域(DMRs)、染色质可及性变化及基因表达谱,研究人员识别了皮肤Treg细胞特异性的低甲基化程序,并进一步评估其与血液中CCR8+ Treg细胞的相似性。此外,通过CRISPRa激活系统,验证特定低甲基化区域对基因表达的调控潜力,并利用动物实验追踪皮肤Treg细胞的循环能力。

关键结论与观点

  • 皮肤Treg细胞与血液中CCR8+ Treg细胞共享广泛的低甲基化区域,且这些区域多与增强子功能相关,提示其具有调控组织适应基因的潜力。
  • 低甲基化区域富集bZIP和bHLH类转录因子结合位点,如BATF、Jun、c-Myc、USF1等,这些因子在皮肤Treg细胞中表达上调,且其结合位点在低甲基化区域显著富集。
  • CRISPRa实验证实低甲基化区域对MLPH和GNA11基因表达具有增强作用,支持其作为功能性调控元件的假说。
  • 血液中CCR8+ Treg细胞在甲基化模式上与皮肤Treg细胞高度相似,但在染色质可及性及基因表达方面存在逆转变化,提示其可能为皮肤Treg细胞的循环群体。
  • 皮肤Treg细胞与脂肪Treg细胞在DNA甲基化和基因表达上高度一致,提示人源Treg细胞在不同非淋巴组织中可能存在保守的适应程序。

研究意义与展望
本研究系统解析了皮肤Treg细胞的表观遗传特征,并揭示其在血液中存在循环对应群体。这一发现不仅有助于更精确地靶向Treg细胞在肿瘤免疫治疗中的功能,也为研究组织特异性免疫调节提供分子基础。未来可进一步探索这些低甲基化区域在组织修复、免疫耐受中的功能机制,并评估其在其他非淋巴组织中的保守性,以推动Treg细胞定向调控的转化研究。

 

提供多种自身免疫疾病的小鼠模型,包括炎症性肠病、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等,支持药效评价与机制研究。

 

结语
本研究系统解析了皮肤中人源调节性T细胞的DNA低甲基化特征,发现其与血液中CCR8+ Treg细胞共享大量表观信号,提示后者可能为皮肤Treg细胞的循环群体。通过多组学整合分析,研究团队识别了多个与组织适应相关的转录因子及其调控网络,并利用CRISPRa技术验证其功能活性。这些发现不仅加深了对Treg细胞组织适应机制的理解,也为开发更精准的免疫治疗策略提供了分子靶点。未来,可进一步探索这些表观特征在其他组织中的保守性及其在免疫稳态维持中的作用,为疾病干预提供新思路。

 

文献来源:
Niklas Beumer, Charles D Imbusch, Tamara Kaufmann, Michael Delacher, and Markus Feuerer. DNA hypomethylation traits define human regulatory T cells in cutaneous tissue and identify their blood recirculating counterparts. Nature Immunology.
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