Allergy
birch pollen allergy患者allergen-specific immunotherapy后的基因组范围血液DNA甲基化谱研究
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本研究首次采用纵向设计，系统分析过敏原免疫治疗（AIT）对birch pollen allergy患者基因组范围DNA甲基化的影响，发现GCNT2和ABRA基因的hypermethylation现象，并与血清生物标志物如sIgG4、IgG4/IgG1 ratio等显著相关，为未来基于表观遗传调控的免疫治疗监测提供新思路。
文献概述
本文《Allergen-Specific Immunotherapy and Biologics: Genome-Wide Blood DNA Methylation Profiling in Birch Pollen Allergic Patients Undergoing Allergen-Specific Immunotherapy》，发表于《Allergy》杂志，回顾并总结了birch pollen allergy患者接受allergen-specific immunotherapy（AIT）前后血液样本的DNA甲基化变化。研究采用Illumina Infinium MethylationEPICv1芯片对16名AIT患者与15名安慰剂对照患者进行配对样本分析，发现GCNT2和ABRA基因的特定CpG位点发生hypermethylation，并进一步验证其调控功能，为AIT诱导免疫耐受的表观遗传机制提供新证据。
背景知识
birch pollen allergy是欧洲常见过敏性疾病，其治疗主要依赖于AIT诱导免疫耐受。尽管已有大量关于过敏性疾病遗传和表观遗传学研究，但此前尚无关于AIT对DNA甲基化影响的纵向研究。DNA甲基化是表观遗传修饰的重要机制，调控基因表达且受环境因素影响，因此其变化可能反映治疗响应。本研究填补了该领域空白，通过配对样本设计，结合细胞类型组成分析和血清生物标志物，深入探讨AIT诱导的DNA甲基化变化，为过敏免疫治疗的分子监测提供新方向。
研究方法与实验
研究采用随机、安慰剂对照的皮下过敏原免疫治疗（BPE-SCIT）临床试验，16名birch pollen过敏患者接受BPE-SCIT，15名患者接受安慰剂治疗。全血样本在治疗前（pre-treatment）和治疗6个月后（post-treatment）收集，DNA经亚硫酸氢盐转化后进行850K CpG位点的甲基化分析。通过hierarchical clustering、PCA和UMAP进行数据降维与可视化，筛选出显著差异甲基化位点（DMPs），并结合血清生物标志物进行Spearman相关性分析。进一步通过luciferase reporter assay验证DMPs的启动子与增强子功能，并利用HiC数据预测染色质互作网络。
关键结论与观点
研究意义与展望
本研究为首次纵向分析AIT对DNA甲olylation影响的报告，揭示GCNT2和ABRA作为AIT治疗响应的潜在表观遗传标志物。未来需更大样本、更长随访时间以确认这些发现，并结合单细胞测序等手段进一步解析甲基化变化的细胞特异性。此外，这些位点可能作为非侵入性生物标志物，用于监测和优化AIT治疗方案。
结语
本研究首次揭示了birch pollen allergy患者在接受allergen-specific immunotherapy（AIT）后，其血液DNA甲基化图谱发生显著变化。两个基因GCNT2和ABRA在AIT后呈现hypermethylation，并具有methylation-dependent的启动子和增强子活性。这些变化与免疫细胞比例（CD8+ T细胞增加，NK细胞减少）及血清生物标志物（如sIgG4、IgG4/IgG1 ratio）高度相关，提示DNA甲基化变化可能作为AIT疗效监测的新指标。尽管样本量较小，但研究设计严谨，为未来探索表观遗传调控在过敏免疫治疗中的应用提供了坚实基础。后续研究可结合单细胞测序、蛋白表达分析及更大队列的验证，以进一步阐明AIT诱导的表观遗传变化及其在免疫耐受中的作用。
