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Molecular Cancer
单细胞多组学技术在肿瘤免疫治疗中的应用:从肿瘤异质性到个体化治疗

2025-08-29

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本文系统综述了单细胞多组学技术在肿瘤免疫治疗领域的最新进展,重点探讨了其在解析肿瘤异质性、肿瘤微环境、耐药机制和新抗原发现中的应用。这些技术为个体化免疫治疗提供了前所未有的分子和细胞分辨率,有望推动精准肿瘤医学的范式转变。

 

文献概述
本文《Single-cell multi-omics in cancer immunotherapy: from tumor heterogeneity to personalized precision treatment》发表于《Molecular Cancer》杂志,系统回顾了近年来单细胞多组学技术在肿瘤免疫治疗中的应用,包括其在解析肿瘤异质性、免疫逃逸机制、微环境互作以及新抗原发现等方面的作用。文章还讨论了当前技术局限性和未来发展方向,强调了整合多组学数据对构建个体化治疗策略的重要性。

背景知识
肿瘤免疫治疗近年来取得了显著进展,但患者间和肿瘤内异质性仍是疗效个体差异和耐药性的主要障碍。单细胞测序技术使研究者能够以高分辨率解析肿瘤细胞、免疫细胞及基质细胞的分子特征,识别罕见亚克隆、动态细胞状态和关键信号通路变化。这些技术包括单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞DNA测序(scDNA-seq)、染色质可及性分析(scATAC-seq)、蛋白组分析(如质谱流式)及空间组学技术,它们共同推动了对肿瘤微环境(TME)复杂性的深入理解。尽管已有多种技术平台如10x Genomics Chromium X和BD Rhapsody HT-Xpress,但整合多组学数据仍面临分析复杂性和技术成本的挑战。本文重点分析了这些技术在肿瘤进化、免疫逃逸、微环境信号通路、耐药机制和治疗监测中的应用,并强调其在临床转化中的潜力。

 

提供多种单细胞测序相关疾病模型与基因编辑工具,包括全基因组人源化、免疫系统人源化、自发肿瘤模型等,适用于肿瘤微环境、免疫治疗机制及药物靶点验证研究。

 

研究方法与实验
文章系统总结了多种单细胞分离技术,包括显微操作、激光捕获显微切割(LCM)、荧光激活细胞分选(FACS)、磁珠分选(MACS)和微流控芯片技术。这些方法适用于不同组织类型和实验需求,例如LCM适合保留组织空间信息,FACS和MACS用于高效富集特定细胞群体,而微流控平台则提供高通量、高灵敏度的单细胞分析能力。此外,文章回顾了多种单细胞组学测序方法,如scRNA-seq、scDNA-seq、scATAC-seq、单细胞质谱流式(CyTOF)及空间转录组技术(如Stereo-seq和Visium),并讨论了其在解析肿瘤异质性、克隆进化、免疫浸润和信号通路变化中的应用。

关键结论与观点

  • 单细胞多组学技术显著提升了对肿瘤微环境中细胞异质性和功能状态的解析能力,揭示了肿瘤免疫逃逸和耐药性的分子机制。
  • 整合基因组、转录组、表观组和蛋白组数据,可全面重建肿瘤进化轨迹和细胞间通讯网络,为个体化治疗提供理论基础。
  • 空间组学技术(如Stereo-seq)能够保留组织微环境的空间信息,推动对肿瘤微环境(TME)中细胞定位和功能关系的研究。
  • 单细胞测序在免疫治疗中已成功识别与PD-1耐药、T细胞耗竭、肿瘤相关巨噬细胞功能相关的细胞亚群,为治疗策略优化提供依据。
  • 尽管单细胞技术在临床前研究中已广泛应用,但其高成本、技术复杂性和数据整合难度仍是临床转化的主要障碍。

研究意义与展望
本文强调单细胞多组学技术在肿瘤免疫治疗中的核心作用,特别是在个性化治疗和动态疾病监测中的应用。未来,通过技术创新与生物信息学工具的整合,这些技术有望成为精准肿瘤学的基石,推动从群体医学向个体化治疗的转变。此外,结合人工智能和机器学习的多组学分析平台将进一步提高数据挖掘效率,为临床决策提供实时支持。

 

提供高通量单细胞分离与多组学分析平台,涵盖scRNA-seq、scATAC-seq、蛋白组分析及空间转录组技术,支持肿瘤异质性、微环境信号通路及个体化治疗研究。

 

结语
综上所述,单细胞多组学技术已从基础研究工具演进为解析肿瘤微环境、免疫治疗响应及疾病异质性的关键手段。通过高通量、多维度的分子图谱,这些技术能够识别与免疫检查点抑制剂响应、耐药性及肿瘤进化相关的细胞状态和信号通路。尽管当前仍面临高成本、复杂数据整合及标准化分析流程的挑战,但随着技术平台的优化和分析算法的提升,单细胞测序正逐步走向临床应用。文章最后展望,未来单细胞技术将与AI辅助分析、自动化实验流程及实时生物标志物检测相结合,为精准医学提供更高效、更个性化的治疗路径,推动肿瘤免疫治疗的个体化和智能化发展。

 

文献来源:
Jiayuan Le, Yating Dian, Deze Zhao, Furong Zeng, and Guangtong Deng. Single-cell multi-omics in cancer immunotherapy: from tumor heterogeneity to personalized precision treatment. Molecular Cancer.
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