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Tumor-infiltrating microbes and therapy response: a new frontier in triple-negative breast cancer precision oncology

2026-01-10

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该研究揭示了肿瘤浸润微生物在三阴性乳腺癌治疗反应中的预测潜力,并探讨了其作为预后生物标志物的前景。文章强调了微生物群落对化疗和免疫治疗疗效的影响,并提出整合微生物谱与基因组和免疫数据以优化个体化治疗策略。

 

文献概述

本文《Tumor-infiltrating microbes and therapy response: a new frontier in triple-negative breast cancer precision oncology》,发表于《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》杂志,回顾并总结了肿瘤浸润微生物在癌症生物学中的新兴作用,特别是其作为预后和预测生物标志物的潜力。研究聚焦于三阴性乳腺癌(TNBC)中微生物群落与治疗反应之间的关联,讨论了其影响机制及研究中面临的挑战,包括污染风险、检测灵敏度和微生物活性的功能验证。此外,文章还强调了微生物在癌症治疗反应中的多方面作用,如药物代谢和免疫调节,为未来TNBC精准治疗提供了新思路。

背景知识

三阴性乳腺癌(TNBC)是一种缺乏ER、PR和HER2表达的乳腺癌亚型,通常更具侵袭性,且治疗选择有限。KEYNOTE-522试验已证明,在TNBC的新辅助化疗中加入帕博利珠单抗可显著提高病理完全缓解率和无事件生存期,但不同患者对治疗的反应仍存在显著异质性。近年来,越来越多的研究表明肿瘤浸润微生物群可能通过多种机制影响治疗反应,包括药物代谢、免疫激活或抑制。然而,由于微生物在肿瘤组织中的丰度较低,检测技术存在局限性,如污染和测序信号特异性问题,因此需要多种验证方法来确认微生物的存在与活性。例如,16S rDNA测序、单细胞RNA测序、荧光原位杂交和免疫组化等技术已被用于检测微生物群落。此外,研究还表明,微生物可能通过产生小分子代谢物影响肿瘤微环境(TME)并调节免疫检查点抑制剂(ICB)的疗效。例如,Lactobacillus reuteri可代谢色氨酸为3-吲哚甲醛,激活CD8+ T细胞中的AhR受体,增强抗肿瘤免疫反应。而胰腺癌中,类似的代谢物则可能通过激活肿瘤相关巨噬细胞中的AhR,抑制抗肿瘤反应。这些发现表明,微生物的作用高度依赖于TME中受体和细胞类型的表达环境。未来,如何整合微生物组数据与基因组和免疫组数据,以更全面地理解微生物在癌症精准治疗中的作用,仍是关键挑战。

 

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研究方法与实验

Chen等人采用多种实验方法验证肿瘤微生物的存在及其活性,包括16S rDNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光原位杂交(FISH)和免疫组化(IHC)。这些方法增强了信号特异性,减少了污染带来的假阳性风险。此外,作者还从新鲜TNBC组织中培养活体微生物,验证16S测序结果并确认其活性。研究进一步将微生物群落与新辅助化疗和免疫治疗的反应相关联,支持其作为预测性生物标志物的潜力。

关键结论与观点

  • 肿瘤浸润微生物群落可能通过影响药物代谢或免疫调节,成为TNBC治疗反应的重要预测因子
  • 16S rDNA测序结合scRNA-seq和培养方法,提高了微生物检测的特异性和灵敏度
  • 研究发现微生物如Lactobacillus reuteri和Staphylococcus aureus可通过代谢物或毒素影响抗肿瘤免疫反应
  • 微生物代谢产物如吲哚类化合物可激活AhR受体,促进抗肿瘤免疫反应或抑制免疫活性,具体作用取决于TME中的细胞类型
  • 尽管微生物在肿瘤中的存在机制尚不完全清楚,但其可能来源于肠道、口腔、血液或外部环境,并受TME中免疫清除机制影响


研究意义与展望

该研究为微生物群落在癌症治疗中的功能机制提供了新的理解,并指出未来需要更大规模的队列研究、机制验证和与临床标准的整合,以更全面地定义微生物在TNBC治疗中的作用。整合微生物谱与基因组、免疫组数据可能有助于开发更精准的治疗策略,特别是在TNBC及其他乳腺癌亚型中。此外,研究还强调了标准检测方法、污染控制和微生物活性验证的重要性,以推动该领域向临床应用转化。

 

构建多种免疫缺陷小鼠模型,包括NOD-Scid、C-NKG等,支持人源肿瘤异种移植(CDX/PDX),适用于抗肿瘤药物的临床前研究。

 

结语

肿瘤浸润微生物群落的研究正迅速成为癌症生物学的重要方向,其在三阴性乳腺癌中的作用尤为突出。Chen等人的研究为微生物作为预测性生物标志物提供了有力支持,并展示了其在化疗和免疫治疗反应中的功能影响。然而,该领域仍面临诸多挑战,如标准化检测方法、污染控制、微生物活性验证等。未来研究需结合多组学数据、基础微生物学技术及临床标准,以明确微生物在癌症进展和治疗反应中的作用。通过整合微生物组、基因组和免疫组数据,有望在TNBC及其他癌症中开发更个性化的治疗策略,从而提升整体治疗效果。

 

文献来源:
Lynn M Marcho, Karthik B Chakravarthy, Sachin R Jhawar, and Daniel J Spakowicz. Tumor-infiltrating microbes and therapy response: a new frontier in triple-negative breast cancer precision oncology. Journal for Immunotherapy of Cancer.
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