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一、TurboKnockout®是什么:基因编辑鼠从ES细胞打靶到Founder小鼠

赛业生物在传统ES打靶技术基础上自主研发了TurboKnockout®基因编辑技术,利用优化的纯合ES克隆打靶体系,筛选基因敲除、敲入和点突变等纯合ES细胞,再结合囊胚前注射及四倍体补偿等胚胎操作技术路线制备小鼠。该路线旨在获得基因型一致的Founder小鼠,减少依赖后续繁育获得目标纯合子的等待。

四倍体补偿的基本思路,是利用四倍体受体对胚外组织的贡献,为供体多能干细胞形成胚体提供支持。胚体与胎盘、卵黄囊等胚外组织应区分理解;实际供体贡献与受体残留需要由检测结果支持。通用四倍体补偿原理与具体平台验证是不同层面的证据,不能用通用原理替代项目实测结果。[1]

项目介绍中提出,符合相应条件的模型周期快至3个月,可批量获得基因型一致的纯合子小鼠。具体项目还需结合编辑类型、克隆筛选、品系、数量和交付标准确定周期。

TurboKnockout技术构建路线与纯合子小鼠制备示意
TurboKnockout®技术路线示意

二、纯合子小鼠构建流程与关键确认点

阶段主要工作需要确认的问题
项目设计明确目标基因、修饰类型与交付基因型敲除、敲入、点突变或人源化;遗传背景与对照安排
载体与ES打靶围绕目标位点进行载体构建和细胞阶段操作目标等位基因的结构与筛选策略
纯合ES克隆筛选PCR筛选及按需开展多维度QC克隆是否符合设计,采用哪些核型、结构或表达检测
胚胎操作与Founder制备以合格ES克隆开展相应显微注射流程小鼠细胞来源与目标基因型的验证安排
交付与后续研究核对小鼠信息和检测资料数量、性别、年龄、遗传背景及研究所需功能验证

Founder(F0)表示构建获得的首代小鼠,其实验适用性需要结合构建方式和验证证据判断。关于纯合、双等位基因编辑与嵌合的区别,可进一步阅读F0代纯合子小鼠的实验适用性与质量验证要点。

三、不同基因编辑鼠构建路线如何选择

传统ES打靶需要经历细胞筛选及后续小鼠繁育,部分复杂项目可能超过一年;受精卵直接编辑减少了ES细胞操作环节,但复杂敲入及F0嵌合评估仍需结合项目设计。比较时应同时核对交付阶段、检测要求和研究目的。[2]

比较维度TurboKnockout®路线传统ES打靶路线受精卵显微注射路线
知识产权与实施条件结合具体实施方案和服务约定核查结合具体实施方案和服务约定核查涉及具体工具与使用范围时需核查相关授权条件
潜在非预期改变及检测细胞阶段筛选与QC支持目标位点评估;检测范围需明确通过细胞阶段筛选与QC评估;检测范围需明确需结合所用工具与Founder检测方案评估潜在非预期改变
供体贡献与F0一致性以高供体ES细胞贡献及目标基因型一致性为目标,配套验证数据见下文需筛选嵌合体并评估生殖系传递不采用ES供体嵌合评价口径,需关注编辑结果及F0嵌合
获得目标纯合子的路径筛选纯合ES细胞,适配敲除、敲入、点突变等项目可通过后续繁育获得;具体路径取决于等位基因设计敲除、点突变可出现双等位基因编辑结果;纯合敲入需结合项目评估
纯合子数量参考方案比较中列出的参考数量为10—50只依赖繁育与种群扩增安排方案比较中列出的参考数量为1—5只,需结合鉴定结果判断
周期参考方案比较参考为3—6个月,符合条件的项目快至3个月取决于细胞筛选、嵌合体筛选与后续繁育方案比较参考为3—6个月;如需繁育至稳定纯合品系,还需计入后续时间

数量与周期是对应方案条件下的参考值,不能脱离编辑类型、交付基因型和验收标准直接比较。“100%嵌合”也不应与受精卵编辑成功率混为同一指标。

四、编辑类型、质量控制与品系选择

编辑类型:围绕目标等位基因选择模型

可开展基因敲除、基因敲入、点突变或人源化小鼠等多种项目类型的基因修饰。项目设计应明确修饰范围、目标等位基因以及最终交付的基因型。

细胞阶段QC:从克隆筛选到表达验证

除常规PCR鉴定外,可根据项目需要采用染色体核型鉴定、Southern Blot鉴定、qPCR鉴定及FACS等表达检测,对ES克隆的打靶准确性和相关特征开展质量控制。不同检测回答的问题不同,具体组合及交付资料应在方案中明确。

F0基因型一致性:以筛选后的ES克隆为起点

结合赛业生物专利TurboKnock显微注射技术与四倍体补偿等技术路线,以经鉴定的纯合ES克隆开展小鼠制备,目标是获得基因修饰准确、基因型一致的F0代小鼠。交付模型仍需结合目标位点鉴定及约定的QC结果评估。

遗传背景:按研究需求选择品系

可提供C57BL/6NCya、C57BL/6JCya、BALB/cAnCya、129S2/SvPasCya等品系选择。模型设计时应将遗传背景与对照安排一并确认,具体品系与项目适配性以评估方案为准。

TurboKnockout技术优势与ES细胞阶段质量控制示意
TurboKnockout®技术优势示意

五、Founder细胞来源验证:完整实验与数据解读

评估Founder小鼠的细胞来源,需要将胚胎阶段、出生后阶段以及不同组织的检测结果结合起来。下列实验通过Luciferase与EGFP报告系统,考察受体胚胎标记在注入野生型ES细胞后是否仍可检出。

验证流程:载体构建 → ES打靶 → PCR/FACS验证 → 阳性受体胚胎制作 → F0胚胎及小鼠生产 → 供体ES细胞贡献与受体背景残留检测。

1. Rosa26报告载体构建、ES克隆筛选与表达验证

构建Rosa26安全位点过表达载体CAG>Luciferase>EGFP质粒,在C57BL/6N WT ES细胞上获得PCR鉴定正确的阳性克隆,随后通过流式检测验证EGFP正确表达。

Rosa26报告载体构建、ES阳性克隆筛选与EGFP表达检测
图1 载体构建、ES克隆筛选及EGFP表达检测

2. 阳性受体胚胎制备与12.5d胚胎EGFP检测

将上述阳性ES克隆通过显微注射获得阳性Founder小鼠,继而通过常规传代获得纯合F2代雄鼠。将F2雄鼠与C57BL/6N WT雌鼠配繁,产生可用于TurboKnockout®显微注射的阳性受体胚胎。在该背景胚胎中注入C57BL/6N WT ES细胞,并设置未注入ES细胞的空扎受体胚胎对照,分别获得12.5d胚胎及4周龄Founder小鼠,检测Luciferase和EGFP表达。

12.5d空扎胚胎相对于注入C57BL/6N WT ES细胞的胚胎具有明显EGFP表达。将胚胎经胰酶和DNA酶解离为单细胞后,流式检测同样显示空扎对照的EGFP表达;注入WT ES细胞的胚胎未检测到EGFP阳性细胞信号。胚胎图像中的空扎对照与ES注入组分别对应图2.A与图2.B。

12.5d空扎对照与注入WT ES细胞胚胎的EGFP荧光比较
12.5d胚胎解离后EGFP流式检测结果
图2 12.5d胚胎EGFP荧光拍照及流式检测

3. 4周龄Founder小鼠Luciferase活体成像

将空扎胚胎和注入WT ES细胞的胚胎分别移植至ICR代孕鼠,待出生的Founder小鼠达到4周龄后进行活体成像。注入C57BL/6N WT ES细胞的胚胎发育而来的小鼠未见Luciferase荧光信号(图3.B),空扎胚胎发育而来的小鼠表现为强Luciferase荧光(图3.A);组间差异具有统计学意义(图3.C,P=0.0074)。

4周龄Founder小鼠Luciferase活体成像及组间信号比较
图3 4周龄Founder鼠活体成像结果

4. 心、肝、脾、肺、肾及胚胎组织PCR验证

为进一步检测受体背景的CAG>Luciferase>EGFP细胞贡献,对注入WT ES细胞的4周龄小鼠取心、肝、脾、肺、肾组织,并对12.5d胚胎组织进行PCR鉴定,加入空扎胚胎作为阳性对照。结果显示,注入C57BL/6N WT ES细胞的F0小鼠所检测组织及胚胎样本中均未检测到MT条带。

4周龄Founder小鼠多组织与12.5d胚胎PCR鉴定电泳结果
图4 4周龄Founder鼠和12.5d胚胎PCR鉴定

泳道说明:1—5为注入WT ES细胞的1号小鼠心、肝、脾、肺、肾;6—10为2号小鼠对应组织;11—15为3号小鼠对应组织;16—21为注入WT ES细胞的12.5d胚胎组织;22—25为12.5d空扎胚胎组织;26为WT对照。图中加入700 bp内参。

5. 如何理解“100%嵌合”与实验结论

技术资料以“100%嵌合状态”描述Founder小鼠的高供体ES细胞贡献。上述荧光、流式、活体成像及多组织PCR结果相互支持:在本实验所检测的时间点、组织样本及方法检测范围内,未检出受体报告基因背景的残留信号。这里的“100%”用于描述细胞来源目标,不等于每次注射均能成功,也不等于检测已经覆盖全部细胞。

报告基因受体胚胎的制备使用了常规F0至F2繁育,这属于验证系统建立过程,应与待构建模型的项目交付周期区分。该实验支持细胞来源层面的评估;目标等位基因准确性、遗传传递及研究所需功能仍应由对应检测确认。

六、从技术选型到人源化及复杂模型应用

该平台可用于完全性或条件性基因敲除小鼠、基因敲入小鼠、点突变及人源化等项目。技术选择应从研究问题出发,将目标等位基因、表达验证与模型用途连接起来,而不是仅以交付速度作为判断依据。

对于人源基因替换、HUGO-GT®模型及全人源抗体小鼠等需求,可阅读TurboKnockout®在人源化小鼠构建与模型定制中的应用,进一步梳理替换范围与应用评估重点。

七、Cre-ES纯合子小鼠模型构建方案

“细胞造小鼠”方案结合赛业生物专属Cre-ES细胞系与TurboKnockout®技术,利用稳定表达Cre重组酶的细胞体系开展模型构建,减少外源转染或病毒递送导致的表达不稳定问题。方案以从ES细胞打靶到高供体贡献Founder小鼠的流程衔接为特点,CKO纯合子小鼠构建方案提出快至4个月交付。

交付目标参考周期方案参考价(万元)
5只雄性CKO纯合子4—5个月3.45
10只雄性CKO纯合子4—5个月3.98
20只雄性CKO纯合子4—5个月5.48
40只雄性CKO纯合子4—5个月7.48

以上价格、数量与周期对应所列Cre-ES构建方案,具体适用范围、交付基因型、检测内容及报价请联系赛业生物确认。方案中的CKO纯合子与目标组织内已经发生重组的功能性敲除状态,应结合具体设计、Cre条件及鉴定结果区分。

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参考文献与资料来源

[1] An interspecies barrier to tetraploid complementation and chimera formation. Scientific Reports, 2018. 通用四倍体补偿与谱系贡献背景资料;不作为具体商业项目交付结果的替代证据。

[2] Impact of essential genes on the success of genome editing experiments generating 3313 new genetically engineered mouse lines. Scientific Reports, 2024. 用于Founder嵌合、生殖系传递及构建结果评估的研究背景。

技术流程、实验图片及方案信息来源:赛业生物提供的TurboKnockout®技术资料。荧光、活体成像和PCR结果的解释以所示实验条件与检测范围为限。

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围绕本文的 TurboKnockout 基因编辑技术、小鼠模型构建及验证流程,可结合 iCyagen 梳理目标基因、修饰类型和研究问题。具体模型适用性和构建方案仍需结合原始资料、验证数据及项目条件确认。

正在规划基因敲除、敲入、点突变或条件性模型项目?可提供目标基因、修饰类型与交付需求,联系赛业生物评估构建路线及质量验证安排。

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FAQ

TurboKnockout®与传统ES打靶的主要区别是什么?

其在传统ES打靶基础上优化纯合ES克隆筛选及后续胚胎操作流程,以获得基因型一致的Founder小鼠为目标。项目仍需通过目标位点鉴定与约定的QC结果确认。

快至3个月与Cre-ES方案4—5个月是否矛盾?

两者对应不同方案条件。快至3个月是符合相应条件项目的周期表述,Cre-ES表格则对应所列CKO纯合子数量与交付安排,应分别核对项目起点、交付终点和检测内容。

“100%嵌合”是否意味着每次注射都成功?

不是。该表述描述供体ES细胞贡献目标,与注射成功率不同。本文实验在所检测的组织和方法范围内未检出受体报告背景残留,不能由此推导每次构建均成功。

项目评估需要提供哪些信息?

建议提供目标基因、修饰类型、拟获得的等位基因、遗传背景、数量和性别需求,以及研究用途和必要的功能验证要求。

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