上一期,我们见证了HUGO-GT®如何从为罕见病患者点亮希望的“初心”,进化为赋能广泛疾病研究的“普适”平台(点击回顾上期精彩内容)。故事的序章已拉开帷幕,但一个更深层次的问题随之浮现:在基因层面真正“人源化”一只小鼠,究竟意味着什么?仅仅让它“穿上人类的衣服”就足够了吗?
随着现代疗法(如siRNA、基因编辑等)的研究焦点从蛋白质转向更复杂的编码区(CDS)及非编码区(如内含子、UTR),用于“战前演习”的动物模型必须怎样升级迭代,以适应前沿科研需求,避免药物研发中“差之毫厘,谬以千里”的风险?
欢迎体验本期【HUGO进化论·技术篇】。我们将带您走进赛业生物的研发幕后,独家揭秘HUGO-GT®模型“换芯”过程的精妙艺术,展现其背后的“硬核实力”与“工匠精神”!
图1 HUGO-GT®全基因组人源化小鼠模型构建计划
灵魂拷问:为何需要更“彻底”的人源化革命?过去三十年,小鼠凭借与人类高度的遗传相似性和成熟的分子遗传学技术,成为人类疾病研究的核心模型。从简单转基因到复杂的基因敲除、敲入,甚至涉及染色体易位、大片段缺失与重复的转染色体技术,科研人员成功构建了诸多令人瞩目的突变模型[1-2]。这些模型在揭示疾病机制方面功不可没。
然而,科学的脚步永不停歇,挑战也接连涌现。
传统的“人源化”策略,通常是将人类基因的“核心蓝图”——编码序列(CDS),直接“塞”入小鼠的同源基因中。这虽能使小鼠表达目标人类蛋白,但局限性很快显现。这就像是给一位演员穿上了角色的戏服(蛋白),却忽略了他需要揣摩的剧本、舞台的灯光和观众的反应(调控元件与环境)。
●首先,缺失了关键的“剧本”——基因调控元件。基因表达并非简单的开关,而是由启动子、增强子、非翻译区(UTR)和内含子等元件的精妙协同调控,决定表达的时间、地点和强度[3]。若缺乏人类特有的调控序列,模型可能出现表达失真或模式紊乱,临床相关性大打折扣。
●其次,忽略了物种间的“语言障碍”。蛋白质需与其他蛋白质形成复杂网络以发挥功能。人类蛋白在小鼠细胞环境中可能因无法与正确“伙伴”互动,而难以真实再现物种特异性的生理病理特征。
●更重要的是,人类对生命蓝图的认知在深化。近年来,DNA元件百科全书(ENCODE)和全基因组关联分析(GWAS)等项目揭示,非编码区——曾被视为“垃圾DNA”——实则是疾病发生发展的核心因素[4]。
试想,一款旨在修正RNA剪接异常的ASO药物,或靶向3'UTR的siRNA药物,若在仅含人类CDS的模型上测试,结果如何?显而易见:关键靶点在传统模型中并不存在,这为药物临床转化埋下重大隐患。
因此,一场从“形似”到“神似”的深刻人源化革命势在必行。我们需要构建能够原位替换、保留完整序列并模拟生理表达的新模型。
这正是HUGO-GT®项目的核心目标:将人类基因完整地原位替换到小鼠基因组的正确位置,确保保留完整的序列(包括外显子、内含子和非编码区),从而模拟生理表达,使基因的表达水平和时空模式无限接近人类真实情况。
核心策略:“换芯”的艺术——有所为,有所不为面对严苛要求,HUGO-GT®的“换芯”并非简单地将人类基因全盘移植,而是体现于精准取舍与巧妙平衡。
赛业生物的策略是:在尽可能保留小鼠自身核心调控系统以确保生理功能稳定的前提下,最大限度地替换目标基因的人源功能序列。
基因犹如一个工厂,其结构精妙。启动子是“总开关”,负责启动转录并控制其速度。5'非翻译区(5'UTR)是“质检第一关”,直接调控翻译的起始与效率。外显子与内含子是“待加工的原材料”,经过转录形成“半成品”(前mRNA)。在后续加工中,内含子被移除,外显子被组装,最终产出“刚出炉的产品”(成熟mRNA)。3'UTR则相当于“包装和物流部”,决定着mRNA的稳定性、定位与精细调控。其中,启动子和5'UTR需与细胞内的“指挥系统”(如转录因子和核糖体)精准对话,这种“语言”具有高度物种特异性[5]。若强行替换为人类基因,可能导致人源基因在小鼠体内“水土不服”,出现“指令无法识别”(不表达)或“指令解读错误”(表达模式错乱)等问题。
图2 基因的基本组成结构、主要调控元件以及转录和翻译的过程[6]
因此,HUGO-GT®的标准策略是:保留小鼠自身的启动子和5'UTR,将人类基因的全部外显子、内含子以及至关重要的3'UTR作为一个整体,原位替换掉小鼠的同源区域。
图3 HUGO-GT®系列小鼠与传统模型的构建策略对比
这种“有所为,有所不为”的巧妙设计带来了多重优势:既利用小鼠启动子确保表达的可靠性和组织特异性,又通过完整替换功能区,为研究RNA剪接变异及评估ASO、siRNA等疗法提供了精准平台。
表1 HUGO-GT®全基因组人源化模型的优势
当然,科学从不拘泥于教条。在某些特殊情况下,若有明确证据表明人类启动子或5'UTR调控机制是疾病发生的关键,经过审慎的风险评估后,我们也会选择对这些区域进行替换,以满足特定的研究需求。硬核实力:驾驭“基因航母”的精尖技术理想的策略需要强大的技术实力支撑。要实现HUGO-GT®这种大片段的“换芯”,无异于在纳米级的基因组上对“基因航母”进行精确的外科手术。这正是赛业生物引以为傲的“硬核实力”——我们自主研发的TurboKnockout® ES 打靶技术。
图4 基于ES的TurboKnockout®技术流程示意图
罕见病领域中,不乏杜氏肌营养不良症致病基因DMD、囊性纤维化致病基因CFTR,以及SCN1A、TCF4、TTN等一系列超长基因。常规基因编辑技术(如CRISPR-Cas9)在处理如此巨大的片段时,往往面临效率低下、脱靶风险增加等瓶颈。然而,TurboKnockout®技术凭借其基于胚胎干细胞(ES)同源重组的超高精度和对超大片段的卓越驾驭能力,使我们有能力攻克这些最棘手的难题。
图5 TurboKnockout®技术平台的优势
迄今为止,在HUGO-GT®项目中,我们处理的单个基因最大替换长度已接近500kb,所有项目的平均替换长度也达到了约88kb。更重要的是,这些装载了“基因航母”的小鼠,都基本能在体内稳定、正常地表达人源基因和蛋白,为后续研究奠定最坚实的基础。
工匠精神:于细微处铸就模型的卓越品质每一个成功的HUGO-GT®模型背后,都不是一蹴而就,而是研发团队日夜攻坚、精益求精的“工匠精神”的结晶。这项技术面临着重重挑战:从复杂的大片段载体构建,到极低成功率的打靶筛选;从确保序列无误的严格质控,到避免鼠源基因回插的风险控制;再到解决模型成功后的繁育难题。面对这些挑战,赛业生物的研发团队没有捷径可走,唯有依靠科学、严谨与执着:
●强大的技术平台:TurboKnockout®是我们最坚实的后盾。
●周密的风险预案:在项目启动之初,团队便进行充分的风险评估与预案设计。
●贯穿始终的严格质控:我们建立了一套极其严苛的质量控制体系,从载体测序、ES细胞筛选的Southern Blot或长片段PCR验证,到最终小鼠的基因型和表达验证,层层把关,不放过任何疑点。
●不懈地优化与探索:当遇到繁育困难时,团队会通过更换ES克隆、优化繁育策略等方法,耐心摸索出最佳解决方案。