Nucleic Acids Research
RNA干扰机制介导DNA甲基化在禾谷镰刀菌营养菌丝中抵抗真菌DNA病毒
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本研究首次揭示了禾谷镰刀菌中RNA干扰（RNAi）复合物（如DCL和AGO家族）通过引导病毒DNA甲基化，从而抑制真菌DNA病毒FgGMTV1的积累，为真菌抗病毒机制研究提供了新的分子基础。
文献概述
本研究揭示了禾谷镰托孢（Fusarium graminearum）中FgGMTV1病毒基因组DNA的甲基化现象，尤其是在病毒DNA-A的Rep启动子区域和DNA-C的p26启动子区域，甲基化水平最高可达55.87%。通过基因敲除实验，研究人员发现DNA甲基转移酶DIM2是启动子甲基化的主要介导因子，并且该过程依赖于RNA干扰（RNAi）通路中的核心蛋白DCL1、DCL2和AGO1。病毒感染显著改变了突变体菌株的生长、抗逆性及致病性，表明DNA甲基化在真菌抗病毒防御中具有重要作用。
背景知识
DNA甲基化是一种重要的表观遗传机制，在动植物中已被广泛研究，尤其在抗病毒防御和基因沉默中具有核心作用。然而，在真菌中，由于DNA病毒较少，相关研究较为有限。禾谷镰刀菌是一种重要的植物病原菌，其感染的小麦和大麦面临严重的产量损失和霉菌毒素污染。本研究通过构建启动子融合GFP的转基因株系，结合病毒诱导基因沉默（VIGS）系统，深入解析了病毒衍生小RNA（vsiRNA）对病毒基因组和外源启动子的甲基化调控机制，为真菌表观遗传学研究提供了突破性的进展。
研究方法与实验
1. 使用无病毒的禾谷镰刀菌野生型PH-1作为亲本菌株，构建不同基因敲除突变体（如dim2、dcl1、dcl2、ago1、ago2）及其互补菌株。
2. 通过双接头PCR（DJ-PCR）扩增目标基因的5'和3'侧翼区，并与潮霉素抗性基因（HPH）融合，随后进行PEG介导的原生质体转化。
3. 构建Rep启动子（500 bp上游序列）与GFP融合的表达载体（pRep(500)-GFP），并转化到不同基因敲除菌株中，评估启动子活性变化。
4. 使用亚硫酸盐测序分析启动子区域的甲基化水平，评估不同突变体对FgGMTV1基因组甲基化的影响。
5. 通过小RNA测序分析FgGMTV1感染株系中vsiRNA的分布，评估RNA干扰通路对启动子甲基化的调控作用。
关键结论与观点
研究意义与展望
本研究首次在真菌中揭示RNA干扰通路通过引导DNA甲基化实现抗病毒免疫，为真菌表观遗传机制提供了新的分子证据。未来可进一步探索该机制是否在其他真菌系统中保守，以及其在生物防治和病毒病控制中的应用潜力。
结语
本研究系统解析了禾谷镰刀菌在RNA干扰机制介导下对DNA病毒FgGMTV1的表观遗传防御机制。研究发现，病毒基因组启动子区域存在高度甲基化，且该过程由DIM2介导，与DCL1、DCL2、AGO1等RNAi核心因子协同作用。通过构建启动子-GFP融合系统，研究人员证明了甲基化对启动子转录活性的抑制作用，并通过小RNA测序和功能缺失突变体分析，揭示了vsiRNA在甲基化中的引导作用。这些发现不仅拓展了真菌表观遗传学的分子机制，也为RNA干扰介导的抗病毒策略提供了新的研究方向。未来研究可进一步解析该机制在不同真菌系统中的保守性，以及其在生物防治中的应用价值。
