Wdr33-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Wdr33-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-21035

品系全称

C57BL/6JCya-Wdr33em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-74320-Wdr33-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Wdr33-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-21035) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
WD repeat domain 33
基因别称
1110001N06Rik,2310011G05Rik,2810021O11Rik,8430413N20Rik,WDC146
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028866 | Ensembl: ENSMUST00000025264
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 5~6
敲除长度
~1.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Wdr33(WD repeat domain 33)是人类基因,编码三个主要异构体,其中WDR33v1(V1)是一种已知的核mRNA多腺苷酸化因子。V1包含七个WD(色氨酸-天冬氨酸)重复,是V2和V3所缺乏的。V2和V3是通过选择性多腺苷酸化产生的,并定位于内质网,与刺激干扰素基因(STING)相互作用,这是一种诱导细胞对细胞质双链DNA反应的免疫因子[1]。WDR33的这些异构体在功能上与V1完全不同,表明选择性mRNA加工是一种比以前认为的更强大的机制。

WDR33在多种生物学过程中发挥作用,包括免疫反应和RNA加工。WDR33的异构体V2和V3在先天免疫中发挥作用。V2通过阻止STING的二硫键寡聚化来抑制干扰素-β的诱导,但促进自噬,可能是通过招募WIPI2异构体。另一方面,V3的功能是增加STING蛋白的水平[1]。这些发现不仅提供了对STING调节机制的深入了解,而且揭示了蛋白质异构体在功能上可以完全无关,表明选择性mRNA加工是一种比以前认为的更强大的机制[1]。

WDR33的基因变异与多种疾病相关,包括原发性卵巢功能不全(POI)。在一项大样本的女性POI队列研究中,WDR33的候选杂合变异被确定为POI的风险基因之一[2]。此外,WDR33的异构体在RNA加工中发挥作用。WDR33的转录物受选择性多腺苷酸化(APA)的影响,导致产生两个非典型的蛋白质异构体,V2和V3,它们的功能与全长蛋白完全不同,并在先天免疫中发挥作用[3]。APA机制涉及使用多个多腺苷酸化位点,导致V2和V3的表达水平受多腺苷酸化因子CFIm25的调节。APA位点的使用是随机的,并受剪接和选择性多腺苷酸化的复杂相互作用的影响[3]。

WDR33还在RNA介导的染色质沉默中发挥作用。在拟南芥FLC基因的研究中,发现新转录本诱导的R环的解析促进了染色质沉默。WDR33与FCA和FY相互作用,共同促进新转录本的反义链的多腺苷酸化,从而清除R环并招募组蛋白修饰因子,导致染色质沉默[4]。

WDR33还参与mRNA的3'端加工。WDR33是CPSF(切割和聚腺苷酸化特异性因子)复合物的组成部分,负责识别多腺苷酸化信号AAUAAA,并在前mRNA的切割和聚腺苷酸化中提供序列特异性。WDR33与CPSF30直接结合AAUAAA,对于mRNA的3'端形成至关重要[5,6]。

WDR33还在其他生物学过程中发挥作用,包括与神经退行性疾病和自身免疫性疾病的关联。在一项关于阿尔茨海默病的全转录组关联研究中,WDR33的剪接变异与AD风险相关[7]。此外,WDR33的表达水平在多发性硬化症(MS)患者中发生改变,可能与疾病的发生和进展有关[8]。

综上所述,WDR33是一种重要的基因,编码三个主要异构体,在RNA加工、免疫反应、染色质沉默和其他生物学过程中发挥作用。WDR33的异构体在功能上与全长蛋白完全不同,表明选择性mRNA加工是一种比以前认为的更强大的机制。WDR33的基因变异与多种疾病相关,包括POI、阿尔茨海默病和MS。WDR33的研究有助于深入理解RNA加工和免疫反应的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liu, Lizhi, Manley, James L. 2024. Non-canonical isoforms of the mRNA polyadenylation factor WDR33 regulate STING-mediated immune responses. In Cell reports, 43, 113886. doi:10.1016/j.celrep.2024.113886. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38430516/
2. Gorsi, Bushra, Hernandez, Edgar, Moore, Marvin Barry, Yandell, Mark, Welt, Corrine K. . Causal and Candidate Gene Variants in a Large Cohort of Women With Primary Ovarian Insufficiency. In The Journal of clinical endocrinology and metabolism, 107, 685-714. doi:10.1210/clinem/dgab775. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34718612/
3. Liu, Lizhi, Seimiya, Takahiro, Manley, James L. 2024. WDR33 alternative polyadenylation is dependent on stochastic poly(a) site usage and splicing efficiencies. In RNA biology, 21, 25-35. doi:10.1080/15476286.2024.2408708. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39327832/
4. Xu, Congyao, Wu, Zhe, Duan, Hong-Chao, Jia, Guifang, Dean, Caroline. 2021. R-loop resolution promotes co-transcriptional chromatin silencing. In Nature communications, 12, 1790. doi:10.1038/s41467-021-22083-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33741984/
5. Chan, Serena L, Huppertz, Ina, Yao, Chengguo, Manley, James L, Shi, Yongsheng. 2014. CPSF30 and Wdr33 directly bind to AAUAAA in mammalian mRNA 3' processing. In Genes & development, 28, 2370-80. doi:10.1101/gad.250993.114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25301780/
6. Schönemann, Lars, Kühn, Uwe, Martin, Georges, Zavolan, Mihaela, Wahle, Elmar. 2014. Reconstitution of CPSF active in polyadenylation: recognition of the polyadenylation signal by WDR33. In Genes & development, 28, 2381-93. doi:10.1101/gad.250985.114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25301781/
7. Sun, Yanfa, Bae, Ye Eun, Zhu, Jingjing, Wu, Chong, Wu, Lang. 2023. A splicing transcriptome-wide association study identifies novel altered splicing for Alzheimer's disease susceptibility. In Neurobiology of disease, 184, 106209. doi:10.1016/j.nbd.2023.106209. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37354922/
8. Gharesouran, Jalal, Taheri, Mohammad, Sayad, Arezou, Mazdeh, Mehrdokht, Omrani, Mir Davood. 2019. A Novel Regulatory Function of Long Non-coding RNAs at Different Levels of Gene Expression in Multiple Sclerosis. In Journal of molecular neuroscience : MN, 67, 434-440. doi:10.1007/s12031-018-1248-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30610590/