Sned1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Sned1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-21028

品系全称

C57BL/6JCya-Sned1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-208777-Sned1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Sned1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-21028) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
sushi, nidogen and EGF-like domains 1
基因别称
6720455I24Rik,D430044C15Rik,SST3,Snep
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172463 | Ensembl: ENSMUST00000062202
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~1.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Sned1,也称为IRE-BP1,是一种编码细胞外基质蛋白的基因。该基因编码的蛋白质在细胞外基质中发挥作用,参与组织发育、细胞和组织组织的过程。Sned1基因的表达与多种生物学过程相关,包括细胞迁移、细胞粘附和细胞信号传导。

在发育过程中,Sned1基因的表达对于维持胚胎的正常生长和发育至关重要。研究发现,Sned1基因的敲除会导致小鼠的早期新生儿死亡和颅面畸形。这些小鼠表现出生长缺陷、鼻腔堵塞和颅面畸形,表明Sned1在颅面和骨骼结构的发展中发挥重要作用[1]。

此外,Sned1基因的表达与多种疾病的发生和发展相关。研究发现,Sned1基因的甲基化水平与晚期轻度认知障碍(LMCI)的发生和发展相关。在LMCI患者中,Sned1基因的甲基化水平下调,而HDAC4、HDAC8和HOX家族基因的表达上调[2]。这表明Sned1基因的甲基化水平可能参与调节LMCI的发生和发展过程。

此外,Sned1基因的表达还与糖尿病肾病(DN)的发生和发展相关。研究发现,DN患者中Sned1基因的表达上调,而CASP3、DHCR24、CXCL1、GYPC、INHBA、LTF、MT1G、MUC1、NINJ1、PFKFB3、PPP1R3C、CCL5、SRSF7、PHLDA2、RBM39、WTAP、BASP1、PLK2、PDK2、PNPLA4等基因的表达也发生改变[3]。这些发现表明Sned1基因可能参与DN的发生和发展过程。

此外,Sned1基因的表达还与胶质母细胞瘤(GBM)的预后相关。研究发现,GBM患者中Sned1基因的甲基化水平下调,而ALX1、KANK1、NUDT12、SVOP等基因的甲基化水平上调[4]。这表明Sned1基因的甲基化水平可能参与调节GBM的发生和发展过程,并影响患者的预后。

此外,Sned1基因的表达还与地中海饮食对胎儿肠道微生物组和表观遗传调控的影响相关。研究发现,地中海饮食模式对胎儿肠道微生物组和表观遗传调控具有有益影响,包括Sned1基因的甲基化水平[5]。

此外,Sned1基因的表达还与儿童肥胖的发生和发展相关。研究发现,儿童肥胖患者中Sned1基因的甲基化水平下调,而KLHL6、WDR51A、CYTH4-ELFN2、CFLAR、PRDM14、SOS1、ZNF643、ST6GAL1、C3orf70、CILP2、MLLT4和ncRNA LOC101929268等基因的甲基化水平上调[6]。这表明Sned1基因的甲基化水平可能参与调节儿童肥胖的发生和发展过程。

此外,Sned1基因的表达还与多环芳烃(PCB126)暴露对RNA修饰的影响相关。研究发现,PCB126暴露会导致m6A RNA修饰的改变,包括Sned1基因的转录本[7]。

此外,Sned1基因的表达还与瘢痕疙瘩成纤维细胞中的竞争性内源RNA(ceRNA)网络相关。研究发现,Sned1基因是HOXA11-AS ceRNA网络中的关键基因,与NIPAL3基因的表达相关[8]。

此外,Sned1基因的表达还与胰腺癌的耐药性相关。研究发现,3D培养的胰腺癌细胞中Sned1基因的表达上调,与细胞外基质蛋白的表达相关,并导致化疗药物的抗药性[9]。

此外,Sned1基因的表达还与神经管缺陷(NTD)的发生和发展相关。研究发现,NTD患者中Sned1基因的甲基化水平下调,而SOX18基因的甲基化水平上调[10]。这表明Sned1基因的甲基化水平可能参与调节NTD的发生和发展过程。

综上所述,Sned1基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞迁移、细胞粘附、细胞信号传导和组织发育。Sned1基因的表达与多种疾病的发生和发展相关,包括LMCI、DN、GBM、儿童肥胖、PCB126暴露、瘢痕疙瘩、胰腺癌和NTD。Sned1基因的表达可能参与调节这些疾病的发生和发展过程,并影响患者的预后。

参考文献:
1. Barqué, Anna, Jan, Kyleen, De La Fuente, Emanuel, Hynes, Richard O, Naba, Alexandra. 2020. Knockout of the gene encoding the extracellular matrix protein SNED1 results in early neonatal lethality and craniofacial malformations. In Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 250, 274-294. doi:10.1002/dvdy.258. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33012048/
2. Zhang, Yi, Shen, Shasha. 2024. Epigenome-wide DNA methylation analysis of late-stage mild cognitive impairment. In Frontiers in cell and developmental biology, 12, 1276288. doi:10.3389/fcell.2024.1276288. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38298218/
3. Bi, Hui, Ma, Liang, Zhong, Xu, Long, Gang. . Multiple-microarray analysis for identification of key genes involved in diabetic nephropathy. In Medicine, 102, e35985. doi:10.1097/MD.0000000000035985. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37986381/
4. Zhao, Jingwei, Wang, Le, Kong, Daliang, Hu, Guozhang, Wei, Bo. 2019. Construction of Novel DNA Methylation-Based Prognostic Model to Predict Survival in Glioblastoma. In Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, 27, 718-728. doi:10.1089/cmb.2019.0125. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31460783/
5. Sasaki, Tamlyn, Kawamura, Megan, Okuno, Chirstyn, Lee, Men-Jean, Miller, Corrie. 2023. Impact of Maternal Mediterranean-Type Diet Adherence on Microbiota Composition and Epigenetic Programming of Offspring. In Nutrients, 16, . doi:10.3390/nu16010047. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38201877/
6. Rzehak, Peter, Covic, Marcela, Saffery, Richard, Gruszfeld, Dariusz, Koletzko, Berthold. 2017. DNA-Methylation and Body Composition in Preschool Children: Epigenome-Wide-Analysis in the European Childhood Obesity Project (CHOP)-Study. In Scientific reports, 7, 14349. doi:10.1038/s41598-017-13099-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29084944/
7. Aluru, Neelakanteswar, Karchner, Sibel I. . PCB126 Exposure Revealed Alterations in m6A RNA Modifications in Transcripts Associated With AHR Activation. In Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology, 179, 84-94. doi:10.1093/toxsci/kfaa158. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33064826/
8. Wang, Qiang, Wang, Wei, Sun, Xiao-Jie. 2022. Construction of a HOXA11-AS-Interact Ed Network in Keloid Fibroblasts Using Integrated Bioinformatic Analysis and in Vitro Validation. In Frontiers in genetics, 13, 844198. doi:10.3389/fgene.2022.844198. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35432479/
9. Longati, Paola, Jia, Xiaohui, Eimer, Johannes, Löhr, Matthias, Heuchel, Rainer L. 2013. 3D pancreatic carcinoma spheroids induce a matrix-rich, chemoresistant phenotype offering a better model for drug testing. In BMC cancer, 13, 95. doi:10.1186/1471-2407-13-95. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23446043/
10. Rochtus, Anne, Winand, Raf, Laenen, Griet, Van Geet, Chris, Freson, Kathleen. 2016. Methylome analysis for spina bifida shows SOX18 hypomethylation as a risk factor with evidence for a complex (epi)genetic interplay to affect neural tube development. In Clinical epigenetics, 8, 108. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27757173/