Lsm5-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Lsm5-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-20954

品系全称

C57BL/6JCya-Lsm5em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66373-Lsm5-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Lsm5-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-20954) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
基因别称
2010208O10Rik,2310034K10Rik
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025520 | Ensembl: ENSMUST00000170382
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~3.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Lsm5,也称为Sm-like 5,是Sm-like蛋白家族成员之一,这个家族编码的蛋白是剪接体U6小核核糖核蛋白复合物的核心成分。Sm-like蛋白在RNA代谢中发挥着多种功能,对于真核生物的生物学过程至关重要,包括在应激反应中的功能。Lsm5在植物和哺乳动物中都有发现,并且参与调节昼夜节律和RNA代谢过程,如mRNA剪接和降解。

在植物中,Lsm5参与调节对热胁迫的耐受性。例如,在拟南芥中,Lsm5的突变体表现出对热胁迫的敏感性增加,并且对干旱和盐胁迫的耐受性降低[1]。Lsm5在正常生长条件下定位于细胞核,但在热胁迫后,Lsm5也被发现定位于细胞质中。全基因组转录组分析显示,在热胁迫下,Lsm5突变体中许多基因的表达发生了显著变化,包括更多的热响应基因的表达增加,以及异常转录本(如内含子保留和加帽转录本)的积累。这些结果表明,Lsm5通过适当的mRNA剪接和脱帽来降解异常转录本,精确的RNA代谢机制对于热胁迫的耐受性至关重要[1]。

在哺乳动物中,Lsm5的表达受到昼夜节律的调控。例如,在拟南芥和哺乳动物的下丘脑视交叉上核中,Lsm5的表达都受到昼夜节律的调节[2]。Lsm5的突变或表达下调会导致昼夜节律周期延长。基因组表达分析表明,Lsm5突变体中一些核心时钟基因的表达和选择性剪接发生了改变,这表明Lsm5在昼夜节律调节中发挥作用[2]。

此外,Lsm5在人类疾病中也发挥着重要作用。例如,在结肠癌中,Lsm5的表达水平与患者的预后相关,高表达水平的Lsm5与不良预后相关[3]。Lsm5的敲低可以抑制结肠癌细胞的增殖并促进其凋亡,这是通过上调p53、CDKN1A和TNFRSF10B的表达来实现的[3]。在肥厚型心肌病中,Lsm5被确定为关键枢纽基因之一,其表达上调可能与疾病的发生和发展相关[4]。在胃癌中,Lsm5的表达上调与5-氟尿嘧啶化疗耐药性相关,Lsm5可能作为预测和治疗胃癌的潜在生物标志物[5]。在绝经后骨质疏松症中,Lsm5的表达上调与疾病的发生和发展相关,可能作为诊断和治疗的潜在生物标志物[6]。在鼻咽癌中,Lsm5的表达上调与患者的预后不良相关,其下调可以抑制肿瘤细胞的增殖和迁移[7]。在男性不育症中,Lsm5的基因多态性与不育症相关[8]。

综上所述,Lsm5是一种重要的RNA代谢调节因子,参与调节植物和哺乳动物中的昼夜节律,以及人类多种疾病的发生和发展。Lsm5的研究有助于深入理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Okamoto, Masanori, Matsui, Akihiro, Tanaka, Maho, Toyoda, Tetsuro, Seki, Motoaki. 2016. Sm-Like Protein-Mediated RNA Metabolism Is Required for Heat Stress Tolerance in Arabidopsis. In Frontiers in plant science, 7, 1079. doi:10.3389/fpls.2016.01079. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27493656/
2. Perez-Santángelo, Soledad, Mancini, Estefanía, Francey, Lauren J, Hogenesch, John B, Yanovsky, Marcelo J. 2014. Role for LSM genes in the regulation of circadian rhythms. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 111, 15166-71. doi:10.1073/pnas.1409791111. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25288739/
3. Mo, Cai-Jing, Deng, Xiao-Yuan, Ma, Ru-Lan, Shi, Lei, Li, Kang. . Sm-like 5 knockdown inhibits proliferation and promotes apoptosis of colon cancer cells by upregulating p53, CDKN1A and TNFRSF10B. In World journal of gastrointestinal oncology, 16, 2716-2726. doi:10.4251/wjgo.v16.i6.2716. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38994171/
4. Chen, Peng, Yawar, Warda, Farooqui, Ayesha Rida, Razi Ul Islam Hashmi, Muhammad, Hameed, Yasir. 2024. Transcriptomics data integration and analysis to uncover hallmark genes in hypertrophic cardiomyopathy. In American journal of translational research, 16, 637-653. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38463581/
5. Liu, Qianhui, Lian, Qinghai, Song, Yingqiu, Jia, Changchang, Fang, Jiafeng. 2023. Identification of LSM family members as potential chemoresistance predictive and therapeutic biomarkers for gastric cancer. In Frontiers in oncology, 13, 1119945. doi:10.3389/fonc.2023.1119945. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37007092/
6. Wang, Hanyu, Peng, Chong, Hu, Guangbing, Hu, Yong, Pi, Honglin. 2024. Integrated Single-cell RNA-seq and Bulk RNA-seq Identify Diagnostic Biomarkers for Postmenopausal Osteoporosis. In Current medicinal chemistry, , . doi:10.2174/0109298673343344240930054414. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39364870/
7. Lin, Ting, Deng, Linyu, Liu, Siyu, Gong, Guanghui, He, Yingchun. 2025. Identification of RNA processing factor LSM5 as a new adverse biomarker in nasopharyngeal carcinoma. In Scientific reports, 15, 9901. doi:10.1038/s41598-025-94968-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40121338/
8. Liu, Shu-Yuan, Zhang, Chang-Jun, Peng, Hai-Ying, Chu, Jia-You, Yang, Zhao-Qing. . Strong association of SLC1A1 and DPF3 gene variants with idiopathic male infertility in Han Chinese. In Asian journal of andrology, 19, 486-492. doi:10.4103/1008-682X.178850. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27232852/