Scaf1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Scaf1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-20795

品系全称

C57BL/6JCya-Scaf1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-233208-Scaf1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Scaf1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-20795) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SR-related CTD-associated factor 1
基因别称
SR-A1
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001008422 | Ensembl: ENSMUST00000085383
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Scaf1,全称SR-related C-terminal domain-associated factor 1,是一种与RNA聚合酶II(RNAPII)C端结构域相互作用的蛋白质,属于SR(Ser/Arg-rich)超家族的成员之一。SR超家族是一类富含丝氨酸和精氨酸的预mRNA剪接因子,参与调控RNA的剪接过程。Scaf1在多种细胞过程中发挥作用,包括转录、剪接、RNA加工和运输等。此外,Scaf1还与多种疾病的发生发展密切相关,如自闭症、局灶性节段性肾小球硬化症(FSGS)、胰腺癌、胃癌、肺肉瘤样癌和丙型肝炎病毒(HCV)感染相关肝硬化等。

首先,Scaf1与自闭症相关。在一项关于自闭症全外显子组测序的研究中,研究者发现Scaf1基因在自闭症患者中存在罕见的遗传变异,表明Scaf1可能与自闭症的发生发展相关[1]。其次,Scaf1与FSGS相关。研究发现,在FSGS患者中,Scaf1基因存在罕见的基因变异,且Scaf1基因的罕见变异在FSGS患者中的频率显著高于正常人群[2]。此外,Scaf1还与胰腺癌相关。通过体内CRISPR/Cas9突变筛选,研究者发现Scaf1基因在胰腺癌细胞中具有肿瘤抑制功能,其缺失会导致细胞对化疗药物如吉西他滨的敏感性增加[3]。此外,Scaf1还与胃癌相关。研究发现,Scaf1基因在胃癌细胞中通过直接激活SOX13基因的表达,促进呼吸链超复合体的组装,从而提高胃癌细胞的代谢效率和耐药性[4]。Scaf1在胃癌细胞中还通过促进呼吸链超复合体的组装,从而提高胃癌细胞的代谢效率和耐药性。此外,Scaf1还与肺肉瘤样癌相关。研究者发现,在肺肉瘤样癌患者中,Scaf1基因存在罕见的基因变异,且Scaf1基因的罕见变异在肺肉瘤样癌患者中的频率显著高于正常人群[5]。此外,Scaf1还与HCV感染相关肝硬化相关。研究发现,在HCV感染患者中,Scaf1基因存在基因多态性,且该基因多态性与肝硬化发生的风险相关[6]。最后,Scaf1还与线粒体功能相关。研究发现,Scaf1基因在维持线粒体呼吸链复合体的组装和功能中发挥重要作用。Scaf1基因的缺失会导致线粒体呼吸链复合体的组装异常,进而影响线粒体的能量代谢和细胞的功能[7]。

综上所述,Scaf1是一种重要的蛋白质,在多种生物学过程中发挥作用。Scaf1的基因变异与多种疾病的发生发展密切相关,包括自闭症、FSGS、胰腺癌、胃癌、肺肉瘤样癌和HCV感染相关肝硬化等。此外,Scaf1还与线粒体功能相关,参与维持线粒体呼吸链复合体的组装和功能。深入研究Scaf1的功能和调控机制,有助于揭示相关疾病的发病机制,为疾病的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhou, Xueya, Feliciano, Pamela, Shu, Chang, Shen, Yufeng, Chung, Wendy K. 2022. Integrating de novo and inherited variants in 42,607 autism cases identifies mutations in new moderate-risk genes. In Nature genetics, 54, 1305-1319. doi:10.1038/s41588-022-01148-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35982159/
2. Wang, Minxian, Chun, Justin, Genovese, Giulio, Mane, Shrikant, Pollak, Martin R. 2019. Contributions of Rare Gene Variants to Familial and Sporadic FSGS. In Journal of the American Society of Nephrology : JASN, 30, 1625-1640. doi:10.1681/ASN.2019020152. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31308072/
3. Martinez, Sebastien, Wu, Shifei, Geuenich, Michael, Elling, Ulrich, Schramek, Daniel. 2024. In vivo CRISPR screens reveal SCAF1 and USP15 as drivers of pancreatic cancer. In Nature communications, 15, 5266. doi:10.1038/s41467-024-49450-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38902237/
4. Yang, Hui, Li, Qingqing, Chen, Xingxing, Sun, Yangbai, Ma, Mingzhe. 2024. Targeting SOX13 inhibits assembly of respiratory chain supercomplexes to overcome ferroptosis resistance in gastric cancer. In Nature communications, 15, 4296. doi:10.1038/s41467-024-48307-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38769295/
5. García-Poyatos, Carolina, Cogliati, Sara, Calvo, Enrique, Mercader, Nadia, Enríquez, José Antonio. 2020. Scaf1 promotes respiratory supercomplexes and metabolic efficiency in zebrafish. In EMBO reports, 21, e50287. doi:10.15252/embr.202050287. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32496654/
6. Adamopoulos, Panagiotis G, Raptis, Georgios D, Kontos, Christos K, Scorilas, Andreas. 2018. Discovery and expression analysis of novel transcripts of the human SR-related CTD-associated factor 1 (SCAF1) gene in human cancer cells using Next-Generation Sequencing. In Gene, 670, 155-165. doi:10.1016/j.gene.2018.05.044. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29787824/
7. Bhandare, Pranjali, Narain, Ashwin, Hofstetter, Julia, Erhard, Florian, Wolf, Elmar. . Phenotypic screens identify SCAF1 as critical activator of RNAPII elongation and global transcription. In Nucleic acids research, 53, . doi:10.1093/nar/gkae1219. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39698826/