Smc6-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

Smc6-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-20726

品系全称

C57BL/6JCya-Smc6em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67241-Smc6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Smc6-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-20726) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
structural maintenance of chromosomes 6
基因别称
2810489L22Rik,3830418C19Rik,SMC-6,Smc6l1,mKIAA4103
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025695 | Ensembl: ENSMUST00000020931
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~1.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1914491Mice homozygous for a gene trap allele exhibit poor embryonic development and embryonic lethality by E105. Mice homozygous for a hypomorphic allele exhibit decreased body weight and weight, decreased litter size and partial lethality. Mice homozygous for a point mutation exhibit a milder phenotype.
Smc6(Structural Maintenance of Chromosomes 6)是结构维持染色体蛋白家族中的一个成员,与Smc5共同构成了一个高度保守的蛋白质复合体Smc5-Smc6。这个复合体在维持染色体的结构、参与DNA修复和同源重组等方面发挥重要作用。在酵母中,Smc5-Smc6复合体对于细胞的增殖至关重要,它参与DNA修复和同源重组,并在维持基因组稳定性方面发挥关键作用。在哺乳动物细胞中,Smc5-Smc6复合体也参与DNA修复,并对一些DNA损伤剂表现出敏感性。为了进一步了解Smc6在哺乳动物中的作用,研究人员在Smc6基因中引入了突变,发现Smc6是一个在哺乳动物中至关重要的基因。然而,当在Smc6基因的ATP酶结构域中引入一个保守的丝氨酸-994突变为丙氨酸的突变时,小鼠表现出一个出人意料的轻微表型。这些小鼠体型较小,但能够繁殖并且寿命正常。当去除neo基因选择标记后,小鼠的体型恢复正常,但详细表型分析显示它们在葡萄糖耐量、造血、痛觉和全局基因表达模式方面存在轻微异常。这些结果表明Smc6基因在哺乳动物中具有重要的生物学功能,并且其ATP酶活性对于维持正常生理功能至关重要[1]。

在癌症研究中,非编码区域的突变被认为是肿瘤发生发展的重要因素。在基因组范围内对3949个全癌症基因组进行分析发现,SMC6基因的非编码区突变在癌症中频繁发生,这些突变可能反映了肿瘤细胞起源的印记。SMC6基因的非编码区突变可能参与了肿瘤的发生发展,并可能成为癌症诊断和治疗的新靶点[2]。

SUMO(小泛素样修饰物)修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰,参与维持基因组完整性。NFATC2IP是一种进化上保守的蛋白质,与SUMO修饰密切相关。研究发现,NFATC2IP通过与SMC5/6复合体和SUMO E2酶UBC9相互作用,在维持基因组完整性方面发挥重要作用。NFATC2IP缺乏的细胞对SUMO E1抑制剂的毒性表现出敏感性,这可能是由于有丝分裂染色体桥和微核的积累所导致的。NFATC2IP主要在间期发挥作用,并与新生DNA相关联,这表明它在复制或重组中间体的复制后解析中发挥作用。这些研究结果揭示了NFATC2IP在维持基因组完整性中的作用,并且强调了SMC5/6复合体在SUMO修饰途径中的重要性[3]。

在哺乳动物精子发生过程中,染色质结构和功能受到SMC蛋白家族的六个成员的调控,这些成员形成三个异源二聚体复合体:Smc1/3(粘合蛋白)、Smc2/4(凝聚蛋白)和Smc5/6。Smc6在哺乳动物精子发生过程中的作用尚不清楚。研究发现,Smc6在小鼠精子发生过程中作为有丝分裂前期着丝粒异染色质域的一部分发挥作用,这些域在分化精原细胞不可逆地进入有丝分裂时被启动。Smc6在精原细胞有丝分裂中不是必需的,而Smc6阴性的有丝分裂细胞无法完成它们的第一轮有丝分裂。此外,Smc6位于着丝粒异染色质域中,而DNA修复或重组位点(分别由γH2AX或Rad51标记)并不与这些域共定位。这些结果表明Smc6在维持精子发生过程中着丝粒异染色质域的稳定性方面发挥重要作用,并可能防止在有丝分裂前期发生着丝粒区域的异常重组事件,从而避免导致细胞凋亡、有丝分裂停滞或非整倍体[4]。

Smc5-Smc6复合体在维持基因组稳定性方面发挥重要作用。研究发现,smc6-9突变增加了染色体易位等大范围染色体重排的发生率。在smc6-9菌株中产生的易位是非相互的,依赖于断裂诱导复制(BIR),并且不依赖于非同源末端连接。Smc5-Smc6复合体通过减少在重复序列中的DNA损伤来抑制易位。这些结果表明Smc5-Smc6复合体在抑制由BIR介导的大范围染色体重排的形成中发挥重要作用[5]。

在酿酒酵母中,SMC6(RHC18)是SMC蛋白家族的一个成员,它与裂殖酵母rad18+基因同源,并且对于细胞的生存至关重要。研究发现,温度敏感的smc6突变体在非允许温度下停止生长,并在S和G2/M期停滞,逐渐丧失活力。在允许温度下,smc6突变体细胞对包括甲基磺酸甲酯(MMS)在内的各种DNA损伤剂表现出比野生型细胞更高的敏感性。rad52 smc6突变体对MMS的敏感性类似于rad52单一突变体,这表明Smc6参与了需要Rad52功能的通路。此外,在smc6突变体细胞中没有观察到MMS诱导的染色体间重组和姐妹染色单体重组,而这些在野生型细胞中是可观察到的。这些结果表明Smc6在MMS诱导的染色体间重组和姐妹染色单体重组中发挥重要作用[6]。

SMC5和SMC6基因是维持基因组完整性的关键基因。研究发现,在酿酒酵母中,smc5-6和smc6-9突变体细胞在分裂过程中出现异常,导致重复区域的染色体分离受损,进而导致DNA损伤和RAD9依赖性Rad53蛋白激酶的激活。Smc5和Smc6蛋白在核糖体DNA(rDNA)和一些端粒区域富集。在Smc5-Smc6失活后,中期停滞的细胞在rDNA位点显示出X形DNA(Holliday连接)水平的增加。此外,RAD52的缺失部分抑制了smc5-6和smc6-9突变体的温度敏感性。这些结果表明SMC5-SMC6复合体在防止姐妹染色单体连接的形成中发挥作用,从而确保在后期染色体正确地分离[7]。

在2型糖尿病(T2DM)和非小细胞肺癌(NSCLC)中,SMC6基因的表达水平显著升高。研究发现,T2DM和NSCLC之间存在显著的关联,并且SMC6基因的表达水平与这两种疾病的发生发展密切相关。此外,SMC6基因的表达水平与免疫细胞的浸润程度相关,这表明SMC6基因可能在T2DM和NSCLC的发生发展中发挥着重要的免疫调节作用[8]。

在人类肉瘤中,SMC家族基因的表达水平显著高于正常组织。研究发现,SMC家族基因的表达水平与肉瘤的预后密切相关。SMC1A和SMC2的高表达与肉瘤的不良预后相关,而SMC3、SMC4、SMC5和SMC6的表达水平与肉瘤的预后没有显著相关性。这些结果表明SMC家族基因在肉瘤的发生发展中发挥重要作用,并且SMC1A和SMC2可能成为肉瘤的预后生物标志物[9]。

HIV-1是一种逆转录病毒,其在宿主细胞中复制过程中产生未整合的DNA,这些DNA受到宿主染色质沉默因子的转录沉默。研究发现,POLE3是一种转录抑制因子,可以维持未整合HIV-1DNA的沉默状态,防止RNA聚合酶II招募到病毒启动子上。POLE3和最近发现的宿主因子CAF1和SMC5/SMC6/SLF2对未整合HIV-1DNA的沉默具有特异性。POLE3的缺失会损害HIV-1的复制,这表明未整合HIV-1DNA的抑制对于病毒复制至关重要。POLE3通过维持未整合HIV-1DNA的沉默状态,确保HIV-1逃避初级CD4+ T细胞中的先天免疫感知[10]。

综上所述,Smc6基因在维持染色体的结构、参与DNA修复和同源重组等方面发挥重要作用。Smc6基因的突变可能导致多种生物学功能异常,包括葡萄糖耐量、造血、痛觉和全局基因表达模式的改变。此外,Smc6基因的表达水平在多种疾病中显著升高,包括癌症和糖尿病。这些研究结果揭示了Smc6基因在维持基因组完整性和疾病发生发展中的重要作用,并可能为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Ju, Limei, Wing, Jonathan, Taylor, Elaine, van der Horst, Gilbertus, Lehmann, Alan R. 2013. SMC6 is an essential gene in mice, but a hypomorphic mutant in the ATPase domain has a mild phenotype with a range of subtle abnormalities. In DNA repair, 12, 356-66. doi:10.1016/j.dnarep.2013.02.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23518413/
2. Dietlein, Felix, Wang, Alex B, Fagre, Christian, Neal, James T, Van Allen, Eliezer M. 2022. Genome-wide analysis of somatic noncoding mutation patterns in cancer. In Science (New York, N.Y.), 376, eabg5601. doi:10.1126/science.abg5601. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35389777/
3. Cho, Tiffany, Hoeg, Lisa, Setiaputra, Dheva, Durocher, Daniel. 2024. NFATC2IP is a mediator of SUMO-dependent genome integrity. In Genes & development, 38, 233-252. doi:10.1101/gad.350914.123. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38503515/
4. Verver, D E, van Pelt, A M M, Repping, S, Hamer, G. 2013. Role for rodent Smc6 in pericentromeric heterochromatin domains during spermatogonial differentiation and meiosis. In Cell death & disease, 4, e749. doi:10.1038/cddis.2013.269. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23907463/
5. Hwang, Ji-Young, Smith, Stephanie, Ceschia, Audrey, Aragon, Luis, Myung, Kyungjae. 2008. Smc5-Smc6 complex suppresses gross chromosomal rearrangements mediated by break-induced replications. In DNA repair, 7, 1426-36. doi:10.1016/j.dnarep.2008.05.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18585101/
6. Onoda, Fumitoshi, Takeda, Masahiro, Seki, Masayuki, Yagi, Hideki, Enomoto, Takemi. . SMC6 is required for MMS-induced interchromosomal and sister chromatid recombinations in Saccharomyces cerevisiae. In DNA repair, 3, 429-39. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15010319/
7. Torres-Rosell, Jordi, Machín, Félix, Farmer, Sarah, Dalgaard, Jacob Z, Aragón, Luis. 2005. SMC5 and SMC6 genes are required for the segregation of repetitive chromosome regions. In Nature cell biology, 7, 412-9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15793567/
8. Yuan, Qian, Li, Long, Wang, Liu-Shun, Xing, Shi-Gui. 2024. Epidemiological and transcriptome data identify shared gene signatures and immune cell infiltration in type 2 diabetes and non-small cell lung cancer. In Diabetology & metabolic syndrome, 16, 64. doi:10.1186/s13098-024-01278-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38468345/
9. Zhou, Jian, Wu, Gen, Tong, Zhongyi, Luo, Yingquan, Wang, Wanchun. 2020. Prognostic relevance of SMC family gene expression in human sarcoma. In Aging, 13, 1473-1487. doi:10.18632/aging.202455. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33460400/
10. Thenin-Houssier, Suzie, Machida, Shinichi, Jahan, Cyprien, Cuvier, Olivier, Benkirane, Monsef. 2023. POLE3 is a repressor of unintegrated HIV-1 DNA required for efficient virus integration and escape from innate immune sensing. In Science advances, 9, eadh3642. doi:10.1126/sciadv.adh3642. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37922361/