Naa40-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Naa40-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-20385

品系全称

C57BL/6JCya-Naa40em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-70999-Naa40-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Naa40-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-20385) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit
基因别称
4931433E08Rik,Nat11,NatD
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_027643 | Ensembl: ENSMUST00000025675
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~2.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1918249Mice homozygous for a conditional allele activated in hepatocytes exhibit protection from age-induced but not high fat diet-induced steatosis with altered lipid homeostasis.
NAA40,也称为N-α-乙酰转移酶40,是一种高度特异性的表观遗传酶,主要催化组蛋白H4和H2A的N端乙酰化反应。这种乙酰化修饰是组蛋白修饰的一种,对染色质结构和基因表达具有调控作用。NAA40的功能在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞生长、发育、代谢和疾病发生。

最近的研究表明,NAA40在多种癌症中发挥致癌作用。例如,在结直肠癌(CRC)细胞中,NAA40控制着一碳代谢的关键基因和相应的代谢物。通过其乙酰转移酶活性,NAA40调节甲硫氨酸循环,进而影响全基因组组蛋白甲基化和CRC细胞的存活。重要的是,NAA40介导的代谢重编程促进了CRC细胞对抗代谢化疗药物的抗性。在原发性CRC肿瘤中,NAA40的表达水平与胸苷酸合酶(TYMS)水平相关,而TYMS是5-氟尿嘧啶(5-FU)的靶点。NAA40通过防止抑制性H2A/H4S1ph在核周富集来激活TYMS的转录。这些发现揭示了NAA40介导的表观遗传学和细胞代谢之间的新型调控联系,癌细胞利用这种联系来逃避化疗[1]。

除了在癌症中的作用外,NAA40还与代谢相关疾病有关。例如,在肥胖患者中,NAA40的表达水平与胰岛素敏感性相关。在细胞实验中,NAA40的耗竭导致细胞内乙酰辅酶A水平显著升高,与脂质合成增强相关。脂质合成增加与甘油二酯和甘油三酯水平的升高一致,伴随着细胞质脂滴的积累和胰岛素信号传导的受损。此外,NAA40的耗竭在果蝇幼虫脂肪体中复制了脂质合成的诱导。这些发现表明,NAA40影响细胞内乙酰辅酶A的水平,进而影响脂质合成和胰岛素信号传导,可能与代谢性疾病有关[2]。

NAA40还通过控制蛋白精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)的表达来促进CRC的生长。PRMT5是一种组蛋白精氨酸甲基转移酶,参与组蛋白H4的对称二甲基化修饰。NAA40的敲低和N-乙酰化组蛋白H4(N-acH4)的缺失导致H4R3me2s水平的降低,这是通过转录下调PRMT5实现的。NAA40的耗竭和PRMT5的抑制导致关键致癌基因和抑癌基因的表达改变,进而抑制CRC细胞的生长。这些结果表明,NAA40在结肠癌的发生发展中发挥致癌作用,并支持其作为潜在治疗靶点的可能性[3]。

此外,NAA40在肝细胞癌(HCC)中的表达水平升高与患者的不良预后相关。NAA40的表达水平与HCC的T分期、病理分期、肿瘤状态和病理分级相关。有趣的是,NAA40的表达水平与免疫细胞(如DC细胞、中性粒细胞、NK细胞和T细胞)的浸润水平呈负相关。这表明NAA40可能通过调节免疫细胞浸润来影响HCC的发生发展。功能富集分析显示,NAA40影响的通路包括氧化磷酸化、外源代谢、胆汁酸代谢、脂肪酸代谢、G2M检查点和E2F靶点。这些发现使NAA40成为HCC预后预测和免疫治疗监测的潜在生物标志物[4]。

NAA40还通过其N-端乙酰转移酶活性在昆虫的变态发育中发挥重要作用。在红粉虫(Tribolium castaneum)中,NAA40的敲低导致幼虫发育停滞。蜕皮激素通过其受体EcR诱导NAA40的表达。有趣的是,蜕皮激素诱导的NAA40调节EcR的表达。NAA40乙酰化组蛋白H4蛋白,与蜕皮激素反应基因的启动子相关,如EcR、E74、E75和HR3,导致这些基因的表达增加。在没有蜕皮激素和NAA40的情况下,组蛋白H4的精氨酸甲基化由精氨酸甲基转移酶1(ART1)介导,抑制上述基因的表达。然而,在幼虫期末期,蜕皮激素水平的升高诱导NAA40,促进组蛋白H4的乙酰化,增加蜕皮激素反应基因的表达。这些发现突出了蜕皮激素诱导的NAA40介导的组蛋白乙酰化在变态发育调控中的关键作用[5]。

NAA40的耗竭在结直肠癌细胞中通过线粒体途径诱导p53非依赖性凋亡。NAA40的耗竭通过增强细胞凋亡来降低结直肠癌细胞(HCT116和HT-29)的存活率,而对非癌性小鼠胚胎成纤维细胞的细胞活力没有影响。NAA40的敲低在结直肠癌细胞中激活了线粒体caspase-9介导的细胞凋亡级联反应。NAA40耗竭对细胞死亡的影响是通过p53非依赖性机制介导的,因为p53基因敲除的HCT116细胞在NAA40耗竭后仍会发生细胞凋亡。这些发现揭示了NAA40的抗凋亡作用,并表明其在结直肠癌治疗中的潜在应用价值[6]。

此外,细胞质基因组DNA(cgDNA)可以作为天然的反义DNA发挥作用。在非应激条件下培养的细胞中,cgDNA(cg721)存在于细胞质中。cg721的过表达抑制了互补RNA的表达,而DNA/RNA杂交R环去除酶RNase H和三磷酸化修复外切酶1(TREX1)的敲低增加了cg721的表达水平,从而抑制了NAA40的转录和蛋白质表达,并产生了表型效应。此外,cgDNA被包裹到细胞外囊泡(EVs)中,EV来源的cg721抑制了受体细胞的基因表达。这些发现表明,cg721作为天然的反义DNA发挥作用,并在细胞分泌到细胞外作为EVs时在细胞间基因调控中发挥作用[7]。

NAA40的耗竭还通过促进NAA40的泛素化降解来抑制结直肠癌的生长。RNF112是一种环指蛋白,在人类肿瘤中发挥重要作用。RNF112的表达在CRC组织和细胞中显著降低。临床分析显示,RNF112表达水平与肿瘤大小、N分类和TNM分期显著相关。体外实验表明,RNF112的过表达抑制了细胞活力,促进了细胞周期阻滞和细胞凋亡,而敲低RNF112则具有相反的作用。裸鼠的肿瘤形成结果表明,RNF112的过表达通过抑制细胞生长和促进细胞凋亡来发挥抗肿瘤作用。机制上,Krüppel样因子4(KLF4)作为RNF112的上游调节因子,通过介导其转录来调节RNF112的表达。此外,还发现RNF112通过泛素连接酶活性促进泛素化降解致癌蛋白NAA40。此外,NAA40的过表达消除了RNF112过表达对CRC肿瘤发生的影响。这些发现证实了RNF112通过促进NAA40的泛素化降解来抑制CRC生长,揭示了KLF4-RNF112-NAA40轴在CRC中的作用机制[8]。

综上所述,NAA40是一种重要的N-α-乙酰转移酶,在多种生物学过程中发挥重要作用。NAA40在癌症、代谢相关疾病和昆虫变态发育中发挥作用,并影响免疫细胞浸润和细胞凋亡。此外,NAA40还通过影响细胞内乙酰辅酶A水平和组蛋白修饰来调控基因表达和细胞代谢。NAA40的研究有助于深入理解组蛋白乙酰化的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Demetriadou, Christina, Raoukka, Anastasia, Charidemou, Evelina, Tessarz, Peter, Kirmizis, Antonis. 2021. Histone N-terminal acetyltransferase NAA40 links one-carbon metabolism to chemoresistance. In Oncogene, 41, 571-585. doi:10.1038/s41388-021-02113-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34785778/
2. Charidemou, Evelina, Tsiarli, Maria A, Theophanous, Andria, Griffin, Julian L, Kirmizis, Antonis. 2022. Histone acetyltransferase NAA40 modulates acetyl-CoA levels and lipid synthesis. In BMC biology, 20, 22. doi:10.1186/s12915-021-01225-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35057804/
3. Demetriadou, Christina, Pavlou, Demetria, Mpekris, Fotios, Papageorgis, Panagiotis, Kirmizis, Antonis. 2019. NAA40 contributes to colorectal cancer growth by controlling PRMT5 expression. In Cell death & disease, 10, 236. doi:10.1038/s41419-019-1487-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30858358/
4. Zhou, Tong, Cao, Jun, Tang, Qingqin, Liang, Yuting, Feng, Bin. 2024. Exploring the role of NAA40 in immune infiltrates and prognostic prediction in hepatocellular carcinoma. In American journal of clinical and experimental immunology, 13, 26-34. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38496356/
5. Klavaris, Ariel, Kouma, Maria, Ozdemir, Cem, Koufaris, Costas, Kirmizis, Antonis. 2024. Biochemical Characterisation of the Short Isoform of Histone N-Terminal Acetyltransferase NAA40. In Biomolecules, 14, . doi:10.3390/biom14091100. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39334865/
6. Gaddelapati, Sharath Chandra, George, Smitha, Moola, Anilkumar, Sengodan, Karthi, Palli, Subba Reddy. 2024. N(alpha)-acetyltransferase 40-mediated histone acetylation plays an important role in ecdysone regulation of metamorphosis in the red flour beetle, Tribolium castaneum. In Communications biology, 7, 521. doi:10.1038/s42003-024-06212-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38702540/
7. Pavlou, Demetria, Kirmizis, Antonis. . Depletion of histone N-terminal-acetyltransferase Naa40 induces p53-independent apoptosis in colorectal cancer cells via the mitochondrial pathway. In Apoptosis : an international journal on programmed cell death, 21, 298-311. doi:10.1007/s10495-015-1207-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26666750/
8. Asada, Ken, Ito, Keiya, Yui, Daishi, Tagaya, Hirokuni, Yokota, Takanori. 2018. Cytosolic Genomic DNA functions as a Natural Antisense. In Scientific reports, 8, 8551. doi:10.1038/s41598-018-26487-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29867148/