Btaf1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Btaf1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-20096

品系全称

C57BL/6JCya-Btaf1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-107182-Btaf1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Btaf1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-20096) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1
基因别称
E430027O22Rik,TAF170
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001080706 | Ensembl: ENSMUST00000099494
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2147538Embryos homozygous for a gene-trapped allele display growth retardation. Embryos homozygous for an ENU-induced allele show growth retardation, edema, abnormal blood circulation, myocardial trabeculae hypoplasia, and delayed head and brain development.
Btaf1,也称为B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1,是一种高度保守的基因,在哺乳动物细胞中编码一个与酵母MOT1同源的SNF2-like ATPase蛋白。Btaf1在基因转录过程中发挥着重要作用,它与TATA-box结合蛋白(TBP)相互作用,形成B-TFIID复合物,进而参与RNA聚合酶II转录基因的核心启动子结合。Btaf1-TBP相互作用对于TBP-启动子相互作用的动力学具有至关重要的影响。

Btaf1基因突变会导致胚胎发育异常。一项研究发现,小鼠Btaf1基因中存在一个ENU诱导的点突变,导致BTAF1 ATPase结构域的氨基酸替代。携带这种突变的小鼠胚胎在胚胎发育的早期阶段形态上正常,但在胚胎第9天和第10.5天之间出现生长停滞和水肿,最终导致死亡。体外分析表明,这种突变的蛋白质稳定性降低,并且释放TBP从染色质中的功能受损,但与TBP结合的功能仍然正常[1]。

Btaf1和其酵母同源蛋白Mot1p在RNA聚合酶II转录调控中发挥着重要作用。它们能够通过ATP水解的能量解离TBP从TATA DNA复合物中,从而影响TBP在RNA聚合酶II启动子上的动态功能。最近的研究揭示了Btaf1和Mot1p作为TBP功能的正调节因子的新方面,并描述了它们分子作用的机制[2]。

在哺乳动物细胞中,TBP与染色质的相互作用受到动态调节。一项研究发现,Btaf1和NC2复合物共同影响TBP的解离速率,而不会改变其结合速率。Btaf1和NC2主要影响TBP和NC2与活性启动子的结合。这些结果表明,Btaf1介导了TBP-NC2复合物从染色质上的释放[3]。

在果蝇中,Btaf1的同源蛋白Helicase89B在免疫反应中发挥作用。研究发现,Helicase89B是果蝇幼虫诱导性抗菌反应所必需的。Helicase89B属于Mot1p/BTAF1亚家族的SNF2-like ATPases,可以与TBP相互作用。研究还发现,Helicase89B是Toll和免疫缺陷(IMD)信号通路下游的基因表达的正调节因子,它能够激活抗菌肽基因的表达[4]。

Btaf1与TBP的相互作用受到多种因素的调节。一项研究发现,Btaf1与TBP的相互作用受到TBP中凹面、DNA结合表面上的残基的调控。此外,Btaf1还可以与TBP上的第二螺旋侧面的残基相互作用。Btaf1可以显著改变TBP的TATA-box结合特异性,使其能够招募DNA结合缺陷的TBP突变体与TATA-containing和TATA-less DNA结合。这表明Btaf1在TBP相互作用中发挥着重要的调控作用[5]。

基因转录是一个复杂的调控过程,涉及多种转录因子和共激活因子。一项综述文章详细介绍了基因转录机器和共激活因子的作用。其中,Btaf1作为一种共激活因子,可以与TBP或TFIID结合,进而影响基因转录的调控。Btaf1可以通过与TBP或TFIID的相互作用,调节基因表达和细胞类型特异性转录[6]。

TBP的O-GlcNAcylation修饰在基因转录调控中发挥着重要作用。一项研究发现,TBP在T114位点的O-GlcNAcylation修饰可以阻断其与Btaf1的相互作用,从而影响B-TFIID复合物的形成。缺乏O-GlcNAcylation修饰的TBP会导致细胞代谢的重编程和基因表达的改变。这些结果表明,TBP的O-GlcNAcylation修饰在基因转录调控和细胞代谢中发挥着重要的调控作用[7]。

在状态癫痫中,Btaf1的表达水平发生改变。一项研究发现,在C57BL/6小鼠的状态癫痫模型中,Btaf1的表达水平上调。此外,Btaf1还与其他基因和长链非编码RNA(lncRNA)相互作用,形成竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。这些结果表明,Btaf1在状态癫痫的发生和发展中发挥着重要作用[8]。

在阿尔茨海默病(AD)小鼠模型中,Btaf1的表达水平发生改变。一项研究发现,在AppNL-G-F小鼠模型中,Btaf1的表达水平下调。进一步的研究发现,Btaf1的表达水平下调与PDE4B亚型特异性抑制的神经保护作用相关。这些结果表明,Btaf1在AD的发生和发展中发挥着重要作用[9]。

Th9细胞是一种新型Th细胞亚群,其分化受到多种基因和信号的调控。一项研究发现,Btaf1在Th2细胞向Th9细胞的分化过程中发挥着重要作用。Btaf1的编码基因在Th2细胞向Th9细胞分化的过程中发生表达水平的变化。这些结果表明,Btaf1在Th9细胞的分化和功能中发挥着重要作用[10]。

综上所述,Btaf1作为一种重要的转录因子,在基因转录调控和细胞功能中发挥着重要作用。Btaf1与TBP的相互作用对于TBP-启动子相互作用的动力学具有至关重要的影响。Btaf1的突变会导致胚胎发育异常,并且在多种疾病中发挥重要作用。此外,Btaf1还与其他基因和信号通路相互作用,形成复杂的调控网络。对Btaf1的研究有助于深入理解基因转录调控的机制和疾病发生发展的过程,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wansleeben, Carolien, van Gurp, Léon, de Graaf, Petra, Marc Timmers, H Th, Meijlink, Frits. 2011. An ENU-induced point mutation in the mouse Btaf1 gene causes post-gastrulation embryonic lethality and protein instability. In Mechanisms of development, 128, 279-88. doi:10.1016/j.mod.2011.03.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21419221/
2. Pereira, Lloyd A, Klejman, Marcin P, Timmers, H Th Marc. . Roles for BTAF1 and Mot1p in dynamics of TATA-binding protein and regulation of RNA polymerase II transcription. In Gene, 315, 1-13. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14557059/
3. de Graaf, Petra, Mousson, Florence, Geverts, Bart, Houtsmuller, Adriaan B, Timmers, H Th Marc. 2010. Chromatin interaction of TATA-binding protein is dynamically regulated in human cells. In Journal of cell science, 123, 2663-71. doi:10.1242/jcs.064097. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20627952/
4. Yagi, Yoshimasa, Ip, Y Tony. 2005. Helicase89B is a Mot1p/BTAF1 homologue that mediates an antimicrobial response in Drosophila. In EMBO reports, 6, 1088-94. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16200050/
5. Klejman, Marcin P, Zhao, Xuemei, van Schaik, Frederik M A, Herr, Winship, Timmers, H Th Marc. 2005. Mutational analysis of BTAF1-TBP interaction: BTAF1 can rescue DNA-binding defective TBP mutants. In Nucleic acids research, 33, 5426-36. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16179647/
6. Thomas, Mary C, Chiang, Cheng-Ming. . The general transcription machinery and general cofactors. In Critical reviews in biochemistry and molecular biology, 41, 105-78. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16858867/
7. Hardivillé, Stéphan, Banerjee, Partha S, Selen Alpergin, Ebru S, Wolfgang, Michael J, Hart, Gerald W. 2019. TATA-Box Binding Protein O-GlcNAcylation at T114 Regulates Formation of the B-TFIID Complex and Is Critical for Metabolic Gene Regulation. In Molecular cell, 77, 1143-1152.e7. doi:10.1016/j.molcel.2019.11.022. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31866147/
8. Lin, Yaojing, Wen, Hanyu, Yang, Bin, Wang, Chunhua, Liang, Risheng. 2023. Integrated bioinformatics and validation to construct lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA network in status epilepticus. In Heliyon, 9, e22205. doi:10.1016/j.heliyon.2023.e22205. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38074882/
9. Armstrong, Paul, Güngör, Hüseyin, Anongjanya, Pariya, Dawson, Neil, Clapcote, Steven J. 2024. Protective effect of PDE4B subtype-specific inhibition in an App knock-in mouse model for Alzheimer's disease. In Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology, 49, 1559-1568. doi:10.1038/s41386-024-01852-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38521860/
10. Khokhar, Manoj, Purohit, Purvi, Gadwal, Ashita, Bajpai, Nitin Kumar, Shukla, Ravindra. 2023. The Differentially Expressed Genes Responsible for the Development of T Helper 9 Cells From T Helper 2 Cells in Various Disease States: Immuno-Interactomics Study. In JMIR bioinformatics and biotechnology, 4, e42421. doi:10.2196/42421. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38935935/