Cib3-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Cib3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-20079

品系全称

C57BL/6JCya-Cib3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-234421-Cib3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Cib3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-20079) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
calcium and integrin binding family member 3
基因别称
C730014M21Rik,Gm1107,KIP3
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001080812 | Ensembl: ENSMUST00000098630
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~2.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2685953Mice homozygous for a null allele display impaired balance with age and vestibular hair cell loss with age.
CIB3,即钙和整合素结合蛋白3,是一种在多个生物学过程中发挥重要作用的蛋白质。CIB蛋白家族包括CIB1、CIB2、CIB3和CIB4等成员,这些蛋白质在细胞信号传导、基因表达调控和细胞骨架组织中发挥着重要作用。

在植物中,CIB3基因参与了光周期开花的光调控。研究表明,拟南芥中的CRY2和FKF1是蓝光受体,它们介导了光对生长和发育的调节,包括光周期开花。CRY2在蓝光刺激下与CIB1相互作用,激活开花整合子基因FLOWERING LOCUS T(FT)的转录。CIB1、CIB2、CIB4和CIB5在CRY2依赖的方式下功能冗余,促进开花,并形成各种异源二聚体以结合FT启动子中的非规范E-box序列。然而,CIB3的功能尚未被描述。研究发现,CIB3独立于CRY2促进光周期开花。此外,CIB3不与CRY2相互作用,但与CIB1相互作用,并协同CIB1促进GI基因的转录。FKF1对于CIB3促进开花是必需的,并且增强了CIB1-CIB3在蓝光刺激下的相互作用[1]。

在动物中,CIB4基因的表达具有组织特异性,仅在Kermani绵羊的睾丸中表达。CIB4基因的cDNA核苷酸序列与小尾寒羊、牛、山羊、骆驼、马、狗、小鼠和人类的cDNA核苷酸序列分别具有100、99、99、98、98、96、96和96%的相似性。这表明CIB4基因可能在雄性生育中发挥作用。基于系统发育分析,绵羊CIB4基因与山羊和牛的关系最密切,然后与骆驼和鲸鱼的关系较远。虽然已经证明CIB4是一种睾丸特异性基因,仅表达于睾丸,并与其他蛋白质相互作用,但CIB4表达调控的机制仍需进一步阐明[2]。

在听力研究中,CIB3基因在斑马鱼的内耳毛细胞中表达。研究发现,CIB3和TMC1/2家族成员在斑马鱼毛细胞中的表达存在显著的区域差异。TMC1、TMC2b和CIB3主要在周围或外突毛细胞中表达,而TMC2a和CIB2则在内突毛细胞中富集。这些结果表明,这些成分的特定组合可能优化了内耳不同类型感觉受体对机械刺激的反应[3]。

在哺乳动物中,CIB4基因对精子发生中的单倍体阶段至关重要。研究发现,CIB4在小鼠和人睾丸中表达强烈,并在小鼠精子发生的单倍体阶段开始表达。通过CRISPR/Cas9系统生成的Cib4敲除小鼠由于单倍体分化受损而表现出不育,这与Cib1敲除小鼠相似。从输精管分离的精子发生细胞表明,CIB4在精子头部顶端的形成中起着至关重要的作用。CIB4功能的进一步分析可能揭示由精子发生缺陷引起的男性不育的病因学,并且由于CIB4在睾丸中的优势表达,CIB4可能是男性避孕药的靶标[4]。

此外,CIB1基因在绵羊中广泛表达于不同组织,在睾丸中的表达水平最高,这表明CIB1可能在公羊的生育中发挥作用。绵羊CIB1基因由七个外显子组成。定量PCR(Q-PCR)显示,CIB1在睾丸中的表达水平最高,这表明CIB1可能在公羊的生育中发挥作用。此外,绵羊CIB2、CIB3和CIB4基因的表达模式也在不同组织中进行了检测[5]。

在听力研究中,毛细胞转导复合物的组成是听觉和前庭科学家研究的主要兴趣。过去二十年见证了这一领域的一些重大进展,出现了大量证据,表明至少有十几个不同的分子成分与转导机制有关。然而,这个集合体中的各个部分是如何协调一致地工作的,以及它们如何在分子、结构和生物物理水平上相互作用,以开启机械敏感通道并启动内耳的感官转导,尚未得到阐明。一项综述总结了2021年耳鼻喉科研究协会年度冬季会议上的一个研讨会,该研讨会聚集了来自该领域内外的最新见解,以检查转导复合物各个组成部分的结构、特性和相互作用。该综述包括对历史背景的简要回顾,为后续的讨论奠定基础,重点关注CDH23、PCDH15、LHFPL5、TMIE、TMC1/2和CIB2/3等蛋白质的结构、特性和相互作用。该综述旨在向读者展示该领域思想多样性的同时,突出新兴的理论和概念[6]。

在德国人群中,对韧性进行全基因组研究的荟萃分析发现,CIB3基因与韧性相关。韧性是指适应压力性生活事件的能力。该研究发现,基因水平的分析确定了三个与韧性相关的基因(ROBO1、CIB3和LYPD4),以及32个潜在的候选基因。网络分析揭示了与神经元增殖和分化、突触组织、免疫反应和血管稳态相关的生物学途径的富集。此外,还发现RS-11与神经质和总体幸福感的polygenic scores(PGSs)之间存在显著相关性。这些观察结果表明,韧性的遗传力较低。为了揭示塑造韧性的遗传因素,需要大型、国际性的努力。然而,作为迄今为止对一般人群韧性遗传学进行的最大规模调查,这项研究已经为韧性潜在的生物学基础以及韧性与其他人格特征和心理健康之间的关系提供了有价值的见解[7]。

在斑马鱼和哺乳动物的内耳毛细胞中,CIB3基因的表达存在显著差异。研究发现,斑马鱼和哺乳动物的内耳毛细胞在转录组水平上存在显著差异。TMC2和CIB3在成年小鼠毛细胞中未检测到,但在斑马鱼毛细胞中高度表达。小鼠毛细胞表达Kcna10、Kcnj13、Kcnj16和Kcnq4,这些在斑马鱼毛细胞中未检测到。chrna9和chrna10在小鼠毛细胞中表达。然而,chrna10在斑马鱼毛细胞中未检测到。OHCs高度表达Slc26a5,编码运动蛋白prestin,该蛋白有助于OHC的电动力。然而,斑马鱼毛细胞中slc26a5的表达较弱,并且在测量时没有电压依赖的电动力。值得注意的是,斑马鱼毛细胞表达更多的旁系同源基因,包括与毛细胞特异性功能和转录活性相关的基因,尽管目前尚不清楚它们是否具有与其哺乳动物同源物相似的功能。该数据集还包括几个蛋白质编码基因,以进一步表征毛细胞的功能和毛细胞进化的研究,从非哺乳动物到哺乳动物[8]。

综上所述,CIB3基因在植物和动物中发挥着多种生物学功能。在植物中,CIB3参与了光周期开花的光调控。在动物中,CIB3基因在生殖和听力中发挥重要作用。CIB3基因的表达和功能在不同物种和组织中存在差异,这表明CIB3基因在生物学过程中具有重要的调控作用。未来的研究可以进一步探索CIB3基因在不同生物学过程中的作用机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhou, Lianxia, Lu, Yi, Huang, Jie, Gao, Jie, Bian, Mingdi. . Arabidopsis CIB3 regulates photoperiodic flowering in an FKF1-dependent way. In Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 85, 765-774. doi:10.1093/bbb/zbaa120. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33686404/
2. Mohammadabadi, M R, Jafari, A H D, Bordbar, F. 2017. Molecular analysis of CIB4 gene and protein in Kermani sheep. In Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas, 50, e6177. doi:10.1590/1414-431X20176177. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28902924/
3. Smith, Eliot T, Sun, Peng, Yu, Shengyang Kevin, Raible, David W, Nicolson, Teresa. 2023. Differential expression of mechanotransduction complex genes in auditory/vestibular hair cells in zebrafish. In Frontiers in molecular neuroscience, 16, 1274822. doi:10.3389/fnmol.2023.1274822. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38035267/
4. Xu, Zoulan, Miyata, Haruhiko, Kaneda, Yuki, Matzuk, Martin M, Ikawa, Masahito. . CIB4 is essential for the haploid phase of spermatogenesis in mice†. In Biology of reproduction, 103, 235-243. doi:10.1093/biolre/ioaa059. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32430498/
5. Yu, Yan, Song, Xuemei, Du, Lixin, Wang, Chuduan. 2008. Molecular characterization of the sheep CIB1 gene. In Molecular biology reports, 36, 1799-809. doi:10.1007/s11033-008-9383-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18989754/
6. Holt, Jeffrey R, Tobin, Mélanie, Elferich, Johannes, Ahmed, Zubair M, Nicolson, Teresa. 2021. Putting the Pieces Together: the Hair Cell Transduction Complex. In Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO, 22, 601-608. doi:10.1007/s10162-021-00808-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34617206/
7. Herrera-Rivero, Marisol, Garvert, Linda, Horn, Katrin, Baune, Bernhard T, Berger, Klaus. 2024. A meta-analysis of genome-wide studies of resilience in the German population. In Molecular psychiatry, 30, 497-505. doi:10.1038/s41380-024-02688-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39112778/
8. Giffen, Kimberlee P, Liu, Huizhan, Yamane, Kacey L, Zallocchi, Marisa, He, David Z Z. 2024. Molecular Specializations Underlying Phenotypic Differences in Inner Ear Hair Cells of Zebrafish and Mice. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.05.24.595729. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38826418/