Tincr-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Tincr-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-19933

品系全称

C57BL/6JCya-Tincrem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-100504425-Tincr-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tincr-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-19933) were purchased from Cyagen.
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性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TINCR ubiquitin domain containing
基因别称
Gm20219
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001396444 | Ensembl: ENSMUST00000209718
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:5012404Mice homozygous for a null allele exhibit reduced wound recovery and decreased keratinocyte proliferation.
TINCR,也称为TINCR ubiquitin-like microprotein,是一种编码短链非编码RNA的基因,其表达主要在表皮组织中。TINCR基因最初被认为是编码长链非编码RNA(lncRNA),但最近的研究表明,该基因实际上编码了一种高度保守的泛素样微蛋白。这种微蛋白与角化细胞的分化密切相关,并且在皮肤和头颈鳞状细胞癌(SCC)中起着肿瘤抑制的作用。TINCR的表达在UV诱导的DNA损伤中以TP53依赖的方式上调,在人类角质细胞中具有保护作用。在皮肤和头颈鳞状细胞肿瘤中,TINCR蛋白的表达普遍降低,并且其表达抑制了SCC细胞在体外和体内的生长。此外,在SCC的临床样本中,TINCR基因的失活突变和缺失被鉴定,支持了其作为肿瘤抑制基因在人类癌症中的作用[1]。

TINCR基因的表达与多种癌症的发生、发展和预后相关。研究发现,TINCR的表达与肿瘤大小、侵袭、转移和患者总生存期相关。在多种癌症中,TINCR的表达水平与肿瘤的恶性程度和患者的预后呈正相关。例如,在膀胱癌中,TINCR的表达水平与膀胱癌的易感性风险相关。研究发现,TINCR基因的SNP位点rs2288947和rs8113645与膀胱癌的易感性风险相关,并且这两个SNP位点与TINCR的表达水平相关。此外,TINCR的表达水平与miR-1247-3p和miR-30c-2-3p的表达水平呈负相关,表明TINCR可能通过miRNA调控途径影响膀胱癌的发生和发展[3]。

TINCR基因的表达还与结肠癌的发展相关。研究发现,lncRNA TINCR在结肠癌组织中显著上调,并且其表达与患者的临床病理特征和预后相关。lncRNA TINCR的敲低抑制了结肠癌细胞的增殖和侵袭,并增加了细胞凋亡。此外,lncRNA TINCR的敲低还增加了自噬水平,表明TINCR可能通过调节自噬影响结肠癌的发生和发展[2]。

TINCR基因的表达还与鼻咽癌的发生和发展相关。研究发现,lncRNA TINCR在鼻咽癌组织中显著上调,并且其表达与患者的预后相关。lncRNA TINCR的沉默抑制了鼻咽癌的进展和顺铂耐药性。此外,TINCR还与ACLY相互作用,保护ACLY免受泛素降解,从而维持细胞内乙酰辅酶A的水平。细胞内乙酰辅酶A的积累促进了从头脂质生物合成和组蛋白H3K27乙酰化,进而调控PADI1-MAPK-MMP2/9信号通路。这些发现表明,TINCR在鼻咽癌的进展和化疗耐药中起着关键作用,并且TINCR-ACLY-PADI1-MAPK-MMP2/9轴可能是鼻咽癌治疗的一个潜在靶点[4]。

TINCR基因的表达还与心脏肥大相关。研究发现,lncRNA TINCR在心脏肥大模型中下调,而miR-211-3p上调。TINCR作为miR-211-3p的竞争性内源性RNA(ceRNA),通过竞争性结合miR-211-3p,增强了VEGFB的表达,并激活了VEGFB-SDF-1α-CXCR4信号通路。此外,TINCR的过表达通过靶向miR-211-3p-VEGFB-SDF-1α-CXCR4信号通路抑制了心脏肥大的发生。这些发现表明,TINCR通过调节miR-211-3p-VEGFB-SDF-1α-CXCR4信号通路改善了心脏肥大,可能成为治疗心脏肥大的潜在靶点[5]。

TINCR基因的表达还与肝细胞癌的发生和发展相关。研究发现,TINCR在肝细胞癌组织和肝癌细胞中高表达,并且其表达与肝癌细胞自我更新和肿瘤发生相关。TINCR通过与多嘧啶区结合蛋白1(PTBP1)相互作用,进一步促进了自噬相关基因ATG5的转录活性。这些发现表明,TINCR通过自噬激活和PTBP1/ATG5调控通路调节肝癌细胞自我更新,可能成为肝细胞癌治疗的一个潜在靶点[6]。

综上所述,TINCR基因编码的泛素样微蛋白在多种生物学过程中发挥重要作用,包括肿瘤抑制、癌症发生、发展和预后、心脏肥大和肝细胞癌。TINCR的表达与多种疾病的病理过程相关,并且其调控机制涉及miRNA调控途径、自噬和信号通路等。TINCR的研究有助于深入理解其在疾病发生和发展中的作用机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Morgado-Palacin, Lucia, Brown, Jessie A, Martinez, Thomas F, Saghatelian, Alan, Ferrando, Adolfo A. 2023. The TINCR ubiquitin-like microprotein is a tumor suppressor in squamous cell carcinoma. In Nature communications, 14, 1328. doi:10.1038/s41467-023-36713-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36899004/
2. Xu, Jianhua, Zeng, Wenge, Liu, Tiantian, Chen, Jun, Liu, Fei. 2023. lncRNA TINCR knockdown inhibits colon cancer cells via regulation of autophagy. In Food science & nutrition, 11, 1965-1981. doi:10.1002/fsn3.3231. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37051356/
3. Xu, Chuanbing, Liu, Min, Jia, Dongsheng, Tao, Tingting, Hao, Dongfang. 2020. lncRNA TINCR SNPs and Expression Levels Are Associated with Bladder Cancer Susceptibility. In Genetic testing and molecular biomarkers, 25, 31-41. doi:10.1089/gtmb.2020.0178. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33372851/
4. Zheng, Zi-Qi, Li, Zhi-Xuan, Guan, Jia-Li, Liu, Na, Sun, Ying. 2020. Long Noncoding RNA TINCR-Mediated Regulation of Acetyl-CoA Metabolism Promotes Nasopharyngeal Carcinoma Progression and Chemoresistance. In Cancer research, 80, 5174-5188. doi:10.1158/0008-5472.CAN-19-3626. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33067266/
5. Tu, Shan, Wang, Xiao-Yan, Zeng, Li-Xiong, Shen, Zhi-Jie, Zhang, Zhi-Hui. 2021. LncRNA TINCR improves cardiac hypertrophy by regulating the miR-211-3p-VEGFB-SDF-1α-CXCR4 pathway. In Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology, 102, 253-262. doi:10.1038/s41374-021-00678-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34732848/
6. Shi, Jing, Guo, Cao, Li, Yang, Ma, Junli. 2022. The long noncoding RNA TINCR promotes self-renewal of human liver cancer stem cells through autophagy activation. In Cell death & disease, 13, 961. doi:10.1038/s41419-022-05424-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36385098/