Tbc1d22a-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Tbc1d22a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-19477

品系全称

C57BL/6JCya-Tbc1d22aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-223754-Tbc1d22a-B6J-VC

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tbc1d22a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-19477) were purchased from Cyagen.
交付类型
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基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TBC1 domain family, member 22a
基因别称
D15Ertd781e
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_145476 | Ensembl: ENSMUST00000063414
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Tbc1d22a,全称为TBC1 domain family member 22A,是一种具有GTPase-activating protein (GAP)活性的蛋白质,属于TBC1家族成员。TBC1家族成员通常参与调节Rab家族蛋白的活性,Rab家族蛋白是一类小的GTP酶,在细胞内的膜转运过程中发挥重要作用。TBC1D22A在细胞内的功能可能涉及细胞膜运输、信号转导和细胞骨架组织等过程。此外,TBC1D22A的表达和功能可能与多种生物学过程和疾病相关。

在卵巢癌中,Tbc1d22a的表达水平被发现与预后相关。研究表明,Tbc1d22a在卵巢浆液性囊腺癌(OSC)中的表达升高,并且高表达与患者的总生存期(OS)、无进展生存期(PFS)、疾病特异性生存期(DSS)和无病生存期(DFS)较差相关[1]。此外,Tbc1d22a的表达与M2巨噬细胞浸润和大多数免疫检查点基因的表达呈正相关。这些发现表明,Tbc1d22a可能参与调节卵巢癌的免疫微环境和免疫逃逸机制。

在Phelan-McDermid综合征(PMS)中,Tbc1d22a的基因区域被发现与癫痫的发生率显著相关。研究发现,在22q13.31区域的一个3 Mb基因区域中,包括Tbc1d22a基因,与癫痫的发生率相关。此外,PMS患者中癫痫的发生率与SHANK3基因的突变和基因缺失的大小相关[2]。这些发现提示Tbc1d22a可能参与了PMS中癫痫的发生机制,并与其他基因相互作用。

在肝细胞癌(HCC)中,Tbc1d22a基因的拷贝数变异(CNV)被发现与肝细胞生长调节相关。研究发现,在HCC组织中,Tbc1d22a基因存在较高的CNV频率,包括基因缺失和基因扩增。这些发现表明Tbc1d22a基因可能参与了HCC的发生和发展,并与其他基因一起调节肝细胞的生长和再生过程[3]。

在双胞胎的形成过程中,Tbc1d22a基因被发现与双胞胎的特征相关。研究发现,在四代家系中,Tbc1d22a基因携带了与双胞胎形成相关的特异性SNVs。此外,Tbc1d22a基因还参与了GTPase家族介导的信号通路。这些发现提示Tbc1d22a基因可能参与了双胞胎形成的遗传机制,并与其他基因相互作用[4]。

在肥胖相关表型中,Tbc1d22a基因的标记物被发现与腰围相关。研究发现,在基因组范围内连锁扫描和区域关联研究中,Tbc1d22a基因的标记物rs16996195与腰围相关。此外,在女性中,Tbc1d22a基因的标记物与腰围也显示出显著的关联。这些发现提示Tbc1d22a基因可能参与了肥胖的发生机制,并与其他基因相互作用[5]。

在慢性静脉疾病(CVD)中,Tbc1d22a基因被确定为miRNA的生物标志物。研究发现,Tbc1d22a基因是miRNA的靶基因,与CVD的发生和发展相关。此外,Tbc1d22a基因还参与了GTPase家族介导的信号通路。这些发现提示Tbc1d22a基因可能参与了CVD的发生机制,并与其他基因相互作用[6]。

在HIV相关痴呆和HIV脑炎II中,Tbc1d22a基因被发现表达在个体微分离的Globus pallidus神经元中。研究发现,Tbc1d22a基因在HIV相关痴呆、HIV脑炎II、HIV阳性但无HAD或HIVE的病例中具有不同的基因表达谱。这些发现提示Tbc1d22a基因可能参与了HIV相关神经病变的发生机制[7]。

在遗传性癫痫伴发热惊厥(GEFS+)中,Tbc1d22a基因被发现与癫痫的发生相关。研究发现,在22q13.31区域的一个527 kb基因区域中,包括Tbc1d22a基因,与癫痫的发生相关。此外,Tbc1d22a基因的微卫星标记在受影响的个体中是同源纯合的,而在健康的家庭成员中是杂合的。这些发现提示Tbc1d22a基因可能是GEFS+的一个新的基因座[8]。

综上所述,Tbc1d22a基因是一种具有GTPase-activating protein (GAP)活性的蛋白质,参与调节Rab家族蛋白的活性。Tbc1d22a基因的表达和功能与多种生物学过程和疾病相关,包括卵巢癌、Phelan-McDermid综合征、肝细胞癌、双胞胎形成、肥胖相关表型、慢性静脉疾病、HIV相关痴呆和HIV脑炎II以及遗传性癫痫伴发热惊厥。Tbc1d22a基因的研究有助于深入理解这些生物学过程和疾病的发病机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Lv, Xiaofeng, Gong, Ruyue, Guo, Lili, Wang, Changyu. 2024. High Expression of TBC1 Domain Family Member 22A is Related to Poor Prognosis in Ovarian Serous Cystadenocarcinoma. In International journal of medical sciences, 21, 2603-2612. doi:10.7150/ijms.99744. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39439452/
2. Jain, Lavanya, Oberman, Lindsay M, Beamer, Laura, Sarasua, Sara M, Boccuto, Luigi. 2021. Genetic and metabolic profiling of individuals with Phelan-McDermid syndrome presenting with seizures. In Clinical genetics, 101, 87-100. doi:10.1111/cge.14074. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34664257/
3. Nalesnik, Michael A, Tseng, George, Ding, Ying, Michalopoulos, George K, Luo, Jian-Hua. 2012. Gene deletions and amplifications in human hepatocellular carcinomas: correlation with hepatocyte growth regulation. In The American journal of pathology, 180, 1495-508. doi:10.1016/j.ajpath.2011.12.021. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22326833/
4. Liu, Shiqi, Hong, Yaqiang, Cui, Kai, Zhang, Dake, Hu, Dawei. 2018. Four-Generation Pedigree of Monozygotic Female Twins Reveals Genetic Factors in Twinning Process by Whole-Genome Sequencing. In Twin research and human genetics : the official journal of the International Society for Twin Studies, 21, 361-368. doi:10.1017/thg.2018.41. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30064533/
5. Liu, Angela Y, Gu, Dongfeng, Hixson, James E, He, Jiang, Kelly, Tanika N. 2013. Genome-wide linkage and regional association study of obesity-related phenotypes: the GenSalt study. In Obesity (Silver Spring, Md.), 22, 545-56. doi:10.1002/oby.20469. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23526746/
6. Barrera-Vázquez, Oscar Salvador, Escobar-Ramírez, Juan Luis, Magos-Guerrero, Gil Alfonso. 2024. Network Pharmacology Approaches Used to Identify Therapeutic Molecules for Chronic Venous Disease Based on Potential miRNA Biomarkers. In Journal of xenobiotics, 14, 1519-1540. doi:10.3390/jox14040083. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39449424/
7. Shapshak, Paul, Duncan, Robert, Kangueane, Pandajarasamme, Singer, Elyse, Levine, Andrew. 2011. HIV associated dementia and HIV encephalitis II: Genes on chromosome 22 expressed in individually microdissected Globus pallidus neurons (Preliminary analysis). In Bioinformation, 6, 183-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21738310/
8. Belhedi, Nejla, Bena, Frédérique, Mrabet, Amel, Malafosse, Alain, Salzmann, Annick. 2013. A new locus on chromosome 22q13.31 linked to recessive genetic epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+) in a Tunisian consanguineous family. In BMC genetics, 14, 93. doi:10.1186/1471-2156-14-93. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24067191/