Padi1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Padi1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-19288

品系全称

C57BL/6JCya-Padi1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-18599-Padi1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Padi1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-19288) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
peptidyl arginine deiminase, type I
基因别称
Pdi1
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_011059 | Ensembl: ENSMUST00000026378
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
PADI1,也称为肽基精氨酸脱亚氨酶1,是肽基精氨酸脱亚氨酶(PADs)家族的成员之一。PADs是一类能够将蛋白质中的精氨酸残基转化为瓜氨酸残基的钙依赖性酶。PADI1主要在皮肤和子宫组织中表达,尤其在角质形成细胞中含量较高。PADI1的功能包括调节蛋白质的翻译后修饰,参与免疫反应,以及影响染色质结构和基因表达。

在皮肤中,PADI1通过催化角蛋白的瓜氨酸化,促进角质形成细胞的分化和皮肤屏障的形成。研究发现,PADI1的表达受到钙离子浓度和转录因子的调控,其中MZF1和Sp1/Sp3的结合对PADI1的转录具有重要作用[2]。此外,维生素D受体(VDR)也被证明可以与β-catenin相互调节,共同促进PADI1的表达,从而影响皮肤细胞的增殖和分化[6]。

除了在皮肤中的作用,PADI1还在胚胎发育过程中发挥重要作用。研究发现,PADI1介导的组蛋白瓜氨酸化对早期胚胎发育至关重要。在2-和4-细胞胚胎中,PADI1的缺失或抑制会导致组蛋白尾部的瓜氨酸化水平显著降低,从而抑制胚胎的转录活性和细胞增殖[3]。

在癌症中,PADI1的表达和活性也受到关注。研究发现,PADI1在结直肠癌组织中高表达,并且与患者的预后相关。PADI1的表达水平与患者的年龄、性别、T分期、N分期、M分期以及临床分期有关。此外,PADI1的表达还与结直肠癌的免疫微环境相关,低表达组的免疫评分更高,并且CD4+ T细胞、辅助性T细胞和嗜酸性粒细胞的浸润程度更高[1]。此外,PADI1还参与了癌症细胞的糖酵解过程。研究发现,PADI1和PADI3的表达受到CHD4的调控,并且PADI1和PADI3可以催化糖酵解酶PKM2的瓜氨酸化,从而影响糖酵解和细胞增殖[4]。

除了PADI1,其他PADs家族成员如PADI2、PADI3、PADI4和PADI6也受到研究。研究发现,PADs家族成员在慢性疾病中也发挥重要作用。例如,PADI1至PADI4和PADI6的编码基因中的变异与类风湿性关节炎和间质性肺病等慢性疾病的发生和进展相关[5]。

综上所述,PADI1是一种重要的PADs家族成员,参与调节蛋白质的翻译后修饰、免疫反应、胚胎发育和癌症发生。PADI1的表达和活性受到多种因素的调控,包括钙离子浓度、转录因子、维生素D受体和CHD4等。PADI1的研究有助于深入理解PADs家族成员的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhang, Yi-Ran, Zhang, Lei, Li, Feng, Gong, Chao, Pan, Yun-Long. 2022. PADI1 and Its Co-Expressed Gene Signature Unveil Colorectal Cancer Prognosis and Immunotherapy Efficacy. In Journal of oncology, 2022, 8394816. doi:10.1155/2022/8394816. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36471887/
2. Dong, Sijun, Ying, Shibo, Kojima, Toshio, Simon, Michel, Takahara, Hidenari. 2007. Crucial roles of MZF1 and Sp1 in the transcriptional regulation of the peptidylarginine deiminase type I gene (PADI1) in human keratinocytes. In The Journal of investigative dermatology, 128, 549-57. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17851584/
3. Zhang, Xiaoqian, Liu, Xiaoqiu, Zhang, Mei, Coonrod, Scott A, Zhang, Xuesen. 2016. Peptidylarginine deiminase 1-catalyzed histone citrullination is essential for early embryo development. In Scientific reports, 6, 38727. doi:10.1038/srep38727. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27929094/
4. Coassolo, Sébastien, Davidson, Guillaume, Negroni, Luc, Romier, Christophe, Davidson, Irwin. 2021. Citrullination of pyruvate kinase M2 by PADI1 and PADI3 regulates glycolysis and cancer cell proliferation. In Nature communications, 12, 1718. doi:10.1038/s41467-021-21960-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33741961/
5. Nava-Quiroz, Karol J, López-Flores, Luis A, Pérez-Rubio, Gloria, Rojas-Serrano, Jorge, Falfán-Valencia, Ramcés. 2023. Peptidyl Arginine Deiminases in Chronic Diseases: A Focus on Rheumatoid Arthritis and Interstitial Lung Disease. In Cells, 12, . doi:10.3390/cells12242829. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38132149/
6. Hu, Lizhi, Bikle, Daniel D, Oda, Yuko. 2013. Reciprocal role of vitamin D receptor on β-catenin regulated keratinocyte proliferation and differentiation. In The Journal of steroid biochemistry and molecular biology, 144 Pt A, 237-41. doi:10.1016/j.jsbmb.2013.11.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24239508/