Ddx39b-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

Ddx39b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-19239

品系全称

C57BL/6JCya-Ddx39bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-53817-Ddx39b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx39b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-19239) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DEAD box helicase 39b
基因别称
0610030D10Rik,Bat-1,Bat1,Bat1a,D17H6S81E,D17H6S81E-1,D6S81Eh
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001252457 | Ensembl: ENSMUST00000172549
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~2.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:99240Mice homozygous for a null allele exhibit complete preweaning lethality while mice heterozygous for the allele exhibit increased susceptibility to gamma radiation.
Ddx39b基因编码一个DEAD-box RNA解旋酶,是一类重要的RNA结合蛋白,在RNA代谢中发挥关键作用。DEAD-box RNA解旋酶在保护基因组稳定性、调节基因表达、防止DNA损伤以及参与DNA损伤的响应和修复等方面发挥着重要作用。Ddx39b基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括肿瘤发生、免疫调节和RNA加工等。

研究表明,Ddx39b基因在结直肠癌(CRC)中表达上调,与肝转移和侵袭性表型相关。Ddx39b基因的过表达可以增强CRC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而Ddx39b基因缺陷的CRC细胞则表现出相反的结果。机制上,Ddx39b直接与PKM2相互作用并稳定其蛋白水平,通过竞争性抑制STUB1介导的PKM2泛素化和降解。此外,Ddx39b还招募importin α5,加速PKM2的核转位,从而激活癌基因和糖酵解相关基因的转录。因此,Ddx39b通过增强葡萄糖摄取和乳酸产生,激活了CRC中的Warburg效应。研究发现,Ddx39b的Arg319位点对于PKM2结合、PKM2核积累以及Ddx39b促进CRC生长和转移至关重要。此外,阻断PKM2核转位或使用糖酵解抑制剂2-脱氧-D-葡萄糖可以有效消除Ddx39b触发的CRC恶性发展[1]。

DEAD-box RNA解旋酶在基因组稳定性中发挥重要作用,它们通过调节基因表达、防止DNA损伤以及参与DNA损伤的响应和修复等机制保护基因组。研究表明,Ddx39b基因在基因组稳定性中发挥着重要作用。Ddx39b基因的表达可以影响基因表达,防止DNA损伤,并直接参与DNA损伤的响应和修复。此外,Ddx39b基因的表达还与癌症的发生发展密切相关。Ddx39b基因在多种癌症中表达上调,如结直肠癌、卵巢癌和肝细胞癌等。这些研究表明,Ddx39b基因在基因组稳定性中发挥着重要作用,其表达异常可能与癌症的发生发展有关[2]。

Ddx39b基因在免疫调节中也发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因可以激活FOXP3 RNA剪接,控制T调节细胞的命运。FOXP3是CD4+/CD25+ T调节细胞的主要转录因子,在自身免疫中发挥重要作用。Ddx39b基因的敲低导致免疫调节功能的丧失和免疫效应功能的获得。此外,Ddx39b基因的表达与多种自身免疫疾病的风险相关,如多发性硬化症(MS)。这些研究表明,Ddx39b基因在免疫调节中发挥着重要作用,其表达异常可能与自身免疫疾病的发生发展有关[3]。

Ddx39b基因在RNA加工中也发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因可以激活FOXP3 RNA剪接,控制T调节细胞的命运。FOXP3是CD4+/CD25+ T调节细胞的主要转录因子,在自身免疫中发挥重要作用。Ddx39b基因的敲低导致免疫调节功能的丧失和免疫效应功能的获得。此外,Ddx39b基因的表达与多种自身免疫疾病的风险相关,如多发性硬化症(MS)。这些研究表明,Ddx39b基因在免疫调节中发挥着重要作用,其表达异常可能与自身免疫疾病的发生发展有关[3]。

Ddx39b基因在疟疾的发病机制中也发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因的基因多态性与恶性疟疾的临床结果相关。Ddx39b基因的G等位基因与疟疾症状的减轻或减少相关,而C等位基因则与疾病并发症的风险增加相关。此外,Ddx39b基因的基因型组合与TNF和IL6基因的基因型组合一起,与恶性疟疾的临床结果相关。这些研究表明,Ddx39b基因在疟疾的发病机制中发挥着重要作用,其基因多态性与疟疾的临床结果相关[4]。

Ddx39b基因在RNA加工中也发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因在RNA加工中发挥着重要作用。Ddx39b基因的表达可以影响基因表达,防止DNA损伤,并直接参与DNA损伤的响应和修复。此外,Ddx39b基因的表达还与癌症的发生发展密切相关。Ddx39b基因在多种癌症中表达上调,如结直肠癌、卵巢癌和肝细胞癌等。这些研究表明,Ddx39b基因在RNA加工中发挥着重要作用,其表达异常可能与癌症的发生发展有关[5]。

Ddx39b基因在RNA剪接中也发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因和其同源基因Ddx39a在RNA剪接中发挥着重要作用。Ddx39b基因和Ddx39a基因在基因靶点上具有显著的冗余性,但也有特定的基因靶点需要其中之一或另一个基因。例如,Ddx39a无法补偿Ddx39b缺失时IL7R外显子6的剪接缺陷。这个外显子和其他依赖于Ddx39b的剪接外显子具有U-poor/C-rich多嘧啶区。这个研究表明,尽管Ddx39a和Ddx39b在功能上具有高度冗余性,但它们对于特定前mRNA的剪接是选择性必需的[6]。

Ddx39b基因在卵巢癌中发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因在卵巢癌中表达上调,与较差的预后相关。Ddx39b基因的抑制可以增强卵巢癌细胞对DNA损伤化疗药物的敏感性。机制上,Ddx39b基因与BRCA1 mRNA结合并稳定其蛋白水平,从而促进DNA修复。此外,Ddx39b基因缺陷的小鼠表现出胚胎致死或发育迟缓,类似于BRCA1基因缺陷的小鼠。这些研究表明,Ddx39b基因在卵巢癌中发挥着重要作用,其抑制可以增强化疗药物的治疗效果[7]。

Ddx39b基因在膀胱癌的淋巴结转移中也发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因的SUMO化可以调节circNCOR1的核质转运,从而影响TGFβ-SMAD信号通路和膀胱癌的淋巴管生成。Ddx39b基因的SUMO化可以激活circNCOR1的核质转运,从而抑制circNCOR1对TGFβ-SMAD信号通路的抑制作用,促进膀胱癌的淋巴结转移。这些研究表明,Ddx39b基因的SUMO化在膀胱癌的淋巴结转移中发挥着重要作用,其调节circNCOR1的核质转运可能成为治疗膀胱癌的新策略[8]。

Ddx39b基因在肝细胞癌(HCC)中发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因在HCC组织中表达上调,与较差的预后相关。Ddx39b基因的过表达可以增强HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,促进HCC的恶性发展。机制上,Ddx39b基因直接与SREBP1相互作用并稳定其蛋白水平,从而激活SREBP1介导的从头脂质合成。此外,Ddx39b基因的缺失可以降低SREBP1的核转位和激活,从而降低脂质积累。这些研究表明,Ddx39b基因在HCC中发挥着重要作用,其通过激活SREBP1介导的从头脂质合成促进HCC的恶性发展[9]。

Ddx39b基因在ccRCC中发挥着重要作用。研究表明,Ddx39b基因在ccRCC组织中表达上调,与较差的预后相关。Ddx39b基因的表达与PD-L1和其他免疫调节因子的表达呈正相关,而与细胞毒性T淋巴细胞和HDAC10外显子3的表达呈负相关。Ddx39b基因的敲低可以降低PD-L1的表达并增加HDAC10外显子3的表达。此外,Ddx39b基因高表达的患者在接受ICI治疗时表现出更长的生存期和更低的复发率。这些研究表明,Ddx39b基因在ccRCC中发挥着重要作用,其可能通过增强HDAC10外显子3的跳跃来增加PD-L1的表达,从而促进ICI治疗反应[10]。

综上所述,Ddx39b基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括肿瘤发生、免疫调节和RNA加工等。Ddx39b基因在多种癌症中表达上调,与较差的预后相关。此外,Ddx39b基因在RNA剪接、DNA修复和免疫调节中也发挥着重要作用。因此,Ddx39b基因可能成为治疗多种疾病的新靶点。

参考文献:
1. Zhao, Gang, Yuan, Hang, Li, Qin, Li, Kai, Lin, Ping. 2022. DDX39B drives colorectal cancer progression by promoting the stability and nuclear translocation of PKM2. In Signal transduction and targeted therapy, 7, 275. doi:10.1038/s41392-022-01096-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35973989/
2. Cargill, Michael, Venkataraman, Rasika, Lee, Stanley. 2021. DEAD-Box RNA Helicases and Genome Stability. In Genes, 12, . doi:10.3390/genes12101471. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34680866/
3. Hirano, Minato, Galarza-Muñoz, Gaddiel, Nagasawa, Chloe, Bradrick, Shelton, Garcia-Blanco, Mariano A. 2023. The RNA helicase DDX39B activates FOXP3 RNA splicing to control T regulatory cell fate. In eLife, 12, . doi:10.7554/eLife.76927. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37261960/
4. Mendonça, Vitor R R, Souza, Ligia C L, Garcia, Gabriela C, Gonçalves, Marilda S, Barral-Netto, Manoel. 2014. DDX39B (BAT1), TNF and IL6 gene polymorphisms and association with clinical outcomes of patients with Plasmodium vivax malaria. In Malaria journal, 13, 278. doi:10.1186/1475-2875-13-278. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25038626/
5. Roth, Jonathan F, Braunschweig, Ulrich, Wu, Mingkun, Gingras, Anne-Claude, Blencowe, Benjamin J. . Systematic analysis of alternative exon-dependent interactome remodeling reveals multitasking functions of gene regulatory factors. In Molecular cell, 83, 4222-4238.e10. doi:10.1016/j.molcel.2023.10.034. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38065061/
6. Banerjee, Shefali, Nagasawa, Chloe K, Widen, Steven G, Garcia-Blanco, Mariano A. . Parsing the roles of DExD-box proteins DDX39A and DDX39B in alternative RNA splicing. In Nucleic acids research, 52, 8534-8551. doi:10.1093/nar/gkae431. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38801080/
7. Xu, Zhanzhan, Li, Xiaoman, Li, Hanxiao, Wang, Weibin, Wang, Jiadong. 2020. Suppression of DDX39B sensitizes ovarian cancer cells to DNA-damaging chemotherapeutic agents via destabilizing BRCA1 mRNA. In Oncogene, 39, 7051-7062. doi:10.1038/s41388-020-01482-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32989256/
8. An, Mingjie, Zheng, Hanhao, Huang, Jian, Chen, Changhao, Lin, Tianxin. . Aberrant Nuclear Export of circNCOR1 Underlies SMAD7-Mediated Lymph Node Metastasis of Bladder Cancer. In Cancer research, 82, 2239-2253. doi:10.1158/0008-5472.CAN-21-4349. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35395674/
9. Feng, Tianyu, Li, Siqi, Zhao, Gang, Li, Kai, Lin, Ping. 2023. DDX39B facilitates the malignant progression of hepatocellular carcinoma via activation of SREBP1-mediated de novo lipid synthesis. In Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands), 46, 1235-1252. doi:10.1007/s13402-023-00807-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37052853/
10. Wei, Jinhuan, Lu, Jun, Cao, Yun, Luo, Junhang, Cao, Jiazheng. . DDX39B Predicts Poor Survival and Associated with Clinical Benefit of Anti-PD-L1 Therapy in ccRCC. In Current cancer drug targets, 21, 849-859. doi:10.2174/1568009621666210811115054. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34382524/