Paxip1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Paxip1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-19203

品系全称

C57BL/6JCya-Paxip1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-55982-Paxip1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Paxip1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-19203) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1
基因别称
D5Ertd149e,PTIP
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_018878 | Ensembl: ENSMUST00000002291
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~2.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1890430Homozygous mutant mice are developmentally retarded and embyronic lethal by E9.5.
PAXIP1,也称为PTIP,是一种重要的蛋白质,它参与了多种生物学过程,包括DNA损伤修复、染色质组织和转录调控。PAXIP1具有BRCT结构域,这是一种在细胞周期检查点和DNA损伤修复中发挥关键作用的蛋白质超家族的特征性结构。BRCT结构域允许PAXIP1与其他蛋白质相互作用,从而在DNA损伤修复途径中发挥作用。

PAXIP1与DNA损伤修复的关系在多个研究中得到证实。例如,一项研究发现,在BRCA1和BRCA2基因缺陷的细胞中,PAXIP1的缺失可以保护细胞免受DNA损伤,并挽救BRCA2缺陷胚胎干细胞因DNA损伤而引起的死亡[2]。这表明PAXIP1在维持DNA损伤修复途径的完整性方面发挥了重要作用。此外,PAXIP1还与同源重组(HR)和DNA复制叉稳定性相关。研究发现,PAXIP1的缺失可以导致复制叉保护,从而赋予BRCA缺陷细胞对DNA损伤剂的耐药性[2]。

PAXIP1在染色质组织和转录调控中也发挥着重要作用。一项研究发现,PAXIP1与STAG2相互作用,共同维持三维基因组结构和促进启动子增强子相互作用,从而调控转录活性[3]。此外,PAXIP1还与PAGR1形成复合物,共同调节染色质上共济蛋白的定位和功能,进而影响染色质组织和基因表达[1]。

在肿瘤发生发展方面,PAXIP1也发挥着重要作用。研究发现,PAXIP1在多种癌症中表达下调,包括乳腺癌和肺癌[4,5]。此外,PAXIP1的表达与肿瘤预后相关,低表达PAXIP1的肿瘤患者预后较差[4,5]。这表明PAXIP1可能是一种肿瘤抑制因子,其表达下调可能与肿瘤的发生发展有关。

此外,PAXIP1的表达与免疫浸润也有关联。一项研究发现,低表达PAXIP1的卵巢癌细胞具有较差的预后,并且与免疫浸润相关[6]。这表明PAXIP1可能通过调节免疫反应影响肿瘤的发生发展。

综上所述,PAXIP1是一种重要的蛋白质,参与了多种生物学过程,包括DNA损伤修复、染色质组织和转录调控。PAXIP1在维持DNA损伤修复途径的完整性、维持三维基因组结构和促进转录活性方面发挥着重要作用。此外,PAXIP1的表达与肿瘤预后和免疫浸润相关,表明其可能是一种肿瘤抑制因子,其表达下调可能与肿瘤的发生发展有关。对PAXIP1的研究有助于深入理解其在细胞生物学和肿瘤发生发展中的作用机制,为肿瘤的诊断、治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. van Schie, Janne J M, de Lint, Klaas, Molenaar, Thom M, Wolthuis, Rob M F, de Lange, Job. . CRISPR screens in sister chromatid cohesion defective cells reveal PAXIP1-PAGR1 as regulator of chromatin association of cohesin. In Nucleic acids research, 51, 9594-9609. doi:10.1093/nar/gkad756. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37702151/
2. Ray Chaudhuri, Arnab, Callen, Elsa, Ding, Xia, Sharan, Shyam K, Nussenzweig, André. . Replication fork stability confers chemoresistance in BRCA-deficient cells. In Nature, 535, 382-7. doi:10.1038/nature18325. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27443740/
3. Mayayo-Peralta, Isabel, Gregoricchio, Sebastian, Schuurman, Karianne, Prekovic, Stefan, Zwart, Wilbert. . PAXIP1 and STAG2 converge to maintain 3D genome architecture and facilitate promoter/enhancer contacts to enable stress hormone-dependent transcription. In Nucleic acids research, 51, 9576-9593. doi:10.1093/nar/gkad267. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37070193/
4. Ashkin, Emily L, Tang, Yuning J, Xu, Haiqing, Xu, Zhichao, Winslow, Monte M. 2024. A STAG2-PAXIP1/PAGR1 axis suppresses lung tumorigenesis. In The Journal of experimental medicine, 222, . doi:10.1084/jem.20240765. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39652422/
5. Möller, Steffen, Saul, Nadine, Projahn, Elias, Antal, Péter, Fuellen, Georg. 2022. Gene co-expression analyses of health(span) across multiple species. In NAR genomics and bioinformatics, 4, lqac083. doi:10.1093/nargab/lqac083. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36458022/
6. Chen, Buze, Lu, Xiaoyuan, Zhou, Qingmei, Li, Guilin, Liu, Hui. 2023. PAXIP1-AS1 is associated with immune infiltration and predicts poor prognosis in ovarian cancer. In PloS one, 18, e0290031. doi:10.1371/journal.pone.0290031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37582104/