Srrt-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Srrt-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-19057

品系全称

C57BL/6JCya-Srrtem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-83701-Srrt-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Srrt-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-19057) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis)
基因别称
2810019G02Rik,ASR2A,ASR2B,ASR2C,ASR2D,Ars2,Asr2
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001109909 | Ensembl: ENSMUST00000199243
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~9
敲除长度
~3.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1933527Mice homozygous for a null allele display embryonic lethality before somite formation, increased apoptosis, and when cultured most fail to hatch from the zona pellucida.
SRRT基因,也被称为ARS2,是一个在真核细胞中发现的蛋白质,它在RNA聚合酶II(Pol II)转录、转录本成熟和质量控制中扮演着重要的角色。SRRT蛋白与帽结合复合物(CBC)相互作用,并与新合成RNA的帽子结构结合。这种相互作用使得SRRT成为蛋白质因子交换的中心,这些因子最终决定相关RNA的命运。SRRT在核基因表达机器中的中心位置解释了其耗尽会导致广泛的表型,但其确切功能仍然难以捉摸[1]。

SRRT在RNA加工和细胞功能中发挥重要作用。例如,SRRT与核帽结合复合物相互作用,并决定mRNA转录本的命运。SRRT的突变可以激活胚胎期特定基因的表达,例如NDUFS2/nduf-2.2,它通常只在多巴胺能神经元中表达。此外,SRRT的突变还可以导致CMTR-1蛋白在处理体(P bodies)中的异常定位,P bodies是参与mRNA储存和降解的相分离细胞器。这些发现表明,SRRT在控制特定基因的表达和mRNA的稳定性方面发挥着关键作用[2]。

SRRT在遗传疾病中也有重要作用。在沙特阿拉伯的一项研究中,SRRT基因被确定为候选疾病基因之一,与人类疾病相关[3]。此外,SRRT在胚胎干细胞(ESC)中表达较高,通过防止转录本在第一个内含子的隐秘切割/多腺苷酸化位点上的过早终止,维持ESC的表型。SRRT通过与核帽结合复合物相互作用,促进剪接体成分U1 snRNP的招募,从而在ESC中维持基因表达模式[4]。

SRRT在癌症中也发挥着重要作用。研究发现,SRRT在前列腺癌中表达上调,并与不良预后相关。SRRT的高表达与PTEN缺失、ERG增益、TP53突变或ATM等常见基因组改变相关,提示SRRT在前列腺癌进展中发挥潜在作用[5]。此外,SRRT在HPV阴性头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中也表现出高表达,并具有诊断价值[7]。

SRRT还与2型糖尿病相关。研究发现,SRRT与2型糖尿病相关基因JAZF1相互作用,提示SRRT在糖尿病发病机制中发挥作用[6]。此外,SRRT在维持端粒酶活性中也有作用。SRRT的缺失会导致端粒重复RNA(TERRA)水平的上调,表明SRRT在端粒酶活性和细胞衰老中发挥作用[8]。

综上所述,SRRT基因在RNA聚合酶II转录、转录本成熟和质量控制中发挥重要作用。SRRT在RNA加工、细胞功能和遗传疾病中具有广泛的功能,包括维持ESC表型、调控基因表达、影响癌症进展和糖尿病发病机制等。此外,SRRT还与端粒酶活性和细胞衰老相关。SRRT的研究有助于深入理解RNA加工和基因表达调控的机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Lykke-Andersen, Søren, Rouvière, Jérôme O, Jensen, Torben Heick. . ARS2/SRRT: at the nexus of RNA polymerase II transcription, transcript maturation and quality control. In Biochemical Society transactions, 49, 1325-1336. doi:10.1042/BST20201008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34060620/
2. Meisel, Joshua D, Wiesenthal, Presli P, Mootha, Vamsi K, Ruvkun, Gary. 2024. CMTR-1 RNA methyltransferase mutations activate widespread expression of a dopaminergic neuron-specific mitochondrial complex I gene. In Current biology : CB, 34, 2728-2738.e6. doi:10.1016/j.cub.2024.04.079. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38810637/
3. Monies, Dorota, Abouelhoda, Mohamed, AlSayed, Moeenaldeen, Meyer, Brian F, Alkuraya, Fowzan S. 2017. The landscape of genetic diseases in Saudi Arabia based on the first 1000 diagnostic panels and exomes. In Human genetics, 136, 921-939. doi:10.1007/s00439-017-1821-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28600779/
4. Kainov, Yaroslav A, Makeyev, Eugene V. 2020. A transcriptome-wide antitermination mechanism sustaining identity of embryonic stem cells. In Nature communications, 11, 361. doi:10.1038/s41467-019-14204-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31953406/
5. Gamallat, Yaser, Choudhry, Muhammad, Li, Qiaowang, Boutros, Paul C, Bismar, Tarek A. 2023. Serrate RNA Effector Molecule (SRRT) Is Associated with Prostate Cancer Progression and Is a Predictor of Poor Prognosis in Lethal Prostate Cancer. In Cancers, 15, . doi:10.3390/cancers15102867. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37345203/
6. Li, Jing-Woei, Lee, Heung-Man, Wang, Ying, Chan, Juliana C N, Chan, Ting-Fung. 2016. Interactome-transcriptome analysis discovers signatures complementary to GWAS Loci of Type 2 Diabetes. In Scientific reports, 6, 35228. doi:10.1038/srep35228. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27752041/
7. Su, Yushen, Zeng, Zhirui, Rong, Dongyun, Wu, Bei, Cao, Yu. 2021. PSMC2, ORC5 and KRTDAP are specific biomarkers for HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma. In Oncology letters, 21, 289. doi:10.3892/ol.2021.12550. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33732365/
8. Scheibe, Marion, Arnoult, Nausica, Kappei, Dennis, Butter, Falk, Mann, Matthias. 2013. Quantitative interaction screen of telomeric repeat-containing RNA reveals novel TERRA regulators. In Genome research, 23, 2149-57. doi:10.1101/gr.151878.112. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23921659/