Calcoco1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Calcoco1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18965

品系全称

C57BL/6JCya-Calcoco1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67488-Calcoco1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Calcoco1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18965) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
calcium binding and coiled coil domain 1
基因别称
1810009B06Rik,Cocoa,Gcap11,mKIAA1536
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026192 | Ensembl: ENSMUST00000023818
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~6
敲除长度
~2.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Calcoco1,也称为Calcium Binding and Coiled-Coil Domain 1,是一个编码钙结合和螺旋-卷曲结构域蛋白的基因。Calcoco1在多种生物学过程中发挥作用,包括细胞自噬、内质网应激反应、肿瘤发生、免疫调节等。研究表明,Calcoco1与多种疾病的发生和发展密切相关,如乳腺癌、结直肠癌、神经母细胞瘤等。以下将对Calcoco1的功能和疾病相关性进行详细阐述。

内质网应激(ER stress)是一种细胞内质网功能受损的状态,可以导致细胞死亡或适应性的细胞过程,如自噬。研究表明,ER stress可以显著提高m6A甲基化水平,并通过XBP1s依赖性转录上调METTL3/METTL14来促进ER-phagy(内质网自噬)。进一步研究发现,ER stress导致m6A甲基化在ER-phagy相关基因上富集,而METTL3/METTL14通过促进ER-phagy调节因子CALCOCO1和p62的m6A修饰,从而增强它们的mRNA稳定性,增加ER-phagy机制的形成。此外,化疗药物紫杉醇(PTX)可以诱导ER stress并增加m6A甲基化,从而促进ER-phagy。研究发现,METTL3/METTL14抑制剂与PTX联合使用在乳腺癌细胞和异种移植小鼠中表现出显著的协同治疗效果[1]。

Reticulophagy是一种选择性自噬过程,负责内质网成分的溶酶体降解。研究表明,病毒可以利用宿主细胞内的reticulophagy机制来逃避宿主的免疫防御,同时病毒也可以通过抑制reticulophagy来支持病毒复制。在感染过程中,病毒分泌和跨膜蛋白在内质网合成,并利用内质网膜形成病毒产品的积累场所。Reticulophagy在病毒感染中具有双重作用,既可以作为宿主细胞的抗病毒防御机制,也可以被病毒利用来抑制宿主的抗病毒反应[2]。

Calcoco1作为一种转录共激活因子,参与调节糖皮质激素受体(GR)的转录活性。研究发现,Calcoco1可以与GR结合,并通过促进GR与DNA的结合来增强GR的转录活性。此外,Calcoco1还可以与其他转录因子相互作用,如p300/CBP、SRC-1等,共同调节基因表达。Calcoco1的基因特异性选择模式表明,它可能对应于特定的生理通路,从而为激素反应的精细调节提供了一种机制。Calcoco1在细胞分化、发育、代谢和免疫调节等过程中发挥重要作用[3]。

Wnt信号通路是一种重要的信号传导途径,参与调节细胞增殖、分化和凋亡等过程。研究表明,SLA(sandblasted, large-grit, acid-etched)处理可以影响钛种植体表面的物理和化学特性,从而影响骨整合。研究发现,SLA处理可以上调Wnt信号通路相关基因的表达,包括Calcoco1。进一步研究发现,LRP5可以正调控骨整合,而LRP5 shRNA处理可以抑制SLA处理组的钙沉积。此外,β-catenin/LRP5通路负责SLA处理组中骨髓间充质干细胞(BMMSCs)的骨整合反应[4]。

Calcoco1在MTOR调节的选择性自噬中发挥重要作用。研究发现,MTOR抑制可以诱导自噬,而Calcoco1在MTOR抑制后表达上调。进一步研究发现,Calcoco1与自噬相关蛋白MAP1LC3C相互作用,而Calcoco1的基因敲除可以破坏内质网自噬。这些结果表明,Calcoco1在MTOR调节的选择性自噬中发挥重要作用[5]。

LINC00052是一种长链非编码RNA,可以抑制结直肠癌的转移。研究发现,LINC00052在结直肠癌细胞和组织中表达下调,而miR-574-5p在结直肠癌细胞和组织中表达上调。进一步研究发现,LINC00052可以抑制结直肠癌细胞转移,而miR-574-5p可以促进结直肠癌细胞迁移和侵袭。此外,LINC00052可以调节CALCOCO1的表达,而miR-574-5p可以与LINC00052和CALCOCO1相互作用[6]。

CHEK2是一种细胞周期检查点激酶,其1100delC突变可以增加乳腺癌的患病风险。研究发现,CHEK2 1100delC突变与乳腺癌肿瘤的基因拷贝数变异和基因表达谱密切相关。进一步研究发现,Calcoco1是CHEK2 1100delC相关肿瘤进展的候选驱动基因之一。此外,CHEK2 1100delC基因表达谱与较差的无病生存期相关[7]。

Tunchang猪是中国海南猪的一个群体,具有美味、适应性强的特点。研究发现,Tunchang猪具有较高的遗传多样性和与本地中国猪的遗传相似性。进一步研究发现,Calcoco1是Tunchang猪的候选基因之一,与免疫调节相关[8]。

综上所述,Calcoco1在多种生物学过程中发挥作用,包括细胞自噬、内质网应激反应、肿瘤发生、免疫调节等。研究表明,Calcoco1与多种疾病的发生和发展密切相关,如乳腺癌、结直肠癌、神经母细胞瘤等。Calcoco1的研究有助于深入理解细胞自噬、内质网应激反应、肿瘤发生、免疫调节等生物学过程的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Wang, Jiajia, Fan, Pengyu, Shen, Peng, Chen, Suning, Zhang, Jian. 2024. XBP1s activates METTL3/METTL14 for ER-phagy and paclitaxel sensitivity regulation in breast cancer. In Cancer letters, 596, 216846. doi:10.1016/j.canlet.2024.216846. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38582397/
2. Wilson, Alexa, McCormick, Craig. 2024. Reticulophagy and viral infection. In Autophagy, 21, 3-20. doi:10.1080/15548627.2024.2414424. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39394962/
3. Wu, Dai-Ying, Ou, Chen-Yin, Chodankar, Rajas, Siegmund, Kimberly D, Stallcup, Michael R. 2014. Distinct, genome-wide, gene-specific selectivity patterns of four glucocorticoid receptor coregulators. In Nuclear receptor signaling, 12, e002. doi:10.1621/nrs.12002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25422592/
4. Yang, Guoli, Fang, Wen, Liu, Tie, Zhou, Yi, Guan, Xiaoxu. 2015. Gene expression profiling of bone marrow-derived stromal cells seeded onto a sandblasted, large-grit, acid-etched-treated titanium implant surface: The role of the Wnt pathway. In Archives of oral biology, 61, 71-8. doi:10.1016/j.archoralbio.2015.10.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26520883/
5. Stefely, Jonathan A, Zhang, Yu, Freiberger, Elyse C, Pagliarini, David J, Mercer, Carol A. 2020. Mass spectrometry proteomics reveals a function for mammalian CALCOCO1 in MTOR-regulated selective autophagy. In Autophagy, 16, 2219-2237. doi:10.1080/15548627.2020.1719746. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31971854/
6. Yu, Gangfeng, Xiong, Dongmei, Liu, Zhengshu, Chen, Ke, Tang, Hua. 2019. Long noncoding RNA LINC00052 inhibits colorectal cancer metastasis by sponging microRNA-574-5p to modulate CALCOCO1 expression. In Journal of cellular biochemistry, 120, 17258-17272. doi:10.1002/jcb.28988. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31104316/
7. Muranen, Taru A, Greco, Dario, Fagerholm, Rainer, Borg, Ake, Nevanlinna, Heli. 2011. Breast tumors from CHEK2 1100delC-mutation carriers: genomic landscape and clinical implications. In Breast cancer research : BCR, 13, R90. doi:10.1186/bcr3015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21542898/
8. Wang, Feifan, Zha, Zonglin, He, Yingzhi, Xiao, Qian, Tan, Zhen. 2023. Genome-Wide Re-Sequencing Data Reveals the Population Structure and Selection Signatures of Tunchang Pigs in China. In Animals : an open access journal from MDPI, 13, . doi:10.3390/ani13111835. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37889708/