Chd3-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Chd3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18639

品系全称

C57BL/6JCya-Chd3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-216848-Chd3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Chd3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18639) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
chromodomain helicase DNA binding protein 3
基因别称
2600010P09Rik,Chd7,Prp7,Prp9-1
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_146019 | Ensembl: ENSMUST00000108661
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1344395Homozygous knockout leads to increased embryonic lethality.
CHD3,也称为Chromodomain Helicase DNA Binding Protein 3,是一种重要的染色质重塑因子。CHD3属于CHD(Chromodomain Helicase DNA Binding)家族,该家族成员在染色质重塑和基因表达调控中发挥重要作用。CHD3具有染色质重塑活性,能够通过改变染色质结构来调节基因表达。CHD3在多种生物学过程中发挥作用,包括发育、分化、细胞周期和疾病发生。

Snijders Blok-Campeau综合征(SNIBCPS)是一种罕见的神经发育障碍,其特征包括全身发育迟缓、智力障碍、言语和语言障碍以及行为障碍,如自闭症谱系障碍。此外,患者还表现出典型的畸形特征,包括巨头症、眼距过宽、稀疏眉毛、宽额头、突出鼻子和尖下巴。SNIBCPS是由CHD3基因中的致病和可能致病性变异引起的,这些变异似乎通过去乙酰化组蛋白来参与染色质重塑。一项研究发现,98%的患者出现全身发育迟缓,92%的患者出现言语障碍/延迟。其他常见特征(51-74%)包括智力障碍、低肌张力、眼距过宽、视力异常、巨头症和突出额头等[2]。

CHD3基因突变导致Snijders Blok-Campeau综合征的发病机制尚未完全阐明,但一些研究表明,这些突变可能影响CHD3蛋白的结构和功能。例如,一项研究发现,CHD3基因的ATP酶/解旋酶结构域中的突变可能导致蛋白质的ATP酶活性受损,从而影响染色质重塑过程[1]。此外,CHD3基因的剪接位点突变可能导致mRNA剪切异常,产生截短的蛋白质,从而影响基因功能[3]。

CHD3基因的变异也可能影响染色质可及性和基因表达。一项研究发现,CHD3和SENP1(SUMO蛋白酶)相互作用并共同影响染色质可及性和基因表达。基因组范围内的ATAC-Seq分析显示,CHD3和SENP1敲除细胞之间存在大量重叠的染色质开放差异。此外, motif分析和与K562细胞中的ChIP-Seq谱比较表明,CHD3和SENP1与CCCTC结合因子(CTCF)和SUMO修饰的染色质相关因子相关。全基因组RNA-Seq分析还表明,这两种蛋白质共同调节多个基因的表达[4]。

综上所述,CHD3是一种重要的染色质重塑因子,在基因表达调控和多种生物学过程中发挥重要作用。CHD3基因的变异与Snijders Blok-Campeau综合征等神经发育障碍的发生有关。研究CHD3的功能和突变机制有助于深入理解这些疾病的发病机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Snijders Blok, Lot, Rousseau, Justine, Twist, Joanna, Fisher, Simon E, Campeau, Philippe M. 2018. CHD3 helicase domain mutations cause a neurodevelopmental syndrome with macrocephaly and impaired speech and language. In Nature communications, 9, 4619. doi:10.1038/s41467-018-06014-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30397230/
2. Pascual, Patricia, Tenorio-Castano, Jair, Mignot, Cyril, Nevado, Julián, Lapunzina, Pablo. 2023. Snijders Blok-Campeau Syndrome: Description of 20 Additional Individuals with Variants in CHD3 and Literature Review. In Genes, 14, . doi:10.3390/genes14091664. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37761804/
3. Gao, Yuanyuan, Wang, Pei, Chen, Mengying, Zhang, Hongmei, Zhu, Min. 2024. Novel genotypes and phenotypes in Snijders Blok-Campeau syndrome caused by CHD3 mutations. In Frontiers in genetics, 15, 1347933. doi:10.3389/fgene.2024.1347933. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39050258/
4. Rodríguez-Castañeda, Fernando, Lemma, Roza Berhanu, Cuervo, Ignacio, Eskeland, Ragnhild, Gabrielsen, Odd Stokke. 2018. The SUMO protease SENP1 and the chromatin remodeler CHD3 interact and jointly affect chromatin accessibility and gene expression. In The Journal of biological chemistry, 293, 15439-15454. doi:10.1074/jbc.RA118.002844. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30082317/