Iffo1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Iffo1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18589

品系全称

C57BL/6JCya-Iffo1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-320678-Iffo1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Iffo1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18589) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
intermediate filament family orphan 1
基因别称
4733401N06Rik,A930037G23Rik,HOM-TES-103,Iffo
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001039669 | Ensembl: ENSMUST00000117675
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
IFFO1基因,也称为基因编码的蛋白,是近年来在生物医学研究领域受到关注的一个重要基因。该基因编码的蛋白在细胞中具有多种生物学功能,与DNA修复、染色质结构维持和细胞信号通路等过程密切相关。IFFO1基因编码的蛋白在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用,包括肝癌、卵巢癌、阿尔茨海默病、瘢痕疙瘩和肺癌等。

在肝癌的研究中,IFFO1基因被发现在肝细胞癌(HCC)患者中表达上调。通过分析9个公共全转录组数据集,发现IFFO1基因在HCC样本和对照组样本之间存在显著的差异表达。基于这5个DEGs构建的分类器在识别HCC方面表现出近乎完美的性能。此外,该研究还发现,基于这5个DEGs构建的分类器在HCC中具有明显的特征模式。这些结果表明,这5个DEGs是HCC的内在变量,可以描述HCC在基因组水平上的整体特征。该研究提出的分析框架为改进人类癌症的转录组分析提供了一种新的思路[1]。

在卵巢癌的研究中,IFFO1基因启动子区域的甲基化状态被发现在卵巢肿瘤中频繁发生。研究者在41例卵巢肿瘤中分析了27,578个CpG位点的DNA甲基化状态,并发现IFFO1基因启动子区域的甲基化状态在卵巢肿瘤中频繁发生,而在正常对照组中很少检测到。此外,该研究还发现,IFFO1基因启动子区域的甲基化状态与卵巢癌患者的预后相关。当在127例卵巢癌患者的血清中检测IFFO1基因启动子区域的甲基化状态时,发现其与血清CA-125水平相关。这些结果表明,IFFO1基因启动子区域的甲基化状态可能是一种基于血液的卵巢癌检测候选标志物[2]。

在阿尔茨海默病的研究中,IFFO1基因的罕见变异与神经元损伤和炎症的生物标志物相关。研究者对480名参与者的外显子组进行了罕见变异分析,发现IFFO1基因的罕见变异与神经元损伤和炎症的生物标志物相关。此外,该研究还发现,IFFO1基因的罕见变异与神经元损伤和炎症的生物标志物相关。这些结果表明,IFFO1基因的罕见变异可能通过影响细胞骨架结构和免疫活动抑制,从而增加神经元损伤和炎症的风险,进而增加痴呆的风险[3]。

在瘢痕疙瘩的研究中,IFFO1基因的甲基化状态被发现在瘢痕疙瘩组织中存在差异。研究者通过基因组甲基化分析,发现瘢痕疙瘩组织中存在197个CpG位点的差异甲基化,其中IFFO1基因的甲基化状态在瘢痕疙瘩组织中存在显著差异。这些结果表明,IFFO1基因的甲基化状态可能与瘢痕疙瘩的发生和发展相关[4]。

在肺癌的研究中,IFFO1基因的甲基化状态被发现在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中存在差异。研究者通过基因组甲基化分析,发现NSCLC组织中存在113,644个差异甲基化位点,其中26,310个差异甲基化位点与1685个差异表达基因相关。此外,该研究还发现,IFFO1基因的甲基化状态与基因表达相关。这些结果表明,IFFO1基因的甲基化状态可能与NSCLC的发生和发展相关[5]。

综上所述,IFFO1基因编码的蛋白在细胞中具有多种生物学功能,与DNA修复、染色质结构维持和细胞信号通路等过程密切相关。IFFO1基因在多种疾病的发生和发展中发挥重要作用,包括肝癌、卵巢癌、阿尔茨海默病、瘢痕疙瘩和肺癌等。IFFO1基因的研究有助于深入理解细胞生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liu, Yongjun, Zhang, Heping, Xu, Yuqing, Yeh, Matthew M, Zhang, Zhengjun. 2023. Five Critical Gene-Based Biomarkers With Optimal Performance for Hepatocellular Carcinoma. In Cancer informatics, 22, 11769351231190477. doi:10.1177/11769351231190477. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37577174/
2. Campan, Mihaela, Moffitt, Melissa, Houshdaran, Sahar, Pearce, Celeste L, Laird, Peter W. 2011. Genome-scale screen for DNA methylation-based detection markers for ovarian cancer. In PloS one, 6, e28141. doi:10.1371/journal.pone.0028141. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22163280/
3. Neumann, Alexander, Küçükali, Fahri, Bos, Isabelle, van Broeckhoven, Christine, Sleegers, Kristel. 2022. Rare variants in IFFO1, DTNB, NLRC3 and SLC22A10 associate with Alzheimer's disease CSF profile of neuronal injury and inflammation. In Molecular psychiatry, 27, 1990-1999. doi:10.1038/s41380-022-01437-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35173266/
4. Jones, Lamont R, Greene, Joshua, Chen, Kang Mei, Datta, Indrani, Worsham, Maria J. 2016. Biological significance of genome-wide DNA methylation profiles in keloids. In The Laryngoscope, 127, 70-78. doi:10.1002/lary.26063. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27312686/
5. Feng, Nannan, Wang, Yu, Zheng, Min, Garmire, Lana, Qian, Biyun. 2017. Genome-wide analysis of DNA methylation and their associations with long noncoding RNA/mRNA expression in non-small-cell lung cancer. In Epigenomics, , . doi:10.2217/epi-2016-0120. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28111977/