Vps39-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Vps39-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18567

品系全称

C57BL/6JCya-Vps39em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-269338-Vps39-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Vps39-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18567) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
VPS39 HOPS complex subunit
基因别称
A230065P22Rik,Vam6,Vam6P,mVam6
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_147153 | Ensembl: ENSMUST00000102501
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 9
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2443189Mice exhibit embryonic lethality between E2.5 and E7.5.
Vps39,也称为Vam6或TRAP1-Like-Protein(TLP),是一种多功能的膜接触位点(MCS)蛋白,它在多种细胞过程中发挥着关键作用。Vps39是HOPS(homotypic fusion and protein sorting)复合体的一个组成部分,该复合体主要参与内质网(ER)与溶酶体之间的膜融合和蛋白质分拣。Vps39含有Vam6/Vps39/TRAP1结构域,这一结构域在多种真核生物的蛋白质中保守,表明其在基本细胞功能中的重要作用。

Vps39在磷脂酰乙醇胺(PE)的运输到线粒体中起着关键作用。研究表明,Vps39的缺失会阻止乙醇胺刺激的线粒体PE水平的升高,而不影响ER中PE的生物合成或其向其他细胞器的运输[1]。Vps39的丰度和其向线粒体和ER的募集取决于这些细胞器中PE的水平,这直接表明Vps39在PE运输过程中的作用。Vps39在细胞内的PE转运中发挥着独立的作用,这表明它在细胞内的磷脂代谢中具有特定的功能[1]。

Vps39在真菌Cryptococcus neoformans中也发挥着重要作用。Vps3和Vam6是两种在C. neoformans中发现的Vam6/Vps39/TRAP1结构域蛋白,它们对于在血红蛋白作为唯一铁源的情况下实现稳健生长是必需的[2]。Vps3和Vam6的缺失影响了铁摄取功能的转运和表达,并导致在C. neoformans中丧失致病性[2]。

在人类疾病中,Vps39的缺失与2型糖尿病(T2D)有关。研究发现,VPS39在T2D患者的肌细胞中的表达下调,这导致了肌肉干细胞分化和葡萄糖摄取的受损[3]。VPS39的缺失还与自噬和表观遗传调控的异常有关,这进一步影响了肌细胞的功能[3]。

Vps39的C端结构域被预测为一个锌指结构域,但研究表明它采用了非本构折叠[4]。这表明在蛋白质结构研究中,非本构折叠可能是一个需要考虑的因素,尤其是在使用特定的纯化方法时。

在早期胚胎发育中,Vps39和TRAP1/TGFBRAP1是必不可少的。TRAP1和VPS39的缺失会导致胚胎发育停滞,这表明它们在TGF-β信号通路中起着关键作用[5]。

Vps39在自噬体成熟过程中也发挥着重要作用。研究发现,RAB2和RAB14在自噬体成熟过程中具有重叠的作用,它们通过招募HOPS复合体来调节自噬体的成熟[6]。Vps39是HOPS复合体的一部分,它在自噬体成熟过程中发挥着重要作用[6]。

综上所述,Vps39是一种多功能的蛋白质,它在细胞内多种过程中发挥着关键作用,包括线粒体磷脂运输、真菌生长和致病性、肌肉干细胞分化和葡萄糖摄取、早期胚胎发育和自噬体成熟。Vps39的缺失与多种疾病有关,包括2型糖尿病和真菌感染。Vps39的研究有助于我们更好地理解细胞内基本过程和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1][2][3][4][5][6]。

参考文献:
1. Iadarola, Donna M, Basu Ball, Writoban, Trivedi, Prachi P, Nan, Beiyan, Gohil, Vishal M. 2020. Vps39 is required for ethanolamine-stimulated elevation in mitochondrial phosphatidylethanolamine. In Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids, 1865, 158655. doi:10.1016/j.bbalip.2020.158655. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32058032/
2. Hu, Guanggan, Bakkeren, Erik, Caza, Mélissa, Jung, Wonhee, Kronstad, James W. 2021. Vam6/Vps39/TRAP1-domain proteins influence vacuolar morphology, iron acquisition and virulence in Cryptococcus neoformans. In Cellular microbiology, 23, e13400. doi:10.1111/cmi.13400. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34800311/
3. Davegårdh, Cajsa, Säll, Johanna, Benrick, Anna, Scheele, Camilla, Ling, Charlotte. 2021. VPS39-deficiency observed in type 2 diabetes impairs muscle stem cell differentiation via altered autophagy and epigenetics. In Nature communications, 12, 2431. doi:10.1038/s41467-021-22068-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33893273/
4. Butt, Benjamin G, Scourfield, Edward J, Graham, Stephen C. 2020. Non-native fold of the putative VPS39 zinc finger domain. In Wellcome open research, 5, 154. doi:10.12688/wellcomeopenres.16078.2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32724865/
5. Messler, Sabine, Kropp, Sonja, Episkopou, Vasso, Pfeffer, Klaus, Wurthner, Jens U. 2010. The TGF-β signaling modulators TRAP1/TGFBRAP1 and VPS39/Vam6/TLP are essential for early embryonic development. In Immunobiology, 216, 343-50. doi:10.1016/j.imbio.2010.07.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20961651/
6. Haga, Kentaro, Fukuda, Mitsunori. 2024. Comprehensive knockout analysis of the RAB family small GTPases reveals an overlapping role of RAB2 and RAB14 in autophagosome maturation. In Autophagy, 21, 21-36. doi:10.1080/15548627.2024.2374699. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38953305/