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Pam-KO 基因敲除小鼠

Pam-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Pam-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18534

品系全称

C57BL/6JCya-Pamem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-18484-Pam-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Pam-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18534) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase
基因别称
PHM
染色体号
Chr 1 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_013626 | Ensembl: ENSMUST00000097625
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.9 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:97475Homozygous mutation of this gene results in embryonic lethality during fetal growth and development, edema, abnormal yolk sac vasculature, thin arterial walls, and abnormal bronchial epithelial morphology.
更多信息
基因PAM（Protospacer Adjacent Motif）是CRISPR-Cas系统中Cas蛋白识别并结合DNA靶点的重要序列。CRISPR-Cas系统是一种细菌和古菌的免疫机制，用于抵御入侵的病毒和质粒。近年来，CRISPR-Cas系统已被广泛应用于基因编辑和调控领域。PAM序列的识别和结合对于Cas蛋白的功能至关重要，因为它决定了Cas蛋白能够切割或修饰的DNA靶点的范围。

PAM序列通常是位于CRISPR识别序列（protospacer）末端的简短序列，其序列和长度在不同类型的Cas蛋白中有所不同。例如，最广泛使用的SpCas9蛋白识别5'-NGG-3' PAM序列。PAM序列的存在使得Cas蛋白能够精确地识别并结合到特定的DNA序列上，从而实现高效的基因编辑和调控。

然而，PAM序列的限制也限制了CRISPR-Cas系统的应用范围。为了克服这一限制，研究人员已经开发了一系列具有不同PAM识别特性的Cas蛋白变体。例如，SpdCas9是一种经过改造的SpCas9变体，它可以识别更广泛的PAM序列，包括5'-CAT-3'和5'-NRN-3'等。这种改造使得SpdCas9能够在更广泛的DNA靶点上发挥作用，从而扩大了CRISPR-Cas系统的应用范围[1]。

除了SpdCas9之外，还有其他Cas蛋白变体也被开发出来，以识别不同的PAM序列。例如，SedCas9是一种来自Streptococcus equinus的Cas9变体，它可以识别NAG PAM序列。通过替换SedCas9中的PAM结合结构域，研究人员成功地将其PAM识别特性改变为NGG或NAA，从而实现了对更广泛PAM序列的识别[2]。

此外，还有研究开发了一种PAM独立的Cas9变体，称为SpRY。SpRY可以识别并结合到没有PAM序列的DNA靶点上，从而实现了对更广泛DNA靶点的编辑和调控[3]。

总的来说，PAM序列在CRISPR-Cas系统中起着至关重要的作用。通过对Cas蛋白进行改造，研究人员已经开发了一系列具有不同PAM识别特性的Cas蛋白变体，从而扩大了CRISPR-Cas系统的应用范围。这些改造使得CRISPR-Cas系统能够在更广泛的DNA靶点上发挥作用，从而实现了更精确和高效的基因编辑和调控。未来的研究将继续探索PAM序列的特性和功能，并开发更多具有不同PAM识别特性的Cas蛋白变体，以进一步推动CRISPR-Cas系统在基因编辑和调控领域的应用。

参考文献：
1. Wang, Jian, Teng, Yuxi, Zhang, Ruihua, Xie, Zhong-Ru, Yan, Yajun. 2021. Engineering a PAM-flexible SpdCas9 variant as a universal gene repressor. In Nature communications, 12, 6916. doi:10.1038/s41467-021-27290-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34824292/
2. Wang, Jian, Teng, Yuxi, Gong, Xinyu, Xie, Zhong-Ru, Yan, Yajun. 2022. Exploring and engineering PAM-diverse Streptococci Cas9 for PAM-directed bifunctional and titratable gene control in bacteria. In Metabolic engineering, 75, 68-77. doi:10.1016/j.ymben.2022.10.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36404524/
3. Klanschnig, Marco, Cserjan-Puschmann, Monika, Striedner, Gerald, Grabherr, Reingard. . CRISPRactivation-SMS, a message for PAM sequence independent gene up-regulation in Escherichia coli. In Nucleic acids research, 50, 10772-10784. doi:10.1093/nar/gkac804. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36134715/

资料下载

S-KO-18534_6J_18484_Pam_Exon 3_strategy.pdf
S-KO-18534_6J_18484_Pam_Exon 3_strategy.pdf
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