Trit1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Trit1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18498

品系全称

C57BL/6JCya-Trit1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66966-Trit1-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Trit1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18498) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tRNA isopentenyltransferase 1
基因别称
2310075G14Rik,IPPT,IPT,MOD5
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025873 | Ensembl: ENSMUST00000102649
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~1.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1914216Mice homozygous for a knock-out allele show normal blastocyst formation but exhibit embryonic lethality prior to organogenesis with no morphological primitive node or head folds present.
TRIT1,也称为tRNA isopentenyltransferase 1,是一种在人类细胞中负责tRNA修饰的酶。TRIT1编码的蛋白质负责在tRNA分子的A37残基上添加N6-异戊烯腺苷(i6A)[7]。i6A是一种在细菌和真核生物的tRNA中普遍存在的修饰碱基,它在基因表达中发挥作用,影响翻译忠实性、翻译速度、基因表达的偏斜和非义抑制。TRIT1的功能对维持正确的翻译框架至关重要,从而提高蛋白质合成的保真度和效率[4]。

TRIT1在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。例如,TRIT1在肺癌中被发现是一种潜在的肿瘤抑制因子。TRIT1基因在正常和肿瘤肺组织中编码一种复杂的mRNA变体模式,通过选择性剪接形成。全长mRNA亚型保留了tRNA-IPT的无义抑制活性,而在肺癌中,全长转录本的表达到正常肺组织的6-14倍被下调。这些发现表明,TRIT1可能是一种候选的肺癌肿瘤抑制因子[4]。

TRIT1的缺陷与多种疾病相关,包括线粒体疾病和癫痫。TRIT1的功能障碍会导致线粒体tRNA的i6A水平下降,从而影响蛋白质合成和能量代谢。这种缺陷与一系列临床表型相关,包括微头畸形、发育迟缓、癫痫等[1,2]。研究表明,TRIT1缺陷的患者可能表现出非常严重的症状,如全身性药物难治性癫痫,也可能表现出轻微的症状[2]。

TRIT1的功能与线粒体和细胞质中的tRNA-i6A37修饰有关。TRIT1编码一个氨基端线粒体靶向序列(MTS),该序列指导线粒体tRNA的修饰。TRIT1的底物特异性识别对于理解其功能和tRNA-i6A37修饰模式至关重要。研究表明,TRIT1对细胞质tRNA中的tRNATrpCCA-A37-A38表现出明确的底物特异性限制[5]。

TRIT1的功能还与tRNA基因介导的转录沉默(tgm沉默)有关。在酵母中,TRIT1的酵母同源物Mod5不仅具有tRNA修饰功能,还参与tRNA基因附近的RNA聚合酶II启动子的转录沉默。Mod5可以折叠成淀粉样纤维,赋予酵母对某些杀菌剂的抗性。研究表明,TRIT1在酵母中可以补充Mod5的tRNA修饰和tgm沉默活性,表明TRIT1也可能具有淀粉样形成的能力[3]。

TRIT1的基因多态性与肺癌患者的生存率有关。在意大利肺癌患者中,TRIT1 Phe202Leu变异的罕见Leu等位基因与较短生存率相关。然而,在挪威肺癌患者中,罕见等位基因与较高的生存率相关。这些结果表明,TRIT1基因多态性可能影响肺癌患者的生存,但功能元件可能表现出人群特异性模式[6]。

TRIT1的研究有助于深入理解tRNA修饰的生物学功能和疾病发生机制。TRIT1的缺陷与多种疾病相关,包括线粒体疾病和癫痫。TRIT1的功能与线粒体和细胞质中的tRNA-i6A37修饰有关,并可能涉及tRNA基因介导的转录沉默。TRIT1的基因多态性与肺癌患者的生存率有关。TRIT1的研究有助于为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Kernohan, Kristin D, Dyment, David A, Pupavac, Mihaela, Boycott, Kym M, Thiffault, Isabelle. 2017. Matchmaking facilitates the diagnosis of an autosomal-recessive mitochondrial disease caused by biallelic mutation of the tRNA isopentenyltransferase (TRIT1) gene. In Human mutation, 38, 511-516. doi:10.1002/humu.23196. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28185376/
2. Smol, Thomas, Brunelle, Perrine, Caumes, Roseline, Petit, Florence, Ghoumid, Jamal. 2022. TRIT1 deficiency: Two novel patients with four novel variants. In European journal of medical genetics, 65, 104603. doi:10.1016/j.ejmg.2022.104603. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36049610/
3. Waller, T J, Read, D F, Engelke, D R, Smaldino, P J. 2016. The human tRNA-modifying protein, TRIT1, forms amyloid fibers in vitro. In Gene, 612, 19-24. doi:10.1016/j.gene.2016.10.041. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27984194/
4. Spinola, Monica, Galvan, Antonella, Pignatiello, Carmen, Paroni, Rita, Dragani, Tommaso A. . Identification and functional characterization of the candidate tumor suppressor gene TRIT1 in human lung cancer. In Oncogene, 24, 5502-9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15870694/
5. Khalique, Abdul, Mattijssen, Sandy, Haddad, Alexander F, Chaudhry, Shereen, Maraia, Richard J. 2020. Targeting mitochondrial and cytosolic substrates of TRIT1 isopentenyltransferase: Specificity determinants and tRNA-i6A37 profiles. In PLoS genetics, 16, e1008330. doi:10.1371/journal.pgen.1008330. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32324744/
6. Spinola, Monica, Falvella, F Stefania, Galvan, Antonella, Haugen, Aage, Dragani, Tommaso A. 2006. Ethnic differences in frequencies of gene polymorphisms in the MYCL1 region and modulation of lung cancer patients' survival. In Lung cancer (Amsterdam, Netherlands), 55, 271-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17145094/
7. Schweizer, Ulrich, Bohleber, Simon, Fradejas-Villar, Noelia. 2017. The modified base isopentenyladenosine and its derivatives in tRNA. In RNA biology, 14, 1197-1208. doi:10.1080/15476286.2017.1294309. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28277934/