Baz2a-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Baz2a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18456

品系全称

C57BL/6JCya-Baz2aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-116848-Baz2a-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Baz2a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18456) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
bromodomain adjacent to zinc finger domain, 2A
基因别称
C030005G16Rik,Tip5,Walp3,mKIAA0314
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_054078 | Ensembl: ENSMUST00000045621
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 6~8
敲除长度
~2.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Baz2a(也称为TIP5)是一种重要的表观遗传调控因子,属于SWI/SNF染色质重塑复合体家族。Baz2a蛋白包含一个溴结构域,可以识别并结合组蛋白H3上的乙酰化赖氨酸残基,以及一个甲基-CpG结合域(MBD)样TAM结构域,该结构域可以结合DNA和RNA。Baz2a在细胞核内形成具有相分离特征的核体,这些核体依赖于RNA转录和Baz2a的非有序RNA结合TAM结构域。Baz2a的RNA结合能力与其功能密切相关,弱Baz2a-RNA相互作用(例如与新生转录本)促进Baz2a核体的形成,而强结合剂长非编码RNA(lncRNA)Malat1则损害Baz2a核体,同时介导Baz2a与染色质在核斑点上的关联[1]。Baz2a在维持基因组结构和基因表达调控中发挥着重要作用,其功能异常与多种癌症的发生发展密切相关。

Baz2a在前列腺癌中起着重要作用。在前列腺癌细胞中,Baz2a的基因组占有率与富含H3K14ac的染色质区域相一致,这种关联是通过Baz2a的溴结构域(BAZ2A-BRD)介导的,后者可以特异性结合H3K14ac。Baz2a与被H3K14ac标记的失活增强子相关联,并抑制转录在侵袭性和分化不良的前列腺癌中经常被沉默的基因。Baz2a介导的抑制还与EP300相关,后者可以乙酰化H3K14ac。Baz2A-BRD突变或抑制Baz2A-BRD/H3K14ac相互作用的抑制剂可以损害前列腺癌干细胞。此外,Baz2A-BRD的药理学失活可以损害Pten缺失的前列腺类器官的致癌转化。这些发现表明,Baz2A-BRD在前列腺癌干细胞特征中发挥作用,并提示潜在的表观遗传阅读器治疗策略,以针对Baz2a在侵袭性前列腺癌中的治疗[2]。

Baz2a还通过其RNA结合TAM结构域与RNA介导的与拓扑异构酶2A(TOP2A)和组蛋白脱甲基酶KDM1A的相互作用来抑制基因,这些基因在前列腺癌中被频繁沉默。TOP2A和KDM1A的表达与Baz2a水平呈正相关,在局部和转移性前列腺癌中。TOP2A和KDM1A的药理学抑制上调了由Baz2a抑制的基因,这些基因由Baz2a结合的无活性增强子调控,而rRNA基因则不受影响。这些发现揭示了前列腺癌中一种新的基于RNA的基因调控机制,并确定RNA介导的Baz2a与TOP2A和KDM1A之间的相互作用抑制了与前列腺癌相关的关键基因,这可能有助于分层前列腺癌风险和治疗[3]。

Baz2a还保护着基础状态多能干细胞(ESC)的基因组结构。Baz2a与SNF2H、DNA拓扑异构酶2A(TOP2A)和粘合蛋白相互作用,与活性A染色质区域的染色质亚结构域相关联,这些结构域通过长距离接触相交。Baz2a的耗尽增加了B染色质区域的染色质可及性。此外,Baz2a以TOP2A依赖性方式调节H3K27me3在基因组中的占有率。最后,基础状态ESC需要Baz2a才能进行生长、分化和正确表达发育基因。这些结果表明,开放的染色质区域具有侵入抑制性区域的趋势,这种趋势被染色质重塑所抵消,以建立基因组分区并保持细胞身份[4]。

Baz2a在肝细胞癌中的表达水平与患者的预后密切相关。Baz2a在多种肿瘤组织中表现出高水平表达,并与癌症患者的预后显著相关。Baz2a在癌症发生发展中的机制可能涉及脂质代谢。这些发现有助于扩展我们对Baz2a在肿瘤发生和发展中的作用的理解,并表明Baz2a可能成为几种癌症的预后和诊断因子[5]。

Baz2a在前列腺癌中的过度表达与疾病复发密切相关。Baz2A基因编码的因子在前列腺癌中过度表达,并具有维持前列腺癌细胞生长的特征,这是癌症细胞特有的。Baz2a调节许多蛋白质编码基因,并直接与EZH2相互作用,以维持与转移相关的基因的表观遗传沉默。Baz2A的过度表达与具有CpG岛甲基化表型(CIMP)的分子亚型紧密相关。最后,Baz2A水平高是7682名前列腺癌患者生化复发的独立预测因子。这项工作确定了一种新的表观遗传调节因子Baz2A的异常作用,它可以作为前列腺癌转移潜力的有用标记[6]。

综上所述,Baz2a是一种重要的表观遗传调控因子,在维持基因组结构和基因表达调控中发挥着重要作用。Baz2a的功能异常与多种癌症的发生发展密切相关,包括前列腺癌和肝细胞癌。Baz2a在癌症中的过度表达与疾病复发和不良预后相关,提示其可能成为癌症治疗和诊断的潜在靶点。此外,Baz2a的RNA结合能力与其功能密切相关,通过弱Baz2a-RNA相互作用和强结合剂长非编码RNA(lncRNA)Malat1的调节,Baz2a在维持基因组结构和基因表达调控中发挥着重要作用。这些发现有助于深入理解Baz2a在表观遗传调控和癌症发生发展中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Lerra, Luigi, Panatta, Martina, Bär, Dominik, Marques, Ana C, Santoro, Raffaella. 2024. An RNA-dependent and phase-separated active subnuclear compartment safeguards repressive chromatin domains. In Molecular cell, 84, 1667-1683.e10. doi:10.1016/j.molcel.2024.03.015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38599210/
2. Peña-Hernández, Rodrigo, Aprigliano, Rossana, Carina Frommel, Sandra, Bizzarro, Juliana, Santoro, Raffaella. 2021. BAZ2A-mediated repression via H3K14ac-marked enhancers promotes prostate cancer stem cells. In EMBO reports, 22, e53014. doi:10.15252/embr.202153014. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34403195/
3. Roganowicz, Marcin, Bär, Dominik, Bersaglieri, Cristiana, Aprigliano, Rossana, Santoro, Raffaella. 2023. BAZ2A-RNA mediated association with TOP2A and KDM1A represses genes implicated in prostate cancer. In Life science alliance, 6, . doi:10.26508/lsa.202301950. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37184661/
4. Dalcher, Damian, Tan, Jennifer Yihong, Bersaglieri, Cristiana, Marques, Ana Claudia, Santoro, Raffaella. 2020. BAZ2A safeguards genome architecture of ground-state pluripotent stem cells. In The EMBO journal, 39, e105606. doi:10.15252/embj.2020105606. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33433018/
5. Liu, Yan, Wang, Junli, Guo, Jimin, Li, Yufeng, Zhang, Xiaojun. 2024. Pan-cancer and multi-omics analyses revealed the diagnostic and prognostic value of BAZ2A in liver cancer. In Scientific reports, 14, 5228. doi:10.1038/s41598-024-56073-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38433277/
6. Gu, Lei, Frommel, Sandra C, Oakes, Christopher C, Plass, Christoph, Santoro, Raffaella. 2014. BAZ2A (TIP5) is involved in epigenetic alterations in prostate cancer and its overexpression predicts disease recurrence. In Nature genetics, 47, 22-30. doi:10.1038/ng.3165. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25485837/