Top2b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Top2b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18242

品系全称

C57BL/6JCya-Top2bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-21974-Top2b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Top2b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18242) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
topoisomerase (DNA) II beta
基因别称
D230016L12Rik,Top-2
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_009409 | Ensembl: ENSMUST00000017629
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~2.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:98791Homozygous null mice exhibit abnormal innervation. Offspring die shortly after birth due to respiratory failure. Conditional KO in the retina results in postnatal retinal degeneration.
DNA拓扑异构酶IIβ(TOP2B)是一种在DNA拓扑结构中发挥关键作用的酶。它通过暂时性断裂和重新连接DNA的磷酸二酯骨架,催化DNA拓扑结构的变化,从而参与调节DNA的转录过程。在哺乳动物中,存在六种DNA拓扑异构酶,其中TOP2B是其中之一。TOP2B在细胞发育和基因表达调控中发挥着重要作用,特别是在长基因的转录过程中[1]。研究已经表明,TOP2B的缺乏会影响许多发育相关基因的转录,长基因对TOP2B的缺乏尤为敏感[1]。

在转录过程中,TOP2B与其他蛋白质相互作用,共同调节基因表达。例如,与TOP2B相互作用的蛋白质包括PARP1、PRKDC、XRCC5和XRCC6等,这些蛋白质的相互作用对于核激素、生长因子和胰岛素等配体介导的转录调控至关重要[1]。此外,TOP2B还与染色体组织相关的蛋白质相互作用,如CTCF和RAD21,这些蛋白质的相互作用对于基因表达和组织特异性表达至关重要[1]。

除了在转录中的作用,TOP2B还参与DNA损伤修复和基因组稳定性维持。研究发现,TOP2B在R-loop处理和DNA环的形成中发挥重要作用。R-loop是由RNA-DNA杂交体形成的,它们可以导致DNA损伤并威胁基因组完整性。XPF是一种核酸切除修复因子,它与TOP2B相互作用,促进R-loop的处理和DNA环的形成,从而激活转录过程[2]。

此外,TOP2B的基因拷贝数变异(CNV)与生长性状有关。研究发现,TOP2B基因的CNV与羊的生长性状相关,包括体长、胸围和臀高[3]。这表明TOP2B在动物生长和发育过程中发挥着重要作用。

TOP2B的基因突变也与一些疾病相关。例如,TOP2B基因的杂合性突变与免疫缺陷、肢端和泌尿生殖器异常相关,包括Hoffman、BILU和Ablepharon-macrostomia-like综合征。这些综合征的严重程度从轻度到重度不等,形成了一种被称为TOP2B相关免疫缺陷和先天性异常谱(TICAS)的表型范围[4]。

TOP2B在DNA损伤修复中发挥重要作用。研究发现,TOP2B的催化活性与基因组的DNA损伤修复过程相关。例如,TOP2B的抑制或毒害会增加新转录的基因和增强子的转录水平,但会降低长基因的转录水平[5]。这表明TOP2B在调节基因转录和DNA损伤修复过程中发挥着重要作用。

综上所述,TOP2B是一种重要的DNA拓扑异构酶,参与调节基因表达和DNA损伤修复过程。TOP2B与多种蛋白质相互作用,共同调控基因表达和组织特异性表达。TOP2B的基因拷贝数变异与动物生长性状相关,而基因突变则与一些疾病相关。研究TOP2B的功能和机制有助于深入理解基因表达调控和DNA损伤修复的机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Austin, Caroline A, Cowell, Ian G, Khazeem, Mushtaq M, Lok, Dawn, Ng, Huei Teng. . TOP2B's contributions to transcription. In Biochemical Society transactions, 49, 2483-2493. doi:10.1042/BST20200454. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34747992/
2. Chatzinikolaou, Georgia, Stratigi, Kalliopi, Siametis, Athanasios, Altmüller, Janine, Garinis, George A. 2023. XPF interacts with TOP2B for R-loop processing and DNA looping on actively transcribed genes. In Science advances, 9, eadi2095. doi:10.1126/sciadv.adi2095. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37939182/
3. Toremurat, Zhansaya, Ibrahim, Elsaeid Elnour, Huang, Yong-Zhen, Hu, Linyong, Chen, Hong. 2020. Copy number variations of TOP2B gene are associated with growth traits in Chinese sheep breeds. In Animal biotechnology, 33, 85-89. doi:10.1080/10495398.2020.1773490. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32498592/
4. Çepni, Ece, Börklü, Esra, Avcı, Şahin, Eraslan, Serpil, Kayserili, Hülya. 2023. Revisiting TOP2B-related phenotypes: Three new cases and literature review. In Clinical genetics, 104, 251-258. doi:10.1111/cge.14341. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37068767/
5. Segev, Amir, Heady, Lance, Crewe, Morgan, Madabhushi, Ram. 2024. Mapping catalytically engaged TOP2B in neurons reveals the principles of topoisomerase action within the genome. In Cell reports, 43, 113809. doi:10.1016/j.celrep.2024.113809. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38377005/