Setx-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Setx-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18235

品系全称

C57BL/6JCya-Setxem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-269254-Setx-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Setx-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18235) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
senataxin
基因别称
A130090N03,A930037J23Rik,AOA2,Als4,SCAR1,Sen1,mKIAA0625
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_198033 | Ensembl: ENSMUST00000061578
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2443480Mice homozygous for a knock-out allele exhibit male infertility due to arrested male meiosis and reduced female fertility.
SETX,也称为Senataxin,是一种重要的RNA/DNA解旋酶。它参与转录调控和DNA损伤反应,通过解决R-loop结构来发挥作用。SETX基因的突变与两种不同的神经退行性疾病有关。SETX显性突变导致青少年型肌萎缩侧索硬化(ALS)的ALS4型,而隐性突变则导致共济失调,称为共济失调伴眼运动失用症2型(AOA2)[1]。SETX的N末端与RNA聚合酶II相互作用,而其C末端参与解旋酶活性。SETX在转录调控、终止和R-loop的解决中发挥着重要作用,通过与泛素蛋白连接酶SAN1和核糖核酸酶H(RNase H)等酶的招募和相互作用来实现。SETX还参与DNA损伤反应(DDR),主要与外切体亚基Rrp45相互作用。SETX突变,如E1597K、L389S和R2136H,对蛋白质结构和功能产生负面影响,导致野生型功能的破坏、运动神经元(MN)的退化和ALS临床症状的出现[2]。

SETX在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。在动脉粥样硬化中,SETX通过NF-κB/IL-6信号通路介导巨噬细胞的炎症反应,促进动脉粥样硬化斑块的形成[3]。在糖尿病心肌病中,SETX通过下调lncRNA TINCR抑制焦亡和糖尿病心肌病的发生[4]。在结直肠癌中,SETX通过m6A修饰抑制SOX4 mRNA的表达,从而抑制肿瘤的转移[5]。此外,SETX的基因多态性与中国儿童Wilms瘤的易感性降低相关[6]。

在共济失调伴眼运动失用症2型(AOA2)中,SETX突变导致早期发病、进行性小脑共济失调、周围神经病变、眼运动失用和血清α-甲胎蛋白(AFP)升高。AOA2的临床特征包括小脑共济失调(100%)、周围神经病变(94.6%)、小脑萎缩(95.3%)和血清AFP浓度升高(92.0%)。SETX突变主要包括错义突变、移码突变和无义突变。SETX在AOA2中的突变导致蛋白质的损害性改变,并与疾病的发生和发展密切相关[7]。

SETX还在自噬调节中发挥作用。SETX的缺失抑制自噬的进展,导致泛素化蛋白的积累、清除蛋白质聚集体的能力下降以及线粒体缺陷。AOA2患者成纤维细胞的分析也揭示了自噬通路的紊乱。SETX在自噬调节中的作用可能对AOA2的治疗有重要意义[8]。

综上所述,SETX是一种重要的RNA/DNA解旋酶,参与转录调控和DNA损伤反应。SETX基因的突变与ALS4和AOA2两种神经退行性疾病有关。SETX在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。SETX的研究有助于深入理解RNA/DNA解旋酶的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Crossley, Magdalena P, Song, Chenlin, Bocek, Michael J, Abu-Remaileh, Monther, Cimprich, Karlene A. 2022. R-loop-derived cytoplasmic RNA-DNA hybrids activate an immune response. In Nature, 613, 187-194. doi:10.1038/s41586-022-05545-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36544021/
2. Campisi, Laura, Chizari, Shahab, Ho, Jessica S Y, La Spada, Albert R, Marazzi, Ivan. 2022. Clonally expanded CD8 T cells characterize amyotrophic lateral sclerosis-4. In Nature, 606, 945-952. doi:10.1038/s41586-022-04844-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35732742/
3. Chen, Shuaishuai, Du, Juping, Jiang, Huihua, Shen, Bo, Zhou, Yuanlin. 2022. Ataxia with oculomotor apraxia type 2 caused by a novel homozygous mutation in SETX gene, and literature review. In Frontiers in molecular neuroscience, 15, 1019974. doi:10.3389/fnmol.2022.1019974. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36438189/
4. Richard, Patricia, Feng, Shuang, Tsai, Yueh-Lin, Tian, Bin, Manley, James L. 2020. SETX (senataxin), the helicase mutated in AOA2 and ALS4, functions in autophagy regulation. In Autophagy, 17, 1889-1906. doi:10.1080/15548627.2020.1796292. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32686621/
5. Megarbane, Andre, Bizzari, Sami, Deepthi, Asha, Delague, Valérie, Urtizberea, J Andoni. . A 20-year Clinical and Genetic Neuromuscular Cohort Analysis in Lebanon: An International Effort. In Journal of neuromuscular diseases, 9, 193-210. doi:10.3233/JND-210652. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34602496/
6. Ma, Limin, Shi, Yingying, Chen, Zhongcan, Li, Shujian, Zhang, Jiewen. 2018. A novel SETX gene mutation associated with Juvenile amyotrophic lateral sclerosis. In Brain and behavior, 8, e01066. doi:10.1002/brb3.1066. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30052327/
7. Crossley, Magdalena P, Brickner, Joshua R, Song, Chenlin, Tsai, Miaw-Sheue, Cimprich, Karlene A. 2021. Catalytically inactive, purified RNase H1: A specific and sensitive probe for RNA-DNA hybrid imaging. In The Journal of cell biology, 220, . doi:10.1083/jcb.202101092. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34232287/
8. Jurga, Mateusz, Abugable, Arwa A, Goldman, Alastair S H, El-Khamisy, Sherif F. 2021. USP11 controls R-loops by regulating senataxin proteostasis. In Nature communications, 12, 5156. doi:10.1038/s41467-021-25459-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34526504/