Scaf11-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Scaf11-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18170

品系全称

C57BL/6JCya-Scaf11em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-72193-Scaf11-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Scaf11-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18170) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SR-related CTD-associated factor 11
基因别称
1110061H03Rik,2610510E10Rik,CASP11,SIP1,SRRP129,Sfrs2ip,Srsf2ip,mKIAA3013
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028148 | Ensembl: ENSMUST00000047835
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 7~9
敲除长度
~2.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Scaf11,全称为SR-related CTD associated factor 11,是一种与SR蛋白相关的C端结构域相关因子。SR蛋白是一类RNA剪接因子,参与前体mRNA的剪接和加工。Scaf11作为SR蛋白复合物的一部分,可能在调节RNA剪接、RNA稳定性和蛋白质翻译后修饰等方面发挥重要作用。Scaf11的表达和功能可能受到多种因素的调控,包括细胞类型、发育阶段、疾病状态等。

在儿童1型糖尿病(T1D)的研究中,Scaf11被确定为下调最显著的基因之一[1]。研究发现,与正常对照组相比,T1D患儿中Scaf11的表达水平显著降低。此外,Scaf11还与其他T1D相关基因共同构成了一个蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和转录因子(TF)-靶点网络。这些研究结果提示Scaf11可能在T1D的发病机制中发挥重要作用,并可能作为T1D的潜在诊断标志物。

在子宫内膜异位症的研究中,Scaf11被确定为与子宫内膜异位症高度相关的基因模块中的枢纽基因之一[2]。研究发现,Scaf11与其他三个基因(KRAS、MDM2和KIF3A)共同构成了一个与子宫内膜异位症高度相关的基因模块。进一步的分析表明,这个基因模块中的基因主要参与泛素介导的蛋白质降解途径。Scaf11与Jab1的相关性分析也表明,Scaf11可能与Jab1协同作用,调节子宫内膜细胞周期,影响子宫内膜异位症的发生发展。

在乳腺癌的研究中,Scaf11被确定为与乳腺癌免疫反应相关的基因之一[3]。研究发现,Scaf11的表达与多种肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)相关,包括T中央记忆细胞(Tcm)和2型辅助性T细胞(Th2)等。功能富集分析表明,Scaf11共表达基因主要参与炎症和免疫相关信号通路,如氧化磷酸化、抗菌体液反应和免疫球蛋白复合物。此外,Scaf11的表达与多种免疫检查点相关,包括PD-L1、B7H3和PDCD1LG2等。这些结果表明,Scaf11可能在乳腺癌的免疫微环境中发挥重要作用,并可能作为乳腺癌的潜在诊断和预后标志物。

在肝细胞癌(HCC)的研究中,Scaf11被确定为与HCC预后相关的基因之一[4]。研究发现,Scaf11的表达与HCC患者的总生存期(OS)相关。抑制Scaf11的表达可以抑制肝癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并诱导细胞凋亡。此外,Scaf11还与多种免疫检查点相关,提示Scaf11可能在HCC的免疫治疗中发挥重要作用。

在孤立性高身材的研究中,Scaf11被发现与身高相关[5]。研究发现,Scaf11与其他两个基因(IFT140和NAV2)共同与身高显著相关。功能富集分析表明,IFT140、NAV2和SCAF11与之前与高身材相关的基因存在功能连接。这些结果表明,Scaf11可能在骨骼生长的调节中发挥重要作用。

综上所述,Scaf11在多种疾病和生物学过程中发挥重要作用。Scaf11的表达和功能可能受到多种因素的调控,包括细胞类型、发育阶段、疾病状态等。Scaf11的研究有助于深入理解RNA剪接、RNA稳定性和蛋白质翻译后修饰等生物学过程,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。此外,Scaf11还可能作为多种疾病的潜在诊断和预后标志物,具有重要的临床应用价值。

参考文献:
1. Qian, Liwei, Shi, Honglei, Ding, Meili. 2019. Comparative analysis of gene expression profiles in children with type 1 diabetes mellitus. In Molecular medicine reports, 19, 3989-4000. doi:10.3892/mmr.2019.10099. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30942443/
2. Li, Bohan, Wang, Sha, Duan, Hua, Wang, Yiyi, Guo, Zhengchen. 2020. Discovery of gene module acting on ubiquitin-mediated proteolysis pathway by co-expression network analysis for endometriosis. In Reproductive biomedicine online, 42, 429-441. doi:10.1016/j.rbmo.2020.10.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33189575/
3. Chu, Ling, Yi, Qiaoli, Yan, Yuanliang, Liu, Ying, Xu, Zhijie. 2022. A Prognostic Signature Consisting of Pyroptosis-Related Genes and SCAF11 for Predicting Immune Response in Breast Cancer. In Frontiers in medicine, 9, 882763. doi:10.3389/fmed.2022.882763. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35646948/
4. Li, Huihui, Li, Tang, Zhang, Xiaohua. 2022. Identification of a Pyroptosis-Related Prognostic Signature Combined With Experiments in Hepatocellular Carcinoma. In Frontiers in molecular biosciences, 9, 822503. doi:10.3389/fmolb.2022.822503. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35309514/
5. Weiss, Birgit, Ott, Tim, Vick, Philipp, Wit, Jan M, Rappold, Gudrun A. 2023. Identification of novel genes including NAV2 associated with isolated tall stature. In Frontiers in endocrinology, 14, 1258313. doi:10.3389/fendo.2023.1258313. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38152138/