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Phf5a-KO 基因敲除小鼠

Phf5a-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Phf5a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-18040

品系全称

C57BL/6JCya-Phf5aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-68479-Phf5a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Phf5a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-18040) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
PHD finger protein 5A
基因别称
1110007B08Rik
染色体号
Chr 15 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_026737 | Ensembl: ENSMUST00000023117
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1.5 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2156864Mice homozygous for a transgenic gene disruption may exhibit embryonic lethality at E6. Mice with loss of expression in B cells show defective early B cell development.
更多信息
PHF5A（PHD-finger domain protein 5A）是一种高度保守的蛋白，包含110个氨基酸，属于PHD锌指蛋白家族，在从酵母到人类的整个真核细胞核中广泛表达。PHF5A是SF3B剪接复合体的重要组成部分，参与调节蛋白质-蛋白质或蛋白质-DNA的相互作用，尤其是在前mRNA剪接过程中发挥着关键作用。除了其基本的剪接体相关属性，包括调节特定基因的选择性剪接外，PHF5A还在细胞周期调控、细胞形态发生及其向特定组织/器官的分化、DNA损伤修复、维持多能性胚胎干细胞（CSCs）胚胎发生和调节染色质介导的转录中发挥着重要作用。

在肿瘤的发生和发展中，PHF5A被证明是一个重要的致癌蛋白。它通过激活下游信号通路，参与肿瘤的发生，如通过调节目标基因的异常剪接或异常选择性剪接。此外，PHF5A在调节癌症干细胞生长中也起着重要作用。因此，PHF5A被认为是癌症管理/治疗的潜在治疗靶点。

在结肠癌中，PHF5A的K29位点在多种细胞应激下可被乙酰化，并依赖于p300。PHF5A的乙酰化增强了U2 snRNPs之间的相互作用，影响了全球前mRNA剪接模式和广泛的基因表达。PHF5A过度乙酰化诱导的选择性剪接稳定了KDM3A mRNA，并促进了其蛋白质表达。在病理学上，PHF5A K29过度乙酰化和KDM3A上调轴与结肠癌的不良预后相关[1]。这些发现揭示了一种抗应激途径的机制，通过PHF5A的乙酰化促进癌细胞对压力的抵抗能力，从而有助于结肠癌的发生。

在食管鳞状细胞癌（ESCC）中，PHF5A的表达水平显著高于正常组织，并且与ESCC的不良预后相关。PHF5A的沉默显著抑制了细胞的增殖、迁移，并诱导了凋亡以及细胞周期的停滞。在体内实验中，PHF5A的缺乏能够抑制肿瘤的生长。分子研究表明，PHF5A沉默通过与其相互作用蛋白MDM2促进VEGFA的泛素化，从而调节VEGFA的蛋白质表达。因此，PHF5A是ESCC中的肿瘤促进因子，依赖于VEGFA和PI3K/AKT信号通路。PHF5A可能成为ESCC治疗的潜在治疗靶点[3]。

在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中，PHF5A是TCGA HNSCC样本中高度表达的DOCK5变体的最上调剪接体基因之一。PHF5A的敲低或过表达相应地改变了HNSCC细胞中DOCK5变体的水平。PHF5A在肿瘤细胞和组织中高度表达，并与HNSCC的不良预后相关。功能丧失和功能获得实验表明，PHF5A能够促进HNSCC细胞在体外和体内的增殖、迁移和侵袭。此外，PHF5A抑制逆转了DOCK5变体在HNSCC中的致癌作用。PHF5A通过p38 MAPK激活调节DOCK5的选择性剪接，从而促进HNSCC的进展，这为HNSCC患者提供了潜在的治疗意义[2]。

PHF5A的突变与发育障碍有关，包括前耳赘生物和尿道下裂、生长异常和发育迟缓。在PHF5A功能丧失变异的纤维母细胞中，野生型和变异型PHF5A mRNA的水平正常。转录组测序揭示了选择性启动子使用和下调的与细胞周期调节相关的基因。患者和对照纤维母细胞中PHF5A的水平与预测的野生型分子量相似，SF3B1-3和SF3B6的水平也相似。SF3B复合体的形成在2个患者细胞系中未受影响。这些数据表明，在PHF5A功能丧失变异的纤维母细胞中，存在反馈机制以维持SF3B成分的正常水平。这些在PHF5A或SF3B4功能丧失变异的纤维母细胞中的代偿机制表明，在胚胎发育期间，在特定的细胞类型（即神经嵴细胞）中，存在对突变剪接因子基因的自动调节紊乱，而不是半合子不足作为发病机制[4]。

综上所述，PHF5A是一种重要的剪接因子，参与调节选择性剪接和广泛的生物学过程。PHF5A在肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用，被认为是癌症管理/治疗的潜在治疗靶点。PHF5A的研究有助于深入理解选择性剪接的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Wang, Zhe, Yang, Xin, Liu, Cheng, Gu, Wei, Luo, Jianyuan. 2019. Acetylation of PHF5A Modulates Stress Responses and Colorectal Carcinogenesis through Alternative Splicing-Mediated Upregulation of KDM3A. In Molecular cell, 74, 1250-1263.e6. doi:10.1016/j.molcel.2019.04.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31054974/
2. Liu, Chao, Li, Guo, Zheng, Siyuan, Liu, Yong, Qiu, Yuanzheng. 2023. PHF5A regulates the expression of the DOCK5 variant to promote HNSCC progression through p38 MAPK activation. In Biology direct, 18, 39. doi:10.1186/s13062-023-00396-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37434235/
3. Chang, Zhiwei, Jia, Yongxu, Gao, Ming, Li, Jing, Qin, Yanru. 2024. PHF5A promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via stabilizing VEGFA. In Biology direct, 19, 19. doi:10.1186/s13062-023-00440-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38429756/
4. Harms, Frederike L, Dingemans, Alexander J M, Hempel, Maja, de Vries, Bert B A, Kutsche, Kerstin. 2023. De novo PHF5A variants are associated with craniofacial abnormalities, developmental delay, and hypospadias. In Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics, 25, 100927. doi:10.1016/j.gim.2023.100927. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37422718/

资料下载

S-KO-18040_6J_68479_Phf5a_Exon 3_strategy.pdf
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